New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5206022 = | 28 (0.970) | 4 (0.150) | 4/276 | 3.4 | 13.2% | coding (411/1209 nt) | PP_4586 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5206064 = | 26 (0.940) | coding (369/1209 nt) | PP_4586 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGC > NC_002947/5205890‑5206164 | gTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCg < 5:46122/148‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTa < 4:99557/148‑1 (MQ=255) aaGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATcc < 4:154854/148‑1 (MQ=255) gCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCctg > 7:56415/1‑148 (MQ=255) ccGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGa < 1:3988/148‑1 (MQ=255) ggTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGGCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAgg < 5:97170/148‑1 (MQ=255) gTCGGGCGATCGAACAGGCGCCACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGgc < 1:32067/148‑1 (MQ=255) cGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGgcgc < 2:32263/148‑1 (MQ=255) tCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAgggg < 1:86069/148‑1 (MQ=255) gcgACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTg < 8:56415/148‑1 (MQ=255) gAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGACCAGGGc > 4:113297/1‑148 (MQ=255) gAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGc > 3:153475/1‑148 (MQ=255) ttCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGt > 8:9681/1‑148 (MQ=255) ttGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCgggg > 3:51417/1‑148 (MQ=255) gATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATg > 5:151346/1‑148 (MQ=255) gcgGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGtga < 3:156738/148‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGAGGTGTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGtga < 7:140618/148‑1 (MQ=255) cgGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGtgat < 1:35674/148‑1 (MQ=255) aggaggTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATa < 4:153627/148‑1 (MQ=255) cGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGcgccgc < 7:9681/147‑1 (MQ=255) aTGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTgg > 6:24016/1‑148 (MQ=255) tCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCt > 8:30833/1‑142 (MQ=255) cGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTg < 7:30833/142‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGtt < 6:4975/148‑1 (MQ=255) gTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGcaca > 5:93704/1‑148 (MQ=255) tCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCacac > 5:86342/1‑148 (MQ=255) tCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGGGATGAATAGGCGCCGCTGGCCCGCTTCTGGTCCAGGTGCacac > 5:86339/1‑148 (MQ=255) gCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGc > 3:23674/1‑148 (MQ=255) | GTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGC > NC_002947/5205890‑5206164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |