New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6099117 = | 34 (0.680) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 9.5% | intergenic (‑29/‑60) | PP_5350/zwf | RpiR family transcriptional regulator/glucose 6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
? | NC_002947 | 6099162 = | 25 (0.520) | intergenic (‑74/‑15) | PP_5350/zwf | RpiR family transcriptional regulator/glucose 6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
CACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGCCCGTCTGAACCCTGCCGTG > NC_002947/6099014‑6099305 | caCGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGc > 5:69678/1‑149 (MQ=255) gccggaagcaatttgtgcagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGccc > 3:234153‑M1/102‑149 (MQ=255) ggCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑Taa > 4:202180/1‑148 (MQ=255) cTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAaacgaac > 3:115990/1‑149 (MQ=255) tttCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAaacgaacg > 7:11047/1‑149 (MQ=255) tttCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAaacgaacg > 6:161873/1‑149 (MQ=255) cagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGcc < 5:5373‑M1/47‑1 (MQ=255) cagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGcc > 6:5373‑M1/85‑131 (MQ=255) cagcaAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGa < 4:115990/149‑1 (MQ=255) agcaAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGAc < 6:69678/149‑1 (MQ=255) tGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGa > 5:16091/1‑142 (MQ=255) tGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGa < 6:16091/142‑1 (MQ=255) gcgATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGc < 5:161873/149‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCtt < 2:16142/140‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCtt > 1:16142/1‑140 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTc > 6:223295/1‑149 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTc > 4:43856/1‑149 (MQ=255) ttCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCACAGT‑TAAAAGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGAGATTCTGGTCTTCggcggctacgg > 3:59579/1‑144 (MQ=255) ggACTCGTTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGGGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGcc < 3:202180/149‑1 (MQ=255) ggACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTATGGTCTTCGTCGGCACAGGTGATCTGGc > 4:31557/1‑148 (MQ=255) gACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGccc < 8:11047/149‑1 (MQ=255) tCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTTGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTg > 5:318212/1‑148 (MQ=255) ggTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGca > 6:283035/1‑148 (MQ=255) ggCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTc < 5:223295/149‑1 (MQ=255) gggcgggttggcgtccatgtagtataactacaagaaagctacaacccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGgc > 3:234153‑M2/49‑149 (MQ=255) ggcgggttggcgtccatgtagtataactacaagaaagctacaacccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTg > 6:5373‑M2/48‑131 (MQ=255) ggcgggttggcgtccatgtagtataactacaagaaagctacaacccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTg < 5:5373‑M2/84‑1 (MQ=255) ccGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGTATAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGgcg > 1:79729/1‑149 (MQ=255) GGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCgg > 5:237705‑M1/1‑144 (MQ=255) GGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCgg < 6:237705‑M1/144‑1 (MQ=255) gCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACACGCCCTGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGAGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCt < 6:306609/149‑1 (MQ=255) gTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTcgc > 3:60009/1‑148 (MQ=255) aGTTATACTACATTGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTTATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGa < 3:31557/148‑1 (MQ=255) cATGGACGACAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGCTTTGACTATTCCTTGCGACATACTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCt > 5:315942/1‑93 (MQ=255) gCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGCCCGTCTGAACCCTGc > 4:184027/1‑149 (MQ=255) ccAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACAGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACGACCTTTTTCGCGAGGACCGTCTGAACCCTGcc > 7:298851/1‑149 (MQ=255) caacccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGCCCGTCTGAACCCTGCCg > 1:5447‑M2/8‑149 (MQ=255) aacccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTg > 3:17073‑M2/7‑79 (MQ=255) aacccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTg < 4:17073‑M2/73‑1 (MQ=255) acccgCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGTCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGCCCGTCTGAACCCTGCCGTg < 4:60009‑M2/144‑1 (MQ=255) gCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGcc < 2:197540‑M2/126‑1 (MQ=255) gCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGcc > 1:197540‑M2/2‑127 (MQ=255) | CACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCGCTCTACCACCTGTTTCGCGAGGCCCGTCTGAACCCTGCCGTG > NC_002947/6099014‑6099305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |