New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1413680 | 59 (1.100) | 4 (0.080) | 4/258 | NT | 6.3% | coding (217/474 nt) | PP_1235 | AhpC/TSA family protein |
? | NC_002947 | = 1413722 | 61 (1.160) | coding (175/474 nt) | PP_1235 | AhpC/TSA family protein |
GCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCTGGTGGCCTGGGCCTGGAAGTCGG > NC_002947/1413578‑1413868 | gCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGcg > 8:34178/1‑149 (MQ=255) gATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGcgtc < 8:198622/147‑1 (MQ=255) gATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGcgtc < 4:110812/147‑1 (MQ=255) aCGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTg > 2:273102/1‑149 (MQ=255) aCGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCNTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTg > 1:32068/1‑149 (MQ=255) tCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTgg > 4:232575/1‑147 (MQ=255) tCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTgg < 3:232575/147‑1 (MQ=255) gAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTcgc < 7:43224/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTcgcg > 6:101829/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCgg > 5:326236/1‑148 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGc > 5:300439/1‑131 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGc < 6:300439/131‑1 (MQ=255) acaGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTgg < 4:16573/149‑1 (MQ=255) caGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGc < 6:120060/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCggtg < 6:326236/148‑1 (MQ=255) ccTTGTCGCTGATCAGCTCGAAAGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGgtggtg > 3:317105/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGc > 3:49330/1‑149 (MQ=255) gATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTgggg > 5:203259/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCTCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTggg < 7:34178/147‑1 (MQ=255) cTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGt > 6:338832/1‑149 (MQ=255) gAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTg > 4:266994/1‑137 (MQ=255) gAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTg < 3:266994/137‑1 (MQ=255) gAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTc < 6:203259/147‑1 (MQ=255) aaCGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCtt > 8:123386/1‑149 (MQ=255) aCGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCTCGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTg < 5:101829/149‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTgg < 3:245154/149‑1 (MQ=255) gggAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGGTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTggg < 7:316731/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTgggg > 2:83251/1‑148 (MQ=255) ttgcttgGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAg > 2:76141/1‑148 (MQ=255) gcttgGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTa < 1:76141/148‑1 (MQ=255) cttgGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTac < 1:273102/148‑1 (MQ=255) gCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcacca < 4:49330/148‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTActccac > 7:309438/1‑148 (MQ=255) cTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcaccacca > 6:7848/1‑149 (MQ=255) ttGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcaccaccac > 7:75483/1‑149 (MQ=255) gAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTAcaccaccac < 7:123386/147‑1 (MQ=255) gAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACct > 5:162520/1‑149 (MQ=255) tGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCtt < 4:317105/149‑1 (MQ=255) gCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCtt > 1:91464/1‑148 (MQ=255) cGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGa < 2:32068/149‑1 (MQ=255) cGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGa > 2:286333/1‑149 (MQ=255) gACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAg > 6:192595/1‑149 (MQ=255) aCTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAggcatcaagtcgcacgagaacttcaacgccaagcaaggcttccccttcgagctgatcagcgacaaggacgaggccctgtgccagctgttcgacgtga < 6:105322‑M2/149‑98 (MQ=255) cTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAggcatcaagtcgcacgagaacttcaaggccaagcaaggcttcccgttcgagctgatcagcgacaaggacgaggccctgtgccagctgttc > 4:20960‑M2/1‑51 (MQ=255) cTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAggcatcaagtcgcacgagaacttcaaggccaagcaaggcttcccgttcgagctgatcagcgacaaggacgaggccctgtgccagctgttc < 3:20960‑M2/141‑91 (MQ=255) gATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCgg > 3:237228/1‑149 (MQ=255) gATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCgg > 8:243750/1‑149 (MQ=255) aTGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCg < 7:3887/147‑1 (MQ=255) aTGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCg > 8:3887/1‑147 (MQ=255) aTGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGGGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCgg < 7:224034/148‑1 (MQ=255) cATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGT‑GATggcatcaagtcgcacgagaacttcaaggccaagcaaggcttcccgatcgagctcgaggacagcgacaaggacgaggccatgtgccagatgttcgacgtgatcaagct < 1:110809‑M2/149‑108 (MQ=255) cATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAgg < 5:7848/149‑1 (MQ=255) aTCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCATGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGc > 7:176967/1‑149 (MQ=255) cacCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTcc > 1:128941/1‑89 (MQ=255) cacCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTcc < 2:128941/89‑1 (MQ=255) acCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCggtg > 1:256527/1‑67 (MQ=255) acCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCggtg < 2:256527/67‑1 (MQ=255) acCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGcc < 1:286333/149‑1 (MQ=255) acCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGcc < 1:83251/149‑1 (MQ=255) acCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGcc > 5:94207/1‑149 (MQ=255) gAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGc < 4:237228/149‑1 (MQ=255) aaTATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCt < 6:94207/149‑1 (MQ=255) tatCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTCGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTACTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCAGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCtgg > 5:206779/1‑149 (MQ=255) cACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCtggtgg > 4:196019/1‑149 (MQ=255) gCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGt > 5:162238/1‑108 (MQ=255) gCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGt < 6:162238/108‑1 (MQ=255) ccGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCTGGTGgcctgggcctgg < 6:162520/149‑1 (MQ=255) ggcgAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCTGGTGGCCTGGGCCTGGAAGt < 2:91464/149‑1 (MQ=255) gcgAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCTGGTGGCCTGGGCCTGGAAGTc < 5:192595/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCtt > 3:309982/1‑96 (MQ=255) gAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCtt < 4:309982/96‑1 (MQ=255) gAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCTGGTGGCCTGGGCCTGGAAGTCgg > 1:297675/1‑149 (MQ=255) | GCTTGATCACGTCGAACAGCTGGCACAGGGCCTCGTCCTTGTCGCTGATCAGCTCGAACGGGAAGCCTTGCTTGGCCTTGAAGTTCTCGTGCGACTTGATGCCATCACGCGACACACCGAATATCACGGTGTTGGCCGCGGCGAAGGCGTCGTGCTGGTCGCGGAAGCCCTGGCCCTCGGTGGTGCAGCCTGGGGTGCTGTCCTTGGGGTAGAAGTACACCACCACCTGCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGGCTGACGGTTTGCCCGCTGGTGGCCTGGGCCTGGAAGTCGG > NC_002947/1413578‑1413868 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |