New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2024610 = | 38 (0.710) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 7.4% | coding (749/1143 nt) | wbpY | glycosyl transferase WbpY |
? | NC_002947 | 2024709 = | 39 (0.770) | coding (848/1143 nt) | wbpY | glycosyl transferase WbpY |
GCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCGATGATGTA > NC_002947/2024563‑2024851 | ctcgagtactggcaggccgaacccttcatagtgcgacgggaaggtgaACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCa > 5:234063‑M1/48‑149 (MQ=255) ncAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCg > 2:292634/2‑149 (MQ=255) tGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCAc > 1:268743/1‑148 (MQ=255) tagcATGGCGGGCGTTGCGAGGCGATTCACTGACGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCTTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGGCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTATCACTATGa < 6:238534/146‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGaa < 8:285167/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGaa < 5:185626/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGaa < 4:172589/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAg < 7:188844/149‑1 (MQ=255) gAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGt > 4:321767/1‑149 (MQ=255) cGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGACAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTc > 3:318346/1‑149 (MQ=255) gATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTc > 5:216925/1‑148 (MQ=255) ttCACAGCCGTATCGCCAAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGGTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCTTCGCACTTTGATGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAg < 8:6560/149‑1 (MQ=255) tgaacagccgagcgccggcaaacagcagcggcaagtcttcactggcaacgaagccgaggtagcgcgcccagccttcctgctgtgcctgggcgatacggctgtTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTACTCGAg > 5:234063‑M2/103‑149 (MQ=255) ACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGc < 1:337645‑M1/148‑1 (MQ=255) ACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGc < 2:270932‑M1/148‑1 (MQ=255) cagccgagcgccggcaaacagcagcggcaagtcttcactagcaacgaagccgaggtagcgcgcccagccttcctgctgtgcctgggcgatacggctgtTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCa > 4:61734‑M2/99‑149 (MQ=255) CAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCa > 2:337645‑M1/1‑149 (MQ=255) AGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCAt > 2:268743‑M1/1‑149 (MQ=255) tATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGa < 6:115151/146‑1 (MQ=255) tATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGa > 5:115151/1‑146 (MQ=255) cccAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCgggg > 1:326328/1‑149 (MQ=255) ggCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTAc < 6:216925/149‑1 (MQ=255) agcagGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCggtg < 3:321767/149‑1 (MQ=255) agGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTa > 1:222229/1‑149 (MQ=255) ggAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCAGCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTAt < 1:133329/149‑1 (MQ=255) cggcaagtcttcactggcaacgaagccgaggtagcgcgcccagccttcctgctgtgcctgggcgatacggctgtTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTACTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTAt < 6:234063‑M2/75‑1 (MQ=255) gAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTAt < 1:292634/148‑1 (MQ=255) gAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATg > 5:244364/1‑149 (MQ=255) ggCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGtt > 5:117655/1‑148 (MQ=255) ggCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCaa < 5:139953/147‑1 (MQ=255) gcgcgcTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAg > 6:221877/1‑149 (MQ=255) gcTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCtcg > 4:8642/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTcgtcgt > 3:310036/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTAACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTcgtcgt > 1:84105/1‑149 (MQ=255) cTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGtt < 2:222229/149‑1 (MQ=255) cTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGc > 2:43629/1‑146 (MQ=255) tGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGtt > 2:234212/1‑149 (MQ=255) tGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGtt < 6:244364/149‑1 (MQ=255) tGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGtt > 7:39112/1‑149 (MQ=255) tGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGtt > 1:188781/1‑149 (MQ=255) tGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGACAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACAGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCCGGtt > 3:18356/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGt < 6:117655/148‑1 (MQ=255) ctgctgTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGTAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGTCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGAt < 3:231410/149‑1 (MQ=255) ctgctgTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGAt > 7:37750/1‑149 (MQ=255) tgctgTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGAtg > 7:271525/1‑149 (MQ=255) ctgTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGAtgt < 4:248100/148‑1 (MQ=255) gCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGcc > 5:53501/1‑149 (MQ=255) cTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCgatgat < 1:43629/149‑1 (MQ=255) cTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCgatgat < 4:318346/149‑1 (MQ=255) cTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCgatgat < 2:84105/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCGatgatg > 6:337262/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCGatgatg > 6:46789/1‑149 (MQ=255) ggctgtTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCGATGATGTa < 8:37750‑M2/143‑1 (MQ=255) | GCCGTTGATCCTCAGTGGGTATCATGGCTGGCGTAGCGAGGCGATTCACAGCCGTATCGCCCAGGCACAGCAGGAAGGCTGGGCGCGCTACCTCGGCTTCGTTGCCAGTGAAGACTTGCCGCTGCTGTTTGCCGGCGCTCGGCTGTTCACCTTCCCGTCGCACTATGAAGGGTTCGGCCTGCCAGTGCTCGAGGCCATGAGCTCGGGGGTACCGGTGGTATGTTCCAACAGCTCGTCGTTGCCAGAGGTAGCGGGTTCGGCGGCGTTGATGTGCGCGCCCGATGATGTA > NC_002947/2024563‑2024851 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |