New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3676017 = | 43 (0.850) | 3 (0.070) | 3/230 | NT | 8.3% | intergenic (+24/+68) | PP_3240/PP_5592 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3676068 = | 28 (0.620) | intergenic (+75/+17) | PP_3240/PP_5592 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGGCTTCCTGCAACGTCTT > NC_002947/3675926‑3676216 | ccGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGACTAAACCACGGCCTTGATTACCTGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCACCTTGCCGGCGACGGTcacc < 5:187832/148‑1 (MQ=255) ccTCAAGTCGACCCACAGGGGCGGGCCAAGCCGCATAGAGAAATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGGCGCCGGCACGCCAAGAGGGAACCCAAGGGAACCCACATGCCGGCGACGGGCACCacacacac > 7:203234/1‑146 (MQ=255) ccTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCCTGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAgacgac > 6:58213/1‑149 (MQ=255) tCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCCAGCCATGGGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCCCAGACGACTg > 1:241600/1‑149 (MQ=255) aGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCa < 8:126305/149‑1 (MQ=255) aGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATAGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCa < 1:61600/149‑1 (MQ=255) aCCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCtt < 8:203234/149‑1 (MQ=255) cccACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCAAGTGCGATCCCATGGGAACCCGCTTGCCGGCGCCGGTCCCCACAGCCGACTGTCAGccat > 2:17663/1‑146 (MQ=255) ccACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTAGCCCGCAAGCCAAGTGCGATACCATGGGAAACAGCTTTCCCGCGACGGTAACCACAGACGACTGTAAGccata > 6:130858/1‑145 (MQ=255) gggCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAgcgcgc < 3:303674/149‑1 (MQ=255) gccggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCt > 6:326030/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTggcggc > 7:208529/1‑149 (MQ=255) cTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTAcgc > 7:156014/1‑149 (MQ=255) gagaCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCCTGTGGGATACCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTAACCACAGACGACAGTCAGCCTTAAGCGCCCCTGGCGGCCTCTAcgcccg > 8:133197/1‑149 (MQ=255) aTTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCccgccgcc > 5:227235/1‑149 (MQ=255) gaAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGTCGCCGACAg < 4:147447/149‑1 (MQ=255) gaAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACa < 8:156014/148‑1 (MQ=255) aGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCg < 5:130858/149‑1 (MQ=255) aCCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAg < 7:133197/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGc < 8:208529/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTTGATTACCGGGCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGc < 7:107589/149‑1 (MQ=255) ccGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGt < 7:154813/149‑1 (MQ=255) cGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTg > 5:261481/1‑141 (MQ=255) cGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTg < 6:261481/141‑1 (MQ=255) tctcGTCGCCGGCAAGCCATGTCCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATc < 3:48091/149‑1 (MQ=255) GTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTg > 3:158028‑M1/1‑149 (MQ=255) GTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTg > 1:17663‑M1/1‑149 (MQ=255) TCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGc < 1:114571‑M1/149‑1 (MQ=255) cgccggcaagctggttcccaagggatcgcacatggcttgccggcgacgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATc > 4:98706‑M2/49‑117 (MQ=255) cgccggcaagctggttcccaagggatcgcacatggcttgccggcgacgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATc < 3:98706‑M2/69‑1 (MQ=255) cggcaagctggttcccaagggatcgcacatggcttgccggcgacgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTAc > 5:75529‑M2/46‑149 (MQ=255) GCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCAc > 6:227235‑M1/1‑149 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCAc < 6:233286/110‑1 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCAc > 5:233286/1‑110 (MQ=255) cTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGaa < 5:326030/149‑1 (MQ=255) ccggcgacgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGGCTTCCt < 2:114571‑M2/139‑1 (MQ=255) cggcgacgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGaa > 2:162667‑M2/9‑132 (MQ=255) cggcgacgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGGCTTCCTGc < 2:241600‑M2/141‑1 (MQ=255) cgGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGGCTTCCTGCAACGTc > 3:161192‑M2/3‑149 (MQ=255) gTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGGCTTCCTGCAACGTCtt > 3:210169/1‑149 (MQ=255) | CCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGGCTTCCTGCAACGTCTT > NC_002947/3675926‑3676216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |