New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1404387 | 60 (1.110) | 4 (0.080) | 4/258 | NT | 6.6% | coding (1295/2067 nt) | PP_1228 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
? | NC_002947 | = 1404422 | 54 (1.030) | coding (1260/2067 nt) | PP_1228 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
CCTGATCCGCGGCGCGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGC > NC_002947/1404247‑1404534 | ccTGATCCGCGGCGCGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATg < 5:186568/149‑1 (MQ=255) ccTGATCCGCGGCGCGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATg < 5:12892/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCGCGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATggcgg‑c < 8:131344/148‑1 (MQ=255) gcggcgCGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCccgcaataccgccgac > 4:269559‑M1/1‑133 (MQ=255) ggcgCGTGCGGCCTGGGCCGCCGGCGATGCGTTGTGGGCGTCATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGAtt < 8:189001/149‑1 (MQ=255) gcgcGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTg < 8:91627/149‑1 (MQ=255) gcgTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGt < 1:319991/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATgg < 8:289113/130‑1 (MQ=255) cTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTAt < 1:312456/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTAtt < 7:152625/147‑1 (MQ=255) gccgccTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCTATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCg < 1:135842/149‑1 (MQ=255) ccgccTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCgg < 6:322356/149‑1 (MQ=255) gCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCccgcaataccgccgaccaatcggccgccattgccagccaga < 3:269559‑M1/149‑42 (MQ=255) gCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCccgcaataccgccgaccaatcggccgccattgccagccaga > 1:249062‑M1/1‑108 (MQ=255) cGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGcctc < 3:67896/147‑1 (MQ=255) gATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCccgcaataccgccgaccaatcggccgccattgccagccagacc < 2:249062‑M1/149‑44 (MQ=255) ttGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGc > 4:36208/1‑147 (MQ=255) tgGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CGGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGcc > 2:173581/1‑149 (MQ=255) tgGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGcc > 1:300730/1‑149 (MQ=255) gCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCg < 2:167041/128‑1 (MQ=255) gCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCg > 1:167041/1‑128 (MQ=255) gCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCAACTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCttt > 4:298293/1‑149 (MQ=255) aCATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGAc < 2:259546/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTg > 1:200640/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGGTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGGAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCtt < 6:37980/141‑1 (MQ=255) ccAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCtt > 5:37980/1‑141 (MQ=255) ccAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTgg > 7:132312/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTgg > 6:178861/1‑149 (MQ=255) gaGGGCGGTGGGGCTCATTTCGGTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTggg < 1:47365/148‑1 (MQ=255) aGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTggg > 2:266288/1‑148 (MQ=255) gCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATGTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAAt < 3:171475/149‑1 (MQ=255) aTTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCaa > 3:251575/1‑149 (MQ=255) gCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTc > 3:271218/1‑146 (MQ=255) gCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGa < 2:200640/148‑1 (MQ=255) gCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGa < 4:271218/148‑1 (MQ=255) aGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACtt > 4:224952/1‑141 (MQ=255) aGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACtt < 3:224952/141‑1 (MQ=255) aGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACgg < 1:266288/148‑1 (MQ=255) gCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGa < 1:128090/139‑1 (MQ=255) gCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGa > 2:128090/1‑139 (MQ=255) gCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGtt < 6:110045/149‑1 (MQ=255) gCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGtt < 3:304482/149‑1 (MQ=255) tGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGaaa > 8:271006/1‑138 (MQ=255) tGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGaaa < 7:271006/138‑1 (MQ=255) gTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAg > 2:166451/1‑149 (MQ=255) ttCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGc < 1:166451/149‑1 (MQ=255) tCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGcctcc < 7:300842/84‑1 (MQ=255) tCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGcctac > 8:300842/1‑82 (MQ=255) gATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCgg > 2:47587/1‑149 (MQ=255) tGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGcc < 7:45576/149‑1 (MQ=255) cTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGcc > 2:262616/1‑147 (MQ=255) gctgcATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACt < 8:190787/105‑1 (MQ=255) cATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATc < 3:298293/147‑1 (MQ=255) cATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCt < 8:132312/149‑1 (MQ=255) gCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGCCCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGcc > 5:77210/1‑123 (MQ=255) gCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGACACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCtggt > 3:253616/1‑149 (MQ=255) gCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGcc < 6:77210/123‑1 (MQ=255) cGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCtgtggg > 4:69028/1‑145 (MQ=255) gTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGt < 1:229031/136‑1 (MQ=255) gTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGt > 2:229031/1‑136 (MQ=255) cGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGGTCCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGc > 7:48757/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCg > 4:270946/1‑148 (MQ=255) cTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGCACCAGCCGGTGAGCTGGCACAGTTCATCCTGGTGGGCTTa > 5:252493/1‑149 (MQ=255) ggTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGgccagaccagcgacggcatgcagcaacagcatcgcgaaatcgaacaggtggctacagctgccaacgaaatgagcgccaccgccctggatgtcgcccacaacgcatc < 2:249062‑M2/149‑107 (MQ=255) gTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTc < 3:36208/149‑1 (MQ=255) tCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGgccagaccagcgacggcatgcagcaacagcatcgcgaaatcgaacaggtggctacagctgccaacgaaatgagcgccaccgccctggatgtcgcccacaacgcatcgc > 1:249062‑M2/1‑41 (MQ=255) tCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGgccagaccagcgacggcatgcagcaacagcatcgcgaaatcgaacaggtggctacagctgccaacgaaatgagcgccaccgccctggatgtcgcccacaacgcatcgc < 3:269559‑M2/149‑109 (MQ=255) tggctggcAATGGCGG‑CCGATTGTTCTGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGAAATGACAGGTTCAAACTTTTCGATGAAACGTTTGAACCCTACAGATCGCTGTCCCAGATCAACCTGGTGGACGTAgacaag > 8:296397/1‑144 (MQ=255) gctggcAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGc < 5:178861/149‑1 (MQ=255) | CCTGATCCGCGGCGCGTGCGGCCTGGGCCGCCTGCGATGCGTTGTGGGCGACATCCAGGGCGGTGGCGCTCATTTCGTTGGCAGCTGTAGCCACCTGTTCGATTTCGCGATGCTGTTGCTGCATGCCGTCGCTGGTCTGGCTGGCAATGGCGG‑CCGATTGGTCGGCGGTATTGCGGGCCTCCTGCAGCGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGC > NC_002947/1404247‑1404534 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |