New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2129966 = | 68 (1.260) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 6.0% | coding (2233/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
? | NC_002947 | 2130009 = | 62 (1.230) | coding (2190/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
CATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTGCAGGCCCA > NC_002947/2129865‑2130157 | cacttttgccctacctgcaaccgtaccggaccaattcggtggtcctggaaaccgaccgtctcgatcctgatgtggaaatcgacaacggcatcgcccaggtaGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTAcc > 8:248269‑M1/102‑148 (MQ=255) cccAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGc > 6:285118/1‑149 (MQ=255) aggtGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGAt < 8:115300/146‑1 (MQ=255) gTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATg < 5:158345/149‑1 (MQ=255) gggTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGcc < 8:31689/148‑1 (MQ=255) gTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGtt > 8:116175/1‑149 (MQ=255) gTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATg < 1:320684/139‑1 (MQ=255) gTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATg > 2:320684/1‑139 (MQ=255) gTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGa < 3:262243/149‑1 (MQ=255) ttCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAt < 1:257789/149‑1 (MQ=255) ttCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAt > 5:71831/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAtt > 8:152153/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAtt > 6:284411/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑Cca < 3:248147/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑Ccaca > 7:167785/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑Ccaca < 3:327643/149‑1 (MQ=255) gCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCa < 5:220730/149‑1 (MQ=255) ggCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCTTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCg < 1:257334/148‑1 (MQ=255) aaaGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggt > 8:55951/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggtcggt > 6:136042/1‑149 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 7:152153/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 5:84275/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 5:284411/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 5:124342/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAg < 5:285118/149‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCATGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAgg < 7:116175/149‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 7:47942/147‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAgg < 5:136042/149‑1 (MQ=255) gTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAAACGGTCGGttacaa > 8:47942/1‑143 (MQ=255) gACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGac < 2:98613/148‑1 (MQ=255) cccTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggt > 5:312198/1‑133 (MQ=255) cccTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGAcggt < 6:312198/133‑1 (MQ=255) ccTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGaccacc > 4:328746/1‑149 (MQ=255) ggTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAAt > 6:270492/1‑149 (MQ=255) tacccAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTc < 2:53036/145‑1 (MQ=255) tcatggTCAGTACAATGCGTGAAACGCGGGGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTTCCCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTg < 1:65731/140‑1 (MQ=255) gCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTg > 2:65731/1‑143 (MQ=255) aGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGtt < 6:71831/148‑1 (MQ=255) aGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGtt < 1:42504/148‑1 (MQ=255) gTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTg > 1:265591/1‑148 (MQ=255) tACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑cc < 6:87941/91‑1 (MQ=255) tACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑cc > 5:87941/1‑91 (MQ=255) gCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAgg > 5:334830/1‑149 (MQ=255) gAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCg > 2:86797/1‑118 (MQ=255) cgcgGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGt < 4:317263/149‑1 (MQ=255) ggtagtgcctcgccagggtgcagtggtcaagcaccgcttcgaggcacTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTg > 8:248269‑M2/48‑148 (MQ=255) cggcgTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGc < 6:334830/149‑1 (MQ=255) ggcgTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCa < 7:55951/149‑1 (MQ=255) cctcgccagggtgcagtggtcaagcaccgcttcgaggcacTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAg > 3:72000‑M2/41‑131 (MQ=255) cctcgccagggtgcagtggtcaagcaccgcttcgaggcacTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAg < 4:72000‑M2/91‑1 (MQ=255) ctcgccagggtgcagtggtcaagcaccgcttcgaggcacTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACcgc < 7:248269‑M2/110‑1 (MQ=255) cgatcttGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGa < 1:34971/143‑1 (MQ=255) gCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa > 4:65081/1‑89 (MQ=255) gCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCa < 3:65081/89‑1 (MQ=255) gCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAAt > 6:114730/1‑149 (MQ=255) ggTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTg < 3:25991/149‑1 (MQ=255) tGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGt < 1:1386/149‑1 (MQ=255) gCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGa > 2:34971/1‑142 (MQ=255) cTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTgc < 2:265591/149‑1 (MQ=255) aCCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGcgcg < 8:167785/148‑1 (MQ=255) aCCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGcgcg > 3:136382/1‑148 (MQ=255) ccACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAg < 1:161040/79‑1 (MQ=255) ccACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAg > 2:161040/1‑79 (MQ=255) cTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTAccc < 5:270492/149‑1 (MQ=255) tGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGTCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTg > 7:261024/1‑136 (MQ=255) tGCACCATGGCGATGCACTACATGGGCTATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGATACGGTCGGTTTCCAGTACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGAATAACCGCGTGAATTg < 8:261024/136‑1 (MQ=255) aCCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGGTGTCGATTG‑CCACATCAGGATCGTGACGGGCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTg < 4:210502/149‑1 (MQ=255) tGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGtt > 6:263641/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGttt > 5:73293/1‑149 (MQ=255) gaggcacTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGAATT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTg > 1:262297‑M2/8‑148 (MQ=255) acTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTGCAGGcc < 3:55296‑M2/147‑1 (MQ=255) cTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTGCAGGccc > 6:45842‑M2/2‑149 (MQ=255) cTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTGCAGGcc > 4:108942‑M2/2‑148 (MQ=255) tACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACAACAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGCAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTGCAGGCCca > 3:2096/1‑149 (MQ=255) | CATGCCCAGTTGGGTACCGTTCTCGGCCAGCACCTGGGCCCCAAAGGGCAGCGGTTGACCCTGGGTATCGTGCAGGGTCAGTACAAGGCGTGAAACGCGGCGTGCCTCGAAGCGGTGCTTGACCACTGCACCCTGGCGAGGCACTACCTGGGCGATGCCGTTGTCGATTT‑CCACATCAGGATCGAGACGGTCGGTTTCCAGGACCACCGAATTGGTCCGGTACGGTTGCAGGTAGGGCAAAAGTGCATAACCGCGTGAATTGGTGCGCGTACCCGTTGCGTTTTGCAGGCCCA > NC_002947/2129865‑2130157 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |