New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1410949 = | 46 (0.850) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.5% | coding (986/1437 nt) | PP_1232 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1411020 = | 43 (0.850) | coding (915/1437 nt) | PP_1232 | hypothetical protein |
ACCAGCAGGTCGGCACGCACCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGT > NC_002947/1410802‑1411095 | aCCAGCAGGTCGGCACGCACCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGgcgc < 7:277961/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGTCGGCACGCACCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGgcgc > 5:180003/1‑149 (MQ=255) aagggtggcattgaagacagcatgcgctaccaactgatccgcgcccgggtggcactgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaagctggacgccgcacgttatggcctggc > 3:281154‑M1/148‑149 (MQ=255) cGGCACGCACCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCcagc < 5:100445/149‑1 (MQ=255) cacCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCt < 2:117389/149‑1 (MQ=255) acCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCtt < 2:116627/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGa < 3:292056/149‑1 (MQ=255) cTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGa < 3:174659/149‑1 (MQ=255) ttCATCGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCGCCTGCATGCGTTCGGCGCGGTGCTGGGCGTCGGCAAGTCGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTTGGTGATGGCGTTGGGCGCCTTGGCGAGCAGCGGCTTGAGCa < 8:199361/148‑1 (MQ=255) tCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCAtt > 4:142129/1‑149 (MQ=255) cAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCAttt > 8:94436/1‑149 (MQ=255) aaCGGGTAGTTGCCCGGGTACTGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGGTTGAGCATTTc < 4:107139/149‑1 (MQ=255) ggTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACgg < 6:82771/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACgg < 5:153639/142‑1 (MQ=255) gCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACgg > 6:153639/1‑142 (MQ=255) cccGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGt < 2:188700/148‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGc < 2:35558/101‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGc > 1:35558/1‑101 (MQ=255) actgatctacgagggcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaagctggacgccgcacgttatggcctgGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCt < 6:311994‑M1/55‑1 (MQ=255) gCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGATGGTCCAGGTCGATCTGTGGCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCtt > 1:80467/1‑149 (MQ=255) gCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCtt > 2:41454/1‑148 (MQ=255) cATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGa < 7:94436/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCtgtg > 6:213428/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGc < 5:213428/148‑1 (MQ=255) gcacaccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaagctggacgccgcacgttatggcctgGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAag > 2:30828‑M1/81‑149 (MQ=255) tgctgGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAaggccag > 5:49001/1‑149 (MQ=255) ccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaagctggacgccgcacgttatggcctgGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAaggccag > 5:311994‑M1/76‑149 (MQ=255) tgGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAaggccaggc > 1:204853/1‑148 (MQ=255) gCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTgc < 3:142129/149‑1 (MQ=255) cAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTgcg < 6:180003/149‑1 (MQ=255) aaGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGACCGACCTTGACCTGTGCCAAGGCAAGGCCATAACGTgcgg > 8:88712/1‑149 (MQ=255) tgGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCttt > 4:277652/1‑149 (MQ=255) gTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTgg < 2:204853/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTc < 1:41454/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGt > 3:10660/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGt > 2:103636/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGt > 4:100228/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCTCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTc > 3:94967/1‑149 (MQ=255) cGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTgcccg > 7:60395/1‑86 (MQ=255) cGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTgcccg < 8:60395/86‑1 (MQ=255) gATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGTCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTGTGGGTCTTCGTCCAGtt > 6:9699/1‑149 (MQ=255) tCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTgg > 1:33351/1‑149 (MQ=255) cAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCgg > 4:290704/1‑148 (MQ=255) aaGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGaa < 7:88712/149‑1 (MQ=255) aaGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGaa < 3:100228/149‑1 (MQ=255) ttGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAgcg < 3:290704/149‑1 (MQ=255) tAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGTCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCtt < 2:80467/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCGTTGGGCTCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTg < 4:94967/148‑1 (MQ=255) tGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTgg > 4:156854/1‑131 (MQ=255) tGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTgg < 3:156854/131‑1 (MQ=255) tGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTggcggc > 7:17105/1‑148 (MQ=255) gTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGCGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGcc > 5:294159/1‑149 (MQ=255) ggCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGATCATTTCCCGGGCCGCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCGTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGTAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCg < 6:294159/148‑1 (MQ=255) ggCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCg < 3:277652/148‑1 (MQ=255) gcgcCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGgt > 7:174225/1‑149 (MQ=255) | ACCAGCAGGTCGGCACGCACCTGTTTCAACGGGTAGTTGCCCGGGTACAGCCCCTGCATCCGTTCGGCGCGCTGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGAT‑GTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGT > NC_002947/1410802‑1411095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |