| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1413680 | 59 (1.100) | 4 (0.080) | 4/258 | NT | 6.3% | coding (217/474 nt) | PP_1235 | AhpC/TSA family protein |
| ? | NC_002947 | = 1413722 | 61 (1.160) | coding (175/474 nt) | PP_1235 | AhpC/TSA family protein | |||||
GCGGTCAACGCCCATGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGC > NC_002947/1413537‑1413829 | gcGGTCAACGCCCATGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCAc > 3:56280/1‑149 (MQ=255) tCAACGCCCATGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGa < 6:129145/149‑1 (MQ=255) aaCGCCCATGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGaca > 8:43224/1‑149 (MQ=255) cATGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGa < 4:56280/149‑1 (MQ=255) aTGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGATGTTCTCGTGAGACTTGATGCCATCACGCGGCCCACAGaa > 8:224034/1‑149 (MQ=255) aCTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGaca > 4:308235/1‑138 (MQ=255) aCTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGaca < 3:308235/138‑1 (MQ=255) cTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCa < 1:49815/149‑1 (MQ=255) cTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACgg > 5:120060/1‑149 (MQ=255) tACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGc > 8:316731/1‑149 (MQ=255) aCAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCAcgc > 6:43856/1‑122 (MQ=255) aCAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCAcgc < 5:43856/122‑1 (MQ=255) cAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCcg < 6:205891/149‑1 (MQ=255) aGCTTGATCACGTCGAACATCTGGCACATGGCCTCGTCCTTGTCGCTGTCCTCGAGCTCGATCGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCatcacgcggccaacaccgtgatattcggtgtgtcgcgtgatg < 1:110809‑M1/149‑43 (MQ=255) gCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGcg > 8:34178/1‑149 (MQ=255) ttGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAat > 6:19466/1‑120 (MQ=255) gATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGcgtc < 4:110812/147‑1 (MQ=255) gATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGcgtc < 8:198622/147‑1 (MQ=255) tCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAAGGGGAAGCCTTGCTTGGCGTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCttcgccgcggccaacaccgtgatattcggtgtgtcgcgtgatggcatcaagt < 6:105322‑M1/149‑53 (MQ=255) aCGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTg > 2:273102/1‑149 (MQ=255) aCGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCNTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTg > 1:32068/1‑149 (MQ=255) tCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTgg > 4:232575/1‑147 (MQ=255) tCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTgg < 3:232575/147‑1 (MQ=255) gAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCttcgccgcggccaacaccgtgatattcggtgtgtcgcgtgatggcatcaag > 4:20960‑M1/1‑90 (MQ=255) gAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCttcgccgcggccaacaccgtgatattcggtgtgtcgcgtgatggcatcaag < 3:20960‑M1/141‑52 (MQ=255) gAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTcgc < 7:43224/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTcgcg > 6:101829/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCgg > 5:326236/1‑148 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGaa > 4:208571/1‑97 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGaa < 3:208571/97‑1 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGc < 6:300439/131‑1 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGc > 5:300439/1‑131 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTgg < 4:16573/149‑1 (MQ=255) caGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGc < 6:120060/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCggtg < 6:326236/148‑1 (MQ=255) ccTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAAAGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGgtggtg > 3:317105/1‑149 (MQ=255) gTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGc > 3:49330/1‑149 (MQ=255) g‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTgggg > 5:203259/1‑149 (MQ=255) aTC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCTCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTggg < 7:34178/147‑1 (MQ=255) cTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGt > 6:338832/1‑149 (MQ=255) gAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTg < 3:266994/137‑1 (MQ=255) gAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTg > 4:266994/1‑137 (MQ=255) gAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTc < 6:203259/147‑1 (MQ=255) aaCGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCtt > 8:123386/1‑149 (MQ=255) aCGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCTCGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTg < 5:101829/149‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTgg < 3:245154/149‑1 (MQ=255) gggAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGGTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTggg < 7:316731/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTgggg > 2:83251/1‑148 (MQ=255) ttgcttgGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAg > 2:76141/1‑148 (MQ=255) gcttgGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTa < 1:76141/148‑1 (MQ=255) cttgGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTac < 1:273102/148‑1 (MQ=255) gCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcacca < 4:49330/148‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTActccac > 7:309438/1‑148 (MQ=255) cTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcaccacca > 6:7848/1‑149 (MQ=255) ttGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcaccaccac > 7:75483/1‑149 (MQ=255) gAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcaccaccac < 7:123386/147‑1 (MQ=255) gAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACct > 5:162520/1‑149 (MQ=255) tGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCtt < 4:317105/149‑1 (MQ=255) gCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCtt > 1:91464/1‑148 (MQ=255) cGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGa < 2:32068/149‑1 (MQ=255) cGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGa > 2:286333/1‑149 (MQ=255) gACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAg > 6:192595/1‑149 (MQ=255) aCTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAggcatcaagtcgcacgagaacttcaacgccaagcaaggcttccccttcgagctgatcagcgacaaggacgaggccctgtgccagctgttcgacgtga < 6:105322‑M2/149‑98 (MQ=255) cTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAggcatcaagtcgcacgagaacttcaaggccaagcaaggcttcccgttcgagctgatcagcgacaaggacgaggccctgtgccagctgttc > 4:20960‑M2/1‑51 (MQ=255) cTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAggcatcaagtcgcacgagaacttcaaggccaagcaaggcttcccgttcgagctgatcagcgacaaggacgaggccctgtgccagctgttc < 3:20960‑M2/141‑91 (MQ=255) gATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCgg > 3:237228/1‑149 (MQ=255) gATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCgg > 8:243750/1‑149 (MQ=255) aTGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCg < 7:3887/147‑1 (MQ=255) aTGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCg > 8:3887/1‑147 (MQ=255) aTGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGGGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCgg < 7:224034/148‑1 (MQ=255) cATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGT‑GATggcatcaagtcgcacgagaacttcaaggccaagcaaggcttcccgatcgagctcgaggacagcgacaaggacgaggccatgtgccagatgttcgacgtgatcaagct < 1:110809‑M2/149‑108 (MQ=255) cATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAgg < 5:7848/149‑1 (MQ=255) | GCGGTCAACGCCCATGTACTCCTTGCCATACAGCTTCTTCAGCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTG‑‑ATC‑AGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGC > NC_002947/1413537‑1413829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |