New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4578324 = | 47 (0.930) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 10.1% | coding (1787/2211 nt) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | NC_002947 | 4578364 = | 27 (0.570) | coding (1747/2211 nt) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
GCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGG > NC_002947/4578218‑4578511 | gCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCg < 6:163825/148‑1 (MQ=255) atcgacaagatgcccggcgaccgctggcagaagttcgccaacctgcgtgcctacctcaccttcatgtgggcacacccgggcaagaagctgctgttcatgggctgcgAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTc > 2:183686‑M1/107‑147 (MQ=255) cAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCa < 2:141969/149‑1 (MQ=255) aaTCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAg > 6:258560/1‑149 (MQ=255) tCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGaa < 8:106355/149‑1 (MQ=255) cAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAAcagca < 7:289691/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGcttc < 5:258560/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGcttc < 2:130966/149‑1 (MQ=255) gCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGcc < 7:265577/130‑1 (MQ=255) gCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGcc > 8:265577/1‑130 (MQ=255) tCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCTACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCgg > 2:187842/1‑149 (MQ=255) aGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCca < 1:162993/149‑1 (MQ=255) cGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACAt < 5:322791/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCg < 6:51144/103‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCg > 5:51144/1‑103 (MQ=255) gAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAgg > 3:184450/1‑149 (MQ=255) gTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGt > 8:69890/1‑147 (MQ=255) gTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGa < 3:240487/149‑1 (MQ=255) gcTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAgg > 1:239944/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTgg > 2:1918/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTg < 5:280174/148‑1 (MQ=255) aCGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGc > 7:206571/1‑149 (MQ=255) gccTGGTTCTCGGGTTACTGCAGCAGGGACCCGTCCAGTTCGGCGTCTTGGTTCCACTCACGCCTCTGGCCGAAGTCGCTGCCCATGAACCGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGaa < 4:248015/148‑1 (MQ=255) gggATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGc > 6:324018/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCGGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGcc > 7:170139/1‑149 (MQ=255) cagcagGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCgg < 7:69890/149‑1 (MQ=255) cagcagGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCgg > 6:28933/1‑149 (MQ=255) agcagGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAg > 5:145258/1‑60 (MQ=255) agcagGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAg < 6:145258/60‑1 (MQ=255) ggTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATc > 2:28595/1‑149 (MQ=255) ccagtccagtTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGt < 5:324018/149‑1 (MQ=255) gagttcggccagtggcgtgagtggaaccacgacgccgaactCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGAt > 2:183686‑M2/42‑147 (MQ=255) TTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAACGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGc < 6:63017‑M1/148‑1 (MQ=255) ggccagtggcgtgagtggaaccacgacgccgaactCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGaa < 3:145487‑M2/73‑1 (MQ=255) ggccagtggcgtgagtggaaccacgacgccgaactCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGaa > 4:145487‑M2/36‑108 (MQ=255) gccagtggcgtgagtggaaccacgacgccgaactCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATg < 1:183686‑M2/115‑1 (MQ=255) tcgtGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCtt < 5:28933/149‑1 (MQ=255) tGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCTGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGcc > 1:227806/1‑149 (MQ=255) cACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCaccacc > 5:53046/1‑149 (MQ=255) gCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCGGTGCACCACCtca > 1:64417/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATTAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCtcatca < 1:28595/149‑1 (MQ=255) ggCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATg > 4:97517/1‑124 (MQ=255) ggCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATg < 3:97517/124‑1 (MQ=255) ccgaactCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCg < 6:172645‑M2/111‑1 (MQ=255) ccgaactCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCg > 5:172645‑M2/8‑118 (MQ=255) actCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATg < 2:64417‑M2/146‑1 (MQ=255) tCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATggg > 7:13937‑M2/2‑149 (MQ=255) | GCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGG > NC_002947/4578218‑4578511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |