New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2024610 = | 38 (0.710) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 7.4% | coding (749/1143 nt) | wbpY | glycosyl transferase WbpY |
? | NC_002947 | 2024709 = | 39 (0.770) | coding (848/1143 nt) | wbpY | glycosyl transferase WbpY |
GCTACAGCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGC > NC_002947/2024466‑2024757 | gcTACAGCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGc < 3:153182/149‑1 (MQ=255) tacatcatcgggcgcgcacatcaacgccgccgaacccgctacctctggcaacgacgagctgttggaacataccaccggtacccccgagctcatggcctcgagcactggcaggccgaacccttcatagtgcgacgggaaggtgaACAGcc < 8:37750‑M1/6‑1 (MQ=255) tACAGCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCg > 4:190912/1‑149 (MQ=255) tACAGCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCg > 5:128338/1‑149 (MQ=255) aGCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTAAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTAt < 5:144609/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATc > 8:59170/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCa < 2:73761/149‑1 (MQ=255) tcgtcgGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAg > 4:204245/1‑149 (MQ=255) cgGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGca > 3:198160/1‑148 (MQ=255) ggTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGcac < 4:198160/148‑1 (MQ=255) cgcgCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTgg < 3:190912/149‑1 (MQ=255) gcAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGgcg > 3:29805/1‑149 (MQ=255) aaaaaCATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGgcgcg > 8:188844/1‑149 (MQ=255) aaaCATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGgcgcgc > 1:43361/1‑148 (MQ=255) cTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCg < 6:3859/149‑1 (MQ=255) cTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCg < 7:59170/149‑1 (MQ=255) gCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGtt < 1:72807/148‑1 (MQ=255) cTTAATGCTTACGGGCACTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGc > 7:285167/1‑149 (MQ=255) cTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGc < 2:43361/149‑1 (MQ=255) tGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGt > 3:172589/1‑148 (MQ=255) ggCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACtt < 4:29805/149‑1 (MQ=255) ataccaccggtacccccgagctcatggcctcgagtactggcaggccgaacccttcatagtgcgacgggaaggtgaACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCg < 6:234063‑M1/74‑1 (MQ=255) ttGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGcac > 8:225869/1‑94 (MQ=255) ccACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCgctgct < 3:204245/149‑1 (MQ=255) gttgcgCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCg > 7:258179/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTc > 3:248100/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTc < 6:128338/149‑1 (MQ=255) cAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCg > 6:139953/1‑149 (MQ=255) aGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCgg < 8:258179/149‑1 (MQ=255) tggcctcgagcactggcaggccgaacccttcatagtgcgacgggaaggtgaACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCTAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTg > 4:61734‑M1/52‑149 (MQ=255) ttGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGAAGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTCCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGt > 7:6560/1‑149 (MQ=255) ctcgagtactggcaggccgaacccttcatagtgcgacgggaaggtgaACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCa > 5:234063‑M1/48‑149 (MQ=255) tCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGcc > 6:202725/1‑122 (MQ=255) tCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGcc < 5:202725/122‑1 (MQ=255) ncAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCg > 2:292634/2‑149 (MQ=255) tGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCAc > 1:268743/1‑148 (MQ=255) tagcATGGCGGGCGTTGCGAGGCGATTCACTGACGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCTTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGGCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTATCACTATGa < 6:238534/146‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGaa < 5:185626/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGaa < 4:172589/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGaa < 8:285167/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAg < 7:188844/149‑1 (MQ=255) gAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGt > 4:321767/1‑149 (MQ=255) cGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGACAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTc > 3:318346/1‑149 (MQ=255) gATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTc > 5:216925/1‑148 (MQ=255) ttCACAGCCGTATCGCCAAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGGTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCTTCGCACTTTGATGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAg < 8:6560/149‑1 (MQ=255) ACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGc < 2:270932‑M1/148‑1 (MQ=255) ACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGc < 1:337645‑M1/148‑1 (MQ=255) | GCTACAGCCTGTTCGTCGGTACCATCGAGCCGCGCAAAAACATCGAGACCTTGCTTAATGCTTACGGCCGCTTGCCACTTGCGTTGCGCCAGCGTTGGCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGC > NC_002947/2024466‑2024757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |