New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3400726 | 33 (0.660) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 8.4% | coding (475/528 nt) | PP_3007 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3400778 | 34 (0.710) | coding (423/528 nt) | PP_3007 | hypothetical protein |
GATCATCACTCGCAGGGCGTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGCCATCCTTGGCCTGC > NC_002947/3400638‑3400925 | gATCATCACTCGCAGGGCGTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGgcg > 7:109412/1‑149 (MQ=255) catcaCTTGCAGGGCGTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTg > 6:167642/1‑149 (MQ=255) caCTCGCAGGGCGTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGat > 3:6716/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCGCCCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGAtata < 1:167969/148‑1 (MQ=255) gTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGAcccc > 2:278048/1‑149 (MQ=255) ggTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGc < 2:51985/149‑1 (MQ=255) gggTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATgg < 7:258381/149‑1 (MQ=255) tGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGgcgc < 1:278048/149‑1 (MQ=255) tCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGc < 5:6138/125‑1 (MQ=255) tCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGc > 6:6138/1‑125 (MQ=255) acaTAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTGTCGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTg > 1:233286/1‑145 (MQ=255) acaTAGGCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTg < 2:233286/144‑1 (MQ=255) caTAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCtt > 8:197750/1‑148 (MQ=255) caTAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCtt < 7:197750/148‑1 (MQ=255) tAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGAc < 8:109412/149‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAg > 8:112375/1‑149 (MQ=255) ccTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGAc < 5:51181/142‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGa < 4:6716/149‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACCGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGAc > 6:51181/1‑142 (MQ=255) gTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAgg < 5:167642/149‑1 (MQ=255) aCTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAggg > 6:59967/1‑148 (MQ=255) cTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAgggg < 7:112375/148‑1 (MQ=255) cctgcctgGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCt > 4:254361/1‑149 (MQ=255) tgcctgGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAgccaggcaggtcgtccagtaccaggctgactatgtgttctggacagccaagtgacacgcacccgaccctacgccctgcgagtgatgatc < 8:251054‑M2/149‑90 (MQ=255) gcctgGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAgccaggcaggtcgtccagtaccaggctgactatgtgttctggacagccaagtgacacgcacccgaccctacgccctgcgagtgatgatc < 1:56634‑M2/148‑90 (MQ=255) cctgGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCttt < 1:131244/147‑1 (MQ=255) ctgGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTc < 5:59967/149‑1 (MQ=255) cTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGt > 3:65583/1‑149 (MQ=255) cTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGt < 3:254361/149‑1 (MQ=255) tGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAgccaggcaggtcgtccagtaccaggctgactatgtgttctggacagccaagtgacacgcacccgaccctacgccctgcgagtgatgatctacgctcgatg > 7:251054‑M2/1‑47 (MQ=255) aGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTg < 3:102127/149‑1 (MQ=255) gACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGAc < 2:83247/93‑1 (MQ=255) gACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGAc > 1:83247/1‑93 (MQ=255) tGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCTTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGa > 7:30410/1‑149 (MQ=255) cacaCCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGc > 4:167441/1‑149 (MQ=255) cacaCCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCAGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGc > 3:312790/1‑149 (MQ=255) cacaCCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTCACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGc > 3:297138/1‑149 (MQ=255) acacCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACACCCTGCATGGCGCCTTTGCATTCGGACGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGTCTCCTTTGTCCGACGGTGCCACTGACAGCTGGGTGCAGGTGACCTTCGAGc > 8:146664/1‑148 (MQ=255) g‑ccgcGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGCCATCCt > 2:2133/1‑149 (MQ=255) gTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGACATCCTTGGCCTg > 4:198907/1‑149 (MQ=255) tAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTTACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGCCATCCTTGGCCTGc < 4:297138/149‑1 (MQ=255) | GATCATCACTCGCAGGGCGTAGGGTCGGGTGCGTGTCACTTGGCTGTCCAGAACACATAGTCAGCCTGGTACTGGACGACCTGCCTGGCACCTTTGTTCTG‑CGCCGTGCAGTCGACTGACGGCGCCACACCG‑CCGCGGGTAGCCAGGCGCTGGATATAGCTGACCCCCTGCATGGCGCCTTTGCCTTCGGCCGGGTTGGCCTTGACCAGTTGATAGGGGATGGCGCCTTTGTCCGCCGGTGCCACTGCCAGCTGGGTGCCGGTGACCTTCGAGCCATCCTTGGCCTGC > NC_002947/3400638‑3400925 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |