New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2409403 | 62 (1.150) | 4 (0.080) | 3/246 | NT | 6.4% | coding (2045/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
? | NC_002947 | = 2409462 | 59 (1.180) | coding (1986/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
CCACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCA > NC_002947/2409259‑2409549 | ccACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTg < 8:180769/148‑1 (MQ=255) aCGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTgcgc > 7:304576/1‑149 (MQ=255) cgcgAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGt > 5:59952/1‑148 (MQ=255) cGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTg > 2:114196/1‑149 (MQ=255) gAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATAtt > 5:253322/1‑143 (MQ=255) gAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATAtt < 6:253322/143‑1 (MQ=255) gAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAAt > 3:211416/1‑149 (MQ=255) ttGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTtg > 4:260433/1‑149 (MQ=255) gTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGC‑GGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTggc > 1:200681/1‑147 (MQ=255) gTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGC‑GGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTggc < 2:200681/147‑1 (MQ=255) tCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTggcgg > 2:225093/1‑149 (MQ=255) gCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGccc < 6:227470/148‑1 (MQ=255) cacaCCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGa > 4:51089/1‑149 (MQ=255) acacCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgc > 7:299250‑M1/1‑106 (MQ=255) acacCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGAt > 6:280872/1‑149 (MQ=255) acacCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGAt > 3:204146/1‑149 (MQ=255) acacCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCAGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGAt > 1:9045/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAAttt < 6:291586/126‑1 (MQ=255) cTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAAttt > 6:97267/1‑126 (MQ=255) cTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAAttt < 5:97267/126‑1 (MQ=255) cTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAAttt > 5:291586/1‑126 (MQ=255) ttGTTCCCGCAGGTAGCGCCCCGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTCCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCACCACCCGTGCGCCGAGAATATTGGCAAATTGTGGCGGCGGCCCGCCGAGGCCGt > 4:2260/1‑149 (MQ=255) cccGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCgaa < 6:59952/148‑1 (MQ=255) ccGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGCATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGAGGCGGGCgaag > 8:281354/1‑148 (MQ=255) cGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggc > 5:29351‑M1/1‑94 (MQ=255) cGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCgaagaa > 1:251661/1‑149 (MQ=255) gCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAAc < 2:10604/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACggt > 1:232136/1‑149 (MQ=255) ggTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACggt < 5:280872/149‑1 (MQ=255) gcCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgc < 6:207514‑M2/149‑7 (MQ=255) ccggccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctg < 1:224649‑M2/149‑9 (MQ=255) cggccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctgg < 6:29351‑M1/149‑69 (MQ=255) cggccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctgg < 8:299250‑M1/149‑69 (MQ=255) ccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATg < 2:232136/149‑1 (MQ=255) cggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGt < 3:260433/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAgg < 5:207514/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGt < 4:211416/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg > 6:242580/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg > 3:149055/1‑149 (MQ=255) ggTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg < 4:204146/148‑1 (MQ=255) tCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTgg < 2:9045/148‑1 (MQ=255) tCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg < 2:224971/147‑1 (MQ=255) gTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTAGATGTAGGTGGAGt > 5:258677/1‑148 (MQ=255) tCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCa < 5:242580/149‑1 (MQ=255) aTGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAACAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTg > 2:295790/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGACGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACGCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGCTGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGCAGTCAGCCTGc > 6:260856/1‑148 (MQ=255) gCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCt < 5:281321/143‑1 (MQ=255) gCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACACGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGTCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCt > 6:281321/1‑143 (MQ=255) tgtgGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGcc > 2:158644/1‑149 (MQ=255) tgtgGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGcc > 2:163684/1‑149 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTTAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgt < 1:114196/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgt < 4:149055/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTAGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgtg < 6:258677/149‑1 (MQ=255) tggtCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCAcc > 5:124747/1‑149 (MQ=255) gtCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTc < 8:304576/149‑1 (MQ=255) aCTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctg > 2:156442‑M2/1‑87 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(MQ=255) gcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTgc > 7:158450/1‑149 (MQ=255) agcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGATGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTgcgc < 6:340099/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccg < 6:29351‑M2/149‑82 (MQ=255) ccAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccg < 8:299250‑M2/149‑82 (MQ=255) cAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccgg < 1:224649‑M1/149‑142 (MQ=255) cAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctggcgctgctgggcgattcagt > 2:156442‑M1/1‑8 (MQ=255) cAGCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctggcgctgctgggcgattcagt < 1:156442‑M1/95‑88 (MQ=255) aGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCAcc > 8:123705/1‑149 (MQ=255) gCACCCaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccgggc < 6:207514‑M1/149‑144 (MQ=255) ccGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCa > 3:288294/1‑148 (MQ=255) | CCACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCA > NC_002947/2409259‑2409549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |