New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2807533 = | 41 (0.810) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.9% | coding (907/969 nt) | Nuh | ribonucleoside hydrolase |
? | NC_002947 | 2807569 = | 42 (0.880) | coding (943/969 nt) coding (211/213 nt) |
Nuh PP_2461 |
ribonucleoside hydrolase hypothetical protein |
CAGCGGCCGGCGTATCCACATGAGCATCGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCT > NC_002947/2807421‑2807716 | atcgacctgttggtgcgcgacaacggtgccgaggcggcacgcagcttcatcgaccaggtgttcgagcgctacgcgccgcacgcggctattccaatcgcgccagacgggcactGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCa > 3:118372‑M1/113‑149 (MQ=255) cGTATCCACATGAGCATCGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCTGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCt > 2:239773/1‑149 (MQ=255) cacaTGAGCATCGACAGCCGCGAAGGACACACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGAACGGTGAGCTCAAGCGGACGGCGAATCTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTACGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGgcgc > 4:106384/1‑148 (MQ=255) caTGAGCATCGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGAt < 7:266000/149‑1 (MQ=255) caTGAGCATCGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGAt > 8:104076/1‑149 (MQ=255) cATCGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGaa > 6:66076/1‑148 (MQ=255) cGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATTGc > 4:228789/1‑149 (MQ=255) cgaggcggcacgcagcttcatcgaccaggtgttcgagcgctacgcgccgcacgcggctattccaatcgcgccagacgggcactGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGc > 7:194869‑M1/84‑124 (MQ=255) cgaggcggcacgcagcttcatcgaccaggtgttcgagcgctacgcgccgcacgcggctattccaatcgcgccagacgggcactGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGc < 8:194869‑M1/41‑1 (MQ=255) ccAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCTGACTGGTACGGGGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCcg < 2:292306/148‑1 (MQ=255) aCAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGATCTCAAGCGGACCGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGTCTGTTCGACCTGCTCAGAGCCCGTCTGGCGCTATTGGAATAGAcg > 8:59072/1‑149 (MQ=255) gCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATTGCCGCGt < 3:228789/149‑1 (MQ=255) gcgAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGt < 7:287038/122‑1 (MQ=255) gcgAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGt > 8:287038/1‑122 (MQ=255) cccACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAg > 2:16608/1‑149 (MQ=255) ccACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAgc < 8:138248/149‑1 (MQ=255) aCTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAgcgc > 3:279422/1‑149 (MQ=255) tttCGGCCAGCCAATTGCCGCCTGGTACGGGGGGCTCAAGCGGGCGGCGAATGGGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGgcg < 3:127436/115‑1 (MQ=255) ggCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCGCCAGCGGCCGGCGAATGTGCTGGGGGTGGAGCAGGGTGCTGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGaa < 3:243457/148‑1 (MQ=255) gACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTg < 5:66076/149‑1 (MQ=255) aCAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTgg < 1:16608/149‑1 (MQ=255) aCAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCACGAACACCTgg > 5:18609/1‑149 (MQ=255) gTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGaa < 3:203150/128‑1 (MQ=255) gTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGaa > 4:203150/1‑128 (MQ=255) tACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCTCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGt > 1:156373/1‑149 (MQ=255) aCGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCAGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCTTGCGGCGAGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATTAAGCTGCGTg > 7:112930/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTc < 7:104076/148‑1 (MQ=255) tCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCgg > 1:13518/1‑149 (MQ=255) aaGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCgg < 4:279422/147‑1 (MQ=255) aGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCAc < 1:208062/149‑1 (MQ=255) ggccggcGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGt > 5:159097/1‑149 (MQ=255) gccggcGAATGTGCTGTGGGTGGAGCTGGGTGATGCGCAGGGGCTGTTCGTCCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGGGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGtt < 7:59072/149‑1 (MQ=255) acggcGAATGTGGTGTGGGTGGAGGAGGGTGATGCGCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTGGGCACCGTTg < 3:106384/148‑1 (MQ=255) cggcGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGt > 8:236348/1‑149 (MQ=255) ggcGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTc < 4:173932/104‑1 (MQ=255) gcGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATTCTCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTcg < 2:156373/149‑1 (MQ=255) aaTGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCgcgc < 2:111204/149‑1 (MQ=255) gggtggAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGt > 2:152739/1‑149 (MQ=255) gcactgagcaggtcgaacagcccctgggcatcaccctgctcAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCg < 8:194869‑M2/83‑1 (MQ=255) gcactgagcaggtcgaacagcccctgggcatcaccctgctcAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCg > 7:194869‑M2/42‑124 (MQ=255) tggAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACTCCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGACTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGa > 7:282886/1‑149 (MQ=255) tggAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGa > 8:157040/1‑149 (MQ=255) tggAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGa > 8:161598/1‑149 (MQ=255) tgagcaggtcgaacagcccctgggcatcaccctgctcAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGAt > 3:118372‑M2/38‑149 (MQ=255) ggAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGAt > 8:87311/1‑149 (MQ=255) ggAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGAt > 4:51350/1‑149 (MQ=255) GAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTc < 2:317848‑M1/118‑1 (MQ=255) GAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTc > 1:317848‑M1/1‑118 (MQ=255) AGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATgg > 1:239773‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGAt < 4:228589‑M1/145‑1 (MQ=255) CAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGAt > 3:228589‑M1/1‑145 (MQ=255) gTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATca < 3:51350/149‑1 (MQ=255) ccAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCaa < 7:236348/149‑1 (MQ=255) ctgctcAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGc > 5:285991‑M2/7‑147 (MQ=255) ctcAGTGCCCGTCTTGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAggg < 8:112930‑M2/146‑1 (MQ=255) ctcAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAg < 4:118372‑M2/144‑1 (MQ=255) aGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCt < 2:13518/148‑1 (MQ=255) | CAGCGGCCGGCGTATCCACATGAGCATCGACAGCCGCGAAGGACCCACTTTCGGCCAGACAATTGCAGACTGGTACGGTGTGCTCAAGCGGCCGGCGAATGTGCTGTGGGTGGAGCAGGGTGATGCCCAGGGGCTGTTCGACCTGCTCAGTGCCCGTCTGGCGCGATTGGAATAGCCGCGTGCGGCGCGTAGCGCTCGAACACCTGGTCGATGAAGCTGCGTGCCGCCTCGGCACCGTTGTCGCGCACCAACAGGTCGATGGCGATCAGCAGCAACTCTTCCGGTGTGCCAGGGCT > NC_002947/2807421‑2807716 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |