New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3042377 | 41 (0.810) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.1% | coding (280/315 nt) | PP_5537 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 3042402 | 51 (1.050) | coding (305/315 nt) | PP_5537 | membrane protein |
CGGGCTGGCCGGTTGCTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCGGAGGACGCTGCCGTGTTC > NC_002947/3042256‑3042543 | cGGGCTGGCCGGTTGCTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGc < 6:7858‑M2/148‑2 (MQ=255) cGGGCTGGCCGGTTGCTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACAGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGCCCAGCGGCGTTGACGAGGGGCGc < 6:187591‑M2/148‑2 (MQ=255) ggCCGGTTGCTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCAt < 3:70918/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAg > 4:124307/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGc > 1:226401/1‑149 (MQ=255) ggTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTg > 3:14589/1‑147 (MQ=255) tGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAgg > 5:78321/1‑149 (MQ=255) gaCAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTAt < 1:278328/149‑1 (MQ=255) cGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑tg > 4:60214/1‑149 (MQ=255) gCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑tgt < 4:232366/149‑1 (MQ=255) aTGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑tgtgt < 5:57529/149‑1 (MQ=255) agagCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTgtggtggtg < 8:277383/149‑1 (MQ=255) agagCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTgtggtggtg > 7:277383/1‑149 (MQ=255) gagCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGc > 3:227373/1‑149 (MQ=255) ccGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGt > 2:211137/1‑149 (MQ=255) gggATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTc > 8:59855/1‑149 (MQ=255) gATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCt < 2:226401/149‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCaa < 3:124307/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCTTACCTGCTGCTGGCCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGAc > 8:249836/1‑149 (MQ=255) ttACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGt > 6:313114/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGttt < 3:60214/148‑1 (MQ=255) ctgctgctgACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTcc > 2:172433/1‑149 (MQ=255) tgACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑tgtgtgt > 3:194264/1‑108 (MQ=255) tgACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑tgtgtgt < 4:194264/108‑1 (MQ=255) aCCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCa < 5:7858/148‑1 (MQ=255) cgtcgtGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAggg > 7:283488/1‑149 (MQ=255) gtTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTgtggtg < 1:306876/102‑1 (MQ=255) gtTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTgtggtg > 2:306876/1‑102 (MQ=255) gtTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCa < 1:143079/115‑1 (MQ=255) gtTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCa > 2:143079/1‑115 (MQ=255) ttCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCAc < 5:313114/149‑1 (MQ=255) cGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCAcc < 7:59855/148‑1 (MQ=255) tttCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGtt > 4:160491/1‑149 (MQ=255) gCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTgcg < 8:283488/149‑1 (MQ=255) gCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTACCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTgc < 1:211137/148‑1 (MQ=255) tGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCt > 2:142149/1‑149 (MQ=255) gggCGGTTGCTGTACCTGGTGTCCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGTGCAGTGCCTTGCAGGGCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTtc < 5:174571/149‑1 (MQ=255) gggCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTtc > 8:246920/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCt < 4:266762/110‑1 (MQ=255) gCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCt > 3:266762/1‑110 (MQ=255) tGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGt < 8:63794/130‑1 (MQ=255) tGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGt > 7:63794/1‑130 (MQ=255) ccTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGccaggtacagcaacggccccagcgaaacgaacacgacggtcagcagcaggtaaggcagcaccgcgatcccggctctgccgcgcatgcggttgtctcgcacc < 4:247725‑M2/131‑102 (MQ=255) ccTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGccaggtacagcaacggccccagcgaaacgaacacgacggtcagcagcaggtaaggcagcaccgcgatcccggctctgccgcgcatgcggttgtctcgcacc > 3:247725‑M2/1‑30 (MQ=255) tGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGccaggtacagcaacggccccagcgaaacgaacacgacggtcagcagcaggtaaggcagcaccgcgatcccggctctgccgcgcatgcggttgtc > 5:267000‑M2/1‑28 (MQ=255) tGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGccaggtacagcaacggccccagcgaaacgaacacgacggtcagcagcaggtaaggcagcaccgcgatcccggctctgccgcgcatgcggttgtc < 6:267000‑M2/122‑95 (MQ=255) gACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCg > 8:189913/1‑147 (MQ=255) gACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCg > 7:251864/1‑147 (MQ=255) aCCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCggag < 1:172433/149‑1 (MQ=255) aCCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCgga < 5:160360/148‑1 (MQ=255) cAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCggagga > 7:205532/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGCGTTTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTACCTGGTTACCTGCTAACAGGGCTATAACCGTTTGCGATTCGTGGCTTTACCCAACCCGCAGGACGCt > 1:242246/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCGGAGGACGCTg < 7:246920/149‑1 (MQ=255) ccGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCt > 2:209514/1‑86 (MQ=255) ccGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCt < 1:209514/86‑1 (MQ=255) cGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCGGAGGACGCTGCCgtgt > 8:89174/1‑148 (MQ=255) gAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCGGAGGACGCTGCCGTGTTc < 7:189913/149‑1 (MQ=255) gAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCGGAGGACGCTGCCGTGTTc < 8:251864/149‑1 (MQ=255) | CGGGCTGGCCGGTTGCTGGATGGTGCGAGACAACCGCATGCGCGGCAGAGCCGGGATCGCGGTGCTGCCTTACCTGCTGCTGACCGTCGTGTTCGTTTCGCTGGGGCCGTTGCTGTACCTGGTGACCAGAGGCGTTGCCGAGGGGCGCCAGCCATGAGCAGTGCCTTGCAGGCCTATGCGC‑TGTGTGTGGTGGTGCTGTTCCTCAAGACGTTCCTGGTTTCCTGCTATCAGGGCTATCACCGTTTGCGCTTCGTCGCGTTCACCAACCCGGAGGACGCTGCCGTGTTC > NC_002947/3042256‑3042543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |