New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4110015 = | 31 (0.620) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 9.2% | coding (1837/2991 nt) | PP_3616 | membrane protein |
? | NC_002947 | 4110075 = | 30 (0.640) | coding (1897/2991 nt) | PP_3616 | membrane protein |
GAAGAGCGGCATGGCGCAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCGGGGTGATCGGTGCAGCGGCGGCAACGTTGGTCA > NC_002947/4109939‑4110222 | catcgctcttctgcaggctgttgtaggccgtcttgagcgataagatgttgaaccacagcatccccgcgtttaaaccACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAAcgcg > 2:28454‑M1/77‑148 (MQ=255) cgctcttctgcaggctgttgtaggccgtcttgagcgataagatgttgaaccacagcatccccgcgtttaaaccACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCggtggtggtg < 5:61654‑M1/61‑1 (MQ=255) cgctcttctgcaggctgttgtaggccgtcttgagcgataagatgttgaaccacagcatccccgcgtttaaaccACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCggtggtggtg > 6:61654‑M1/74‑134 (MQ=255) cGGCATGGCGCAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGCGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCgg < 5:156680/143‑1 (MQ=17) cGGCATGGCGCAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGCGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCgg > 6:156680/1‑143 (MQ=17) aTGGCGCAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCtgtg > 7:85918/1‑149 (MQ=32) gcgcAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGt < 8:113473/148‑1 (MQ=32) gcgcAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGt > 3:115541/1‑148 (MQ=32) agagATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTAt > 5:284864/1‑149 (MQ=32) gagaTGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATc > 7:302752/1‑149 (MQ=32) gcgcATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGcc > 3:145102/1‑148 (MQ=32) cATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACg > 8:159318/1‑142 (MQ=32) cATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACg < 7:159318/142‑1 (MQ=32) gggTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGc < 8:302752/148‑1 (MQ=32) tAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGc < 3:279214/149‑1 (MQ=32) cGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCag > 5:52120/1‑147 (MQ=32) gCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGc < 3:93578/144‑1 (MQ=32) gCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGc > 4:93578/1‑144 (MQ=32) caGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGc < 7:230347/149‑1 (MQ=34) tCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTAACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATg > 5:137116/1‑148 (MQ=21) cgcgtttaaaccaccaccaccgccggaggtgagtaacccaaggaagttgggtttcgcacgcgcagtggtggtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATg > 2:28454‑M2/73‑148 (MQ=255) cATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCAc < 7:217484/149‑1 (MQ=34) cATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCAc > 5:205879/1‑149 (MQ=34) aGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGttt < 3:264399/70‑1 (MQ=35) aGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGttt > 4:264399/1‑70 (MQ=35) aGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGaa < 8:85918/149‑1 (MQ=34) tGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATa > 5:110239/1‑148 (MQ=34) caccaccaccgccggaggtgagtaacccaaggaagttgggtttcgcacgcgcagtggtggtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCg < 5:61654‑M2/73‑1 (MQ=255) caccaccaccgccggaggtgagtaacccaaggaagttgggtttcgcacgcgcagtggtggtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCg > 6:61654‑M2/62‑134 (MQ=255) CACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACAccc < 2:27146‑M1/149‑1 (MQ=255) CCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTg > 4:115541‑M1/1‑149 (MQ=255) ACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTggg > 7:38831‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTgggg > 6:52120‑M1/1‑149 (MQ=255) gcgTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCg < 6:284864/149‑1 (MQ=34) cGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCa > 1:320851/1‑149 (MQ=34) gAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGc < 4:151895/144‑1 (MQ=34) gAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGc > 3:151895/1‑144 (MQ=34) cAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTgtgt > 5:288947/1‑149 (MQ=35) aaCTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGGGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGATCAGCGAAGCACCGGAATACGCCCTGGGGTGCGCTTCATCTGTGtt > 4:163754/1‑149 (MQ=11) ttGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTc < 2:260050/133‑1 (MQ=34) ttGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTc > 1:260050/1‑133 (MQ=34) tcggtACGCACCCCCGGCGGTGGTGGTGGTGTCAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACACCTTATCGCTCAAGACGCCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCGGGGGGAt < 8:147551/145‑1 (MQ=11) cggcggTGGTGGTGGTTTACACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCGGGGTGATCGGTGCAgcggcg < 3:163754/148‑1 (MQ=38) cggcggTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCGGGGTGATCGGTGCAgcggcg < 1:106707/148‑1 (MQ=38) ggtggtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGAt > 7:156247‑M2/7‑81 (MQ=255) ggtggtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGAt < 8:156247‑M2/75‑1 (MQ=255) ggtggtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTG‑TCGTGGTGATCGGTGCAGCGGCGGCAACGTTg < 6:205879‑M2/143‑1 (MQ=255) gtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCgg < 2:34789‑M2/116‑1 (MQ=255) gtGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCgg > 1:34789‑M2/3‑118 (MQ=255) tGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCGGGGTGATCGGTGCAGCGGCGGCAACGTTGGTCa < 2:320851‑M2/148‑1 (MQ=255) | GAAGAGCGGCATGGCGCAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACAGTGTCCATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGCGAAACCCAACTTCCTTGGGTTACTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCGGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGATGCACCGGAATACACCCTGGGGTTCGCTTCATCTGTGTTCGGGGTGATCGGTGCAGCGGCGGCAACGTTGGTCA > NC_002947/4109939‑4110222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |