New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1410949 = | 46 (0.850) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.5% | coding (986/1437 nt) | PP_1232 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1411020 = | 43 (0.850) | coding (915/1437 nt) | PP_1232 | hypothetical protein |
TGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGG > NC_002947/1410874‑1411168 | tgctgGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAaggccag > 5:49001/1‑149 (MQ=255) ccggggcttgccgccaagcgcttccgcgcccaactggacgaagacccaaagctggacgccgcacgttatggcctgGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAaggccag > 5:311994‑M1/76‑149 (MQ=255) tgGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAaggccaggc > 1:204853/1‑148 (MQ=255) gCAAGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTgc < 3:142129/149‑1 (MQ=255) cAAGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTgcg < 6:180003/149‑1 (MQ=255) aaGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGACCGACCTTGACCTGTGCCAAGGCAAGGCCATAACGTgcgg > 8:88712/1‑149 (MQ=255) tgGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCttt > 4:277652/1‑149 (MQ=255) gTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTgg < 2:204853/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTc < 1:41454/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGt > 4:100228/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGt > 3:10660/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGt > 2:103636/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCTCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTc > 3:94967/1‑149 (MQ=255) gATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGTCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTGTGGGTCTTCGTCCAGtt > 6:9699/1‑149 (MQ=255) tCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTgg > 1:33351/1‑149 (MQ=255) cAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCgg > 4:290704/1‑148 (MQ=255) aaGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGaa < 7:88712/149‑1 (MQ=255) aaGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGaa < 3:100228/149‑1 (MQ=255) ttGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAgcg < 3:290704/149‑1 (MQ=255) tAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGTCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCtt < 2:80467/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCGTTGGGCTCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTg < 4:94967/148‑1 (MQ=255) tGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTgg > 4:156854/1‑131 (MQ=255) tGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTgg < 3:156854/131‑1 (MQ=255) tGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTggcggc > 7:17105/1‑148 (MQ=255) gTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGCGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGcc > 5:294159/1‑149 (MQ=255) ggCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGATCATTTCCCGGGCCGCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCGTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGTAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCg < 6:294159/148‑1 (MQ=255) ggCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCg < 3:277652/148‑1 (MQ=255) ctggccttggcacaggtcaagggcgggcaattgaacgaggcccgtgaaatgctcaagccgctgctggccaaggcCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCgg > 5:311994‑M2/75‑149 (MQ=255) gcgcCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGgt > 7:174225/1‑149 (MQ=255) cttggcacaggtcaagggcgggcaattgaacgaggcccgtgaaatgctcaagccgctgctggccaaggcCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGc > 2:30828‑M2/70‑149 (MQ=255) GCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCt > 2:33351‑M1/1‑148 (MQ=255) cagcagCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCg > 4:11703/1‑148 (MQ=255) agggcgggcaattgaacgaggcccgtgaaatgctcaagccgctgctggccaaggcCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGt < 6:311994‑M2/94‑1 (MQ=255) cTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTg < 8:174225/149‑1 (MQ=255) ttGAGCATTTCACGGGCCTCGTACAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGCCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGCGCGCGGAACCCCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCCTAGATCAGTGc > 3:92028/1‑149 (MQ=255) gCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCAcc > 1:260822/1‑149 (MQ=255) cACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGgcg > 4:268762/1‑149 (MQ=255) gggCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGcgcg > 1:100361/1‑148 (MQ=255) tCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAg > 3:36657/1‑149 (MQ=255) cGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGt > 3:260470/1‑149 (MQ=255) cAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTgg > 3:295963/1‑148 (MQ=255) aaTTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTc > 1:109532/1‑65 (MQ=255) aaTTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTc < 2:109532/65‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTgg > 5:18313/1‑147 (MQ=255) cccgcccTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAgcgc < 2:260822/148‑1 (MQ=255) cccgcccTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAgcgc < 8:17105/148‑1 (MQ=255) cgcccTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGa < 1:174375/132‑1 (MQ=255) cgcccTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGa > 2:174375/1‑132 (MQ=255) cccTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCt > 4:276753/1‑149 (MQ=255) aCCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCtt > 7:171585/1‑148 (MQ=255) tgCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAAt < 6:18313/147‑1 (MQ=255) tgCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAAt < 6:49001/147‑1 (MQ=255) tgCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAAt < 3:11703/147‑1 (MQ=255) ccAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCA > 8:242885‑M1/1‑149 (MQ=255) gcCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCtt > 3:281154‑M2/3‑149 (MQ=255) caggccaTAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTgg > 6:141778/1‑149 (MQ=255) | TGCTGGGCGTCGGCAAGACGGTTGTTGGTGATGTCCAGGTCGATCTGTGCCAAGTTGTAGGTGATGTCGTTGGGCGCCTTGGCCAGCAGCGGCTTGAGCATTTCACGGGCCTCGTTCAATTGCCCGCCCTTGACCTGTGCCAAGGCCAGGCCATAACGTGCGGCGTCCAGCTTTGGGTCTTCGTCCAGTTGGGCGCGGAAGCGCTTGGCGGCAAGCCCCGGTGTGCCCTCGTAGATCAGTGCCACCCGGGCGCGGATCAGTTGGTAGCGCATGCTGTCTTCAATGCCACCCTTGG > NC_002947/1410874‑1411168 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |