New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5206022 = | 28 (0.970) | 4 (0.150) | 4/276 | 3.4 | 13.2% | coding (411/1209 nt) | PP_4586 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5206064 = | 26 (0.940) | coding (369/1209 nt) | PP_4586 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCGCTGGCTGCCAGATACCACGTTGC > NC_002947/5205921‑5206208 | tCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAgggg < 1:86069/148‑1 (MQ=255) gcgACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTg < 8:56415/148‑1 (MQ=255) gAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGACCAGGGc > 4:113297/1‑148 (MQ=255) gAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGc > 3:153475/1‑148 (MQ=255) ttCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGt > 8:9681/1‑148 (MQ=255) ttGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCgggg > 3:51417/1‑148 (MQ=255) gATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATg > 5:151346/1‑148 (MQ=255) gcgGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGtga < 3:156738/148‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGAGGTGTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGtga < 7:140618/148‑1 (MQ=255) cgGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGtgat < 1:35674/148‑1 (MQ=255) aggaggTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATa < 4:153627/148‑1 (MQ=255) cGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGcgccgc < 7:9681/147‑1 (MQ=255) aTGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTgg > 6:24016/1‑148 (MQ=255) tCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCt > 8:30833/1‑142 (MQ=255) cGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTg < 7:30833/142‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGtt < 6:4975/148‑1 (MQ=255) gTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGcaca > 5:93704/1‑148 (MQ=255) tCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCacac > 5:86342/1‑148 (MQ=255) tCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGGGATGAATAGGCGCCGCTGGCCCGCTTCTGGTCCAGGTGCacac > 5:86339/1‑148 (MQ=255) gCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGc > 3:23674/1‑148 (MQ=255) gcCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATACGCGCCGCTGGCCCGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTgg > 7:54637/1‑148 (MQ=255) gcCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGATGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGCTGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTgg > 8:124272/1‑148 (MQ=255) tCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCgctggct < 6:151346/148‑1 (MQ=255) tgctgGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCgctggctg > 2:129568/1‑146 (MQ=255) tgGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCGCTGGCTGCCa < 2:89580/146‑1 (MQ=255) cGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCGCTGGCTGCCAGATAcc > 7:32740/1‑148 (MQ=255) cgcAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCGCTGGCTGCCAGATACCACGTTGc < 4:153475/148‑1 (MQ=255) | TCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTCCAGCCCTCGGGCAGGTCGAAAGCCAGGCGCGCCACCAGCTCGGTACCATCCTGCTGGTCGAGGCGCGCAGGGGGTATCAGCTGGTCGCCGAGGAACAGGGCCCAGTGCGGGGTGATGCGTGATGAATAGGCGCCGCTGGCCAGCTTCTGGTCCAGTTGCACACGGTAGCTGAGGCTGGTCTTGCCGGCCGCTGGCTGCCAGATACCACGTTGC > NC_002947/5205921‑5206208 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |