| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4075742 | NA (NA) | 13 (0.270) | 9/244 | NT | 24.2% | intergenic (‑328/+113) | PP_3586/tpx | transposase/2‑Cys peroxiredoxin |
| ? | NC_002947 | = 4957566 | 43 (0.850) | intergenic (‑49/+114) | fliH/fliG | flagellar assembly protein FliH/flagellar motor switch protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCA > NC_002947/4957421‑4957714 | tgttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCgg > 1:91438‑M2/144‑149 (MQ=255)ccGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCgg < 3:210935/149‑1 (MQ=255) gttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCggg > 6:150338‑M2/143‑149 (MQ=255) cGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGGCGCTGGTGTGGTGTTCTTTGGTGGGCTTGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCgg < 1:245470/148‑1 (MQ=255) ttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcggaaagcccggaaactgggggatcaactggtggccgcttgagtggttagaaaacaatgggttggattttttttgattaGAGCGGGt > 3:274698‑M2/142‑149 (MQ=255) ttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCggg < 5:115727‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctggcggagttcgatgccagaacccaagcccggctgggccgggttttgcttggaaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCcgc < 8:254087‑M2/16‑1 (MQ=255) tcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggcttttcttagcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtggttagaaaacaatggggtgcattttgtttgatgaTAGCGGGGTCACCcgcg > 6:264503‑M2/132‑148 (MQ=255) gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa < 4:279551/148‑1 (MQ=255) gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCAAGGTCGCGGGCACAGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttcc < 5:98266‑M2/149‑17 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcg < 6:187399‑M2/148‑33 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACaa < 6:210922/149‑1 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACaa > 5:299922/1‑149 (MQ=255) ctcaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGCCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAAc < 7:147189/147‑1 (MQ=255) caTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCt > 8:85207/1‑149 (MQ=255) aTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTc < 6:89978/149‑1 (MQ=255) ccTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGc > 5:246868/1‑147 (MQ=255) gcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGa < 7:38702‑M2/51‑1 (MQ=255) gAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc > 1:198406/1‑149 (MQ=255) caggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc < 6:186518‑M2/52‑1 (MQ=255) gtccgggcttttcttcgcaaagccccgaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGa > 8:74981‑M2/95‑149 (MQ=255) gcgGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc > 2:304401/1‑143 (MQ=255) gcgGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc < 1:304401/143‑1 (MQ=255) gcgGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGc > 2:69704/1‑149 (MQ=255) ggATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCCACAACCTCGATTGCAAGGACCGACGCCTTCGCgg > 7:124883/1‑149 (MQ=255) gATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCggg > 1:47261/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGt < 2:47261/149‑1 (MQ=255) gcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgagag > 7:180149‑M2/79‑81 (MQ=255) gcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgagag < 8:180149‑M2/3‑1 (MQ=255) ggTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCAGGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGCCACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCCGCGACAACCGCGCGGGCCAGGACCGACGCCTTCGCggggagag > 6:236523/1‑144 (MQ=255) caaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAAc > 2:21731‑M2/78‑149 (MQ=255) gTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAAcc < 1:69704/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAAccc > 7:246720/1‑149 (MQ=255) gcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGc > 5:212951‑M2/74‑149 (MQ=255) tgtTCTTTGGTGGTGATGCTTTCATGTTCTCAATACATGTTCGGCCGACATGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaaaa < 2:285418/149‑1 (MQ=38) gtTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:194251/142‑1 (MQ=255) gtTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:194251/1‑142 (MQ=255) ttCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttaagggctgcgctgtcgctcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttga < 7:128961‑M2/148‑85 (MQ=255) gtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAggcg < 1:21731‑M2/90‑1 (MQ=255) tttGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCAGCGAATGCGTCGGCAGCCACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGAAAACCCGCACCTACAAAAggcgc > 3:246703/1‑148 (MQ=255) actggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCg > 3:53780‑M2/54‑149 (MQ=255) gggCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACCACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCgg > 8:235005/1‑149 (MQ=255) gggCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCgg > 8:55328/1‑149 (MQ=255) gtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTa > 3:232056‑M2/50‑149 (MQ=255) cATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcg > 5:187399‑M2/1‑52 (MQ=255) aTGCTGTCATTTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt < 7:55328/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt > 6:68249/1‑149 (MQ=255) gccggttgagtgatttgaaatcaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGGCTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATgg < 4:53780‑M2/103‑1 (MQ=255) gccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATgg < 6:212951‑M2/103‑1 (MQ=255) tCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGAtt < 3:67835/86‑1 (MQ=255) tGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATcgcg < 2:198406/149‑1 (MQ=255) ttCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcg < 5:107120‑M2/137‑98 (MQ=255) ttCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcg > 6:107120‑M2/1‑40 (MQ=255) tgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAAt < 7:74981‑M2/113‑1 (MQ=255) ctcAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAAt < 8:246720/148‑1 (MQ=255) ctcAAACCATGTTCAGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAAt > 2:26928/1‑148 (MQ=255) aaaCCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgc > 5:155153‑M2/1‑35 (MQ=255) aaaCCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgc > 5:150396‑M2/1‑35 (MQ=255) aaaCCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgc < 6:155153‑M2/66‑32 (MQ=255) aaaCCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCATGCGTCGGCAGCGACCACCTCGAGTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAAACGGCGGCGGCGGCGATGGGATCGCGCAGAccg > 1:238475/1‑148 (MQ=255) aaaCCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATa < 7:85207/146‑1 (MQ=255) cATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATg > 6:32088/1‑130 (MQ=255) 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ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgt > 6:288507‑M2/1‑4 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgt > 3:179642‑M2/1‑4 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgtta < 6:163635‑M2/138‑135 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgtta > 5:163635‑M2/1‑4 (MQ=255) aGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGa < 2:181454‑M2/148‑1 (MQ=255) 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gatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgtgc < 1:114006‑M2/147‑147 (MQ=255) gatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgtt < 6:281887‑M2/134‑134 (MQ=255) gatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgtt > 5:281887‑M2/1‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCtt < 7:90994‑M2/138‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCa > 5:120329‑M2/1‑149 (MQ=255) | CCGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCA > NC_002947/4957421‑4957714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |