New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1543781 | 34 (0.680) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 8.5% | coding (585/1245 nt) | mdfA | multidrug MFS transporter |
? | NC_002947 | = 1543810 | 32 (0.670) | coding (614/1245 nt) | mdfA | multidrug MFS transporter |
CTGGTGGGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCA > NC_002947/1543662‑1543954 | cTGGTGGGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGtt < 6:18789/149‑1 (MQ=255) gtggGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcac < 3:129643‑M2/149‑4 (MQ=255) ggCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgc > 8:57990‑M2/1‑143 (MQ=255) gCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCg < 5:55677/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGAtt > 6:86983/1‑148 (MQ=255) gctgctgcAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCa < 5:170792/147‑1 (MQ=255) gcAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGTCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCtgctgc > 1:184881/1‑149 (MQ=255) tGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACt > 8:230658/1‑149 (MQ=255) cTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGtt < 3:266522/149‑1 (MQ=255) gctggctgTTCGTGGCATTCGTCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTAt < 2:184881/149‑1 (MQ=255) gTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCt > 4:144172/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCa < 7:230658/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCtgctgc < 1:222512/104‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCtgctgc > 2:222512/1‑104 (MQ=255) gcgGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATg > 8:73894/1‑121 (MQ=255) gcgGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATg < 7:73894/121‑1 (MQ=255) ggTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTg > 4:303829/1‑149 (MQ=255) tGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTgca < 5:86983/149‑1 (MQ=255) ctgctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCt > 1:116089/1‑149 (MQ=255) ctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCtt < 2:116089/147‑1 (MQ=255) tgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTggg > 1:226743/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCg > 3:173402/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGAt < 3:239726/148‑1 (MQ=255) tGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg < 8:116341/136‑1 (MQ=255) tGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg > 7:116341/1‑136 (MQ=255) gCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGc > 6:32698/1‑149 (MQ=255) ccGGAAACCCTGGGCGGGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGcc < 3:124400/149‑1 (MQ=255) gAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCt < 4:173402/149‑1 (MQ=255) gAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCt > 6:330012/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTc > 5:273124/1‑103 (MQ=255) ccTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTc < 6:273124/103‑1 (MQ=255) gCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgccagtccagccattgcagcagcaaggtgcc < 8:175130‑M2/148‑115 (MQ=255) cGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGa > 1:41696/1‑149 (MQ=255) cGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGa < 5:330012/149‑1 (MQ=255) aGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgc > 4:167391‑M2/1‑28 (MQ=255) aGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTcacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcagccaggtcagcaccgcgccgatggcgaatgccacgaacagccagcgc < 3:167391‑M2/113‑86 (MQ=255) ccGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGt > 6:76582/1‑149 (MQ=255) ggCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGt > 2:305165/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGATGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTCGGCAACCGCCGCTTCGTTTCAGGCAGCGCCGCCCTTGGCATGGTCGGATTGCCTCTGATTGGCTGCATTGTACTGTCCCCGCtg > 6:60948/1‑147 (MQ=255) gcgGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGtgctgc > 3:72289/1‑149 (MQ=255) gCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCa < 5:32698/149‑1 (MQ=255) | CTGGTGGGCACCTTGCTGCTGCAATGGCTGGACTGGCGCTGGCTGTTCGTGGCATTCGCCATCGGCGCGGTGCTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCA > NC_002947/1543662‑1543954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |