New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 84034 = | 31 (0.580) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 8.0% | coding (774/912 nt) | hemF | coproporphyrinogen‑III oxidase |
? | NC_002947 | 84074 = | 40 (0.780) | coding (814/912 nt) | hemF | coproporphyrinogen‑III oxidase |
TCGTCGACGCCTACCTGCCAATCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAGCCTGTG > NC_002947/83889‑84179 | aaaaacgacgtactggtccatgacggctccttgtttatccacaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGt < 3:278394‑M1/4‑1 (MQ=255) aaaaacgacgtactggtccatgacggctccttgtttatccacaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGt > 3:67981‑M1/146‑149 (MQ=255) aaaaacgacgtactggtccatgacggctccttgtttatccacaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGt < 4:147088‑M1/4‑1 (MQ=255) ccTGCCAATCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGa < 5:165216/147‑1 (MQ=255) ccTGCCAATCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAat > 3:129861/1‑149 (MQ=255) catgacggctccttgtttatccacaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGt > 8:302210‑M1/128‑131 (MQ=255) catgacggctccttgtttatccacaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGt < 7:302210‑M1/4‑1 (MQ=255) aaTCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAatccatcc < 8:213543/149‑1 (MQ=255) tCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGt < 3:12488/128‑1 (MQ=255) tCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGt > 4:12488/1‑128 (MQ=255) tCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGACTTCAACCAGCTCTATGACCCCGGCACCCTGTTCGGTCAGCAGACCGGTGCCCCCACCGAATCCATCCTCAta > 4:226919/1‑148 (MQ=255) cAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCAc > 8:244213/1‑149 (MQ=255) acacGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCGCCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAg > 4:188113/1‑149 (MQ=255) acacGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAg > 8:99420/1‑149 (MQ=255) acaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAgg < 1:43952‑M1/44‑1 (MQ=255) acaggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAgg > 4:143233‑M1/106‑149 (MQ=255) caggcttactggccgagccagtcgcggtcttgcaggaagtactctgtcaggcgcgcttcttcactgccgggcgcggccttccagtcataaccccaacgcacctgCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGt > 2:43952‑M1/105‑149 (MQ=255) acGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACAGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCTAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGt < 6:176610/149‑1 (MQ=255) cacCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTggg < 6:333322/149‑1 (MQ=255) cacCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTggg < 7:123593/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGtt < 7:99420/149‑1 (MQ=255) cagcGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTg < 7:244213/149‑1 (MQ=255) cgAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAgg < 8:28421/149‑1 (MQ=255) aGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGcc < 4:129861/149‑1 (MQ=255) cAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGcc > 4:168148/1‑149 (MQ=255) tGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGa > 4:314143/1‑147 (MQ=255) gAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGTTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACaga < 5:312394/149‑1 (MQ=255) gTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACagag > 6:50209/1‑148 (MQ=255) aCCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACcgc > 5:19944/1‑149 (MQ=255) cgGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTgg < 1:338808/88‑1 (MQ=255) cgGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTgg > 2:338808/1‑88 (MQ=255) cgGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACt > 3:271467/1‑149 (MQ=255) aCCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTgaaga > 6:128000/1‑107 (MQ=255) aCCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTgaaga < 5:128000/107‑1 (MQ=255) cccTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTTCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACATAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTc < 3:226919/149‑1 (MQ=255) tGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGc > 7:74894/1‑149 (MQ=255) tGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGGTTTGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCCCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGc > 7:70383/1‑149 (MQ=255) gTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGc > 6:62142/1‑148 (MQ=255) ggTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTgaagaa < 6:94555/99‑1 (MQ=255) tCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAg < 3:188113/149‑1 (MQ=255) cTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAGc < 3:168148/149‑1 (MQ=255) cAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAGCCtg > 8:315285/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAGCCtgtg > 6:317318/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAGCCtgtg > 3:217088/1‑149 (MQ=255) tCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTaa < 7:146346/141‑1 (MQ=255) tCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTaa > 8:146346/1‑141 (MQ=255) | TCGTCGACGCCTACCTGCCAATCGTCCAGCGCCGCAAGAACACGCCCTACACCCCGCAGCAGCGCGAGTTCCAGGAATACCGCCGTGGCCGGTACGTGGAGTTCAACCTGGTCTATGACCGCGGCACCCTGTTCGGTCTGCAGTCCGGTGGCCGCACCGAATCCATCCTCATGTCGCTGCCACCGCAGGTGCGTTGGGGTTATGACTGGAAGGCCGCGCCCGGCAGTGAAGAAGCGCGCCTGACAGAGTACTTCCTGCAAGACCGCGACTGGCTCGGCCAGTAAGCCTGTG > NC_002947/83889‑84179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |