New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2129966 = | 68 (1.260) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 6.0% | coding (2233/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
? | NC_002947 | 2130009 = | 62 (1.230) | coding (2190/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
TGCTCCTGGCTGGGGTTGGTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCA > NC_002947/2129818‑2130111 | gggcctgcaaaacgcaacgggtacgcgcaccaattcacgcggttatgcacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtag > 6:45842‑M1/149‑149 (MQ=255) ggcctgcaaaacgcaacgggtacgcgcaccaattcacgcggttatgcacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtag > 4:108942‑M1/148‑148 (MQ=255) ggcctgcaaaacgcaacgggtacgcgcaccaattcacgcggttatgcacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtaGt < 3:55296‑M1/2‑1 (MQ=255) tCCTGGCTGGGGTTGGTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGc > 2:42504/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGGGGTTGGTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGcc > 6:158345/1‑149 (MQ=255) caaaacgcaacgggtacgcgcaccaattcacgcggttatgcacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaattcgacaacggcatcgcccaggtaGTGCCTc > 1:262297‑M1/142‑148 (MQ=255) gctggGGTTGGTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTAACGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCg > 1:98613/1‑148 (MQ=255) ggTTGGTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCgg < 1:163712/149‑1 (MQ=255) gTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCtt > 2:1386/1‑149 (MQ=255) tGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCtt > 4:327643/1‑148 (MQ=255) aGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGAc < 7:295647/149‑1 (MQ=255) cATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCNAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCa > 1:31231/1‑149 (MQ=255) aTTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCAc > 4:25991/1‑149 (MQ=255) ttACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACt > 4:55296/1‑149 (MQ=255) ttACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACt > 5:2266/1‑149 (MQ=255) ttACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACt < 7:69961/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACAGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCa > 3:210502/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCAc > 1:251117/1‑149 (MQ=255) gCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCt < 2:289921/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGGCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCg > 7:296386/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGa < 2:31231/149‑1 (MQ=255) gcggttatgcacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtaGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAg < 7:248269‑M1/39‑1 (MQ=255) cTGCCCGACCATTCCCAGTTGGGTACCTTTGTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAg < 2:251117/149‑1 (MQ=255) cccGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAgg < 7:22861/147‑1 (MQ=255) cccGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCa > 3:317263/1‑149 (MQ=255) ccGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCAc > 6:220730/1‑149 (MQ=255) gACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCa > 2:114960/1‑128 (MQ=255) gACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCa < 1:114960/128‑1 (MQ=255) cacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtaGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTAcc > 8:248269‑M1/102‑148 (MQ=255) cccAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGc > 6:285118/1‑149 (MQ=255) aggtGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGAt < 8:115300/146‑1 (MQ=255) gTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATg < 5:158345/149‑1 (MQ=255) ctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtaGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAgg > 3:72000‑M1/92‑131 (MQ=255) ctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtaGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAgg < 4:72000‑M1/40‑1 (MQ=255) gggTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGcc < 8:31689/148‑1 (MQ=255) gTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGtt > 8:116175/1‑149 (MQ=255) gTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATg < 1:320684/139‑1 (MQ=255) gTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATg > 2:320684/1‑139 (MQ=255) gTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGa < 3:262243/149‑1 (MQ=255) ttCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAt > 5:71831/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAt < 1:257789/149‑1 (MQ=255) tctcGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAtt > 6:284411/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAtt > 8:152153/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑Cca < 3:248147/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGAc > 6:188095/1‑97 (MQ=255) ccAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGAc < 5:188095/97‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑Ccaca < 3:327643/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑Ccaca > 7:167785/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCa < 5:220730/149‑1 (MQ=255) ggCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCTTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCg < 1:257334/148‑1 (MQ=255) aaaGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCtt > 6:329315/1‑78 (MQ=255) aaaGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggt > 8:55951/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggtcggt > 6:136042/1‑149 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 5:84275/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 5:284411/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 5:124342/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 7:152153/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAg < 5:285118/149‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCATGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAgg < 7:116175/149‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 7:47942/147‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAgg < 5:136042/149‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAAACGGTCGGttacaa > 8:47942/1‑143 (MQ=255) gACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGac < 2:98613/148‑1 (MQ=255) cccTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggt > 5:312198/1‑133 (MQ=255) cccTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggt < 6:312198/133‑1 (MQ=255) ccTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGaccacc > 4:328746/1‑149 (MQ=255) ggTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAAt > 6:270492/1‑149 (MQ=255) tacccAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTc < 2:53036/145‑1 (MQ=255) tcatggTCAGTACAATGCGTGAAACGCGGGGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTTCCCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTg < 1:65731/140‑1 (MQ=255) gCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTg > 2:65731/1‑143 (MQ=255) aGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGtt < 1:42504/148‑1 (MQ=255) aGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGtt < 6:71831/148‑1 (MQ=255) gTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTg > 1:265591/1‑148 (MQ=255) tACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑cc < 6:87941/91‑1 (MQ=255) tACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑cc > 5:87941/1‑91 (MQ=255) gCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAgg > 5:334830/1‑149 (MQ=255) gAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCg > 2:86797/1‑118 (MQ=255) cgcgGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGt < 4:317263/149‑1 (MQ=255) cggcgTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGc < 6:334830/149‑1 (MQ=255) ggcgTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCa < 7:55951/149‑1 (MQ=255) | TGCTCCTGGCTGGGGTTGGTGAGCATTACCAGGCCCGCCTGCCCGACCATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCA > NC_002947/2129818‑2130111 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |