New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2409403 | 62 (1.150) | 4 (0.080) | 3/246 | NT | 6.4% | coding (2045/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
? | NC_002947 | = 2409462 | 59 (1.180) | coding (1986/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
GGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCGG > NC_002947/2409314‑2409607 | ggTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACggt < 5:280872/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACggt > 1:232136/1‑149 (MQ=255) gcCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgc < 6:207514‑M2/149‑7 (MQ=255) ccggccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctg < 1:224649‑M2/149‑9 (MQ=255) ccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATg < 2:232136/149‑1 (MQ=255) cggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGt < 3:260433/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAgg < 5:207514/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGt < 4:211416/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg > 6:242580/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg > 3:149055/1‑149 (MQ=255) ggTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg < 4:204146/148‑1 (MQ=255) tCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTgg < 2:9045/148‑1 (MQ=255) tCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTg < 2:224971/147‑1 (MQ=255) gTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTAGATGTAGGTGGAGt > 5:258677/1‑148 (MQ=255) tCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCa < 5:242580/149‑1 (MQ=255) aTGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAACAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTg > 2:295790/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGACGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACGCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGCTGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGCAGTCAGCCTGc > 6:260856/1‑148 (MQ=255) gCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCt < 5:281321/143‑1 (MQ=255) gCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACACGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGTCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCt > 6:281321/1‑143 (MQ=255) tgtgGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGcc > 2:163684/1‑149 (MQ=255) tgtgGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGcc > 2:158644/1‑149 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTTAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgt < 1:114196/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgt < 4:149055/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTAGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgtg < 6:258677/149‑1 (MQ=255) tggtCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCAcc > 5:124747/1‑149 (MQ=255) gtCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTc < 8:304576/149‑1 (MQ=255) aCTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctg < 1:156442‑M2/95‑9 (MQ=255) aCTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctg > 2:156442‑M2/1‑87 (MQ=255) aCTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGAt < 1:225093/149‑1 (MQ=255) cTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg > 5:137941/1‑149 (MQ=255) tGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGCTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATgg > 5:340099/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg > 6:218754/1‑146 (MQ=255) aaTCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg < 5:218754/146‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCt < 2:251661/149‑1 (MQ=255) tCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTg > 1:266362/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCAt > 8:34663/1‑149 (MQ=255) cagcagCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTggcg < 5:118633/121‑1 (MQ=255) cagcagCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTggcg > 6:118633/1‑121 (MQ=255) cagcagCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCAtt > 3:240690/1‑149 (MQ=255) gcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTgc > 7:158450/1‑149 (MQ=255) agcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGATGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTgcgc < 6:340099/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccg < 8:299250‑M2/149‑82 (MQ=255) ccAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccg < 6:29351‑M2/149‑82 (MQ=255) aGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCAcc > 8:123705/1‑149 (MQ=255) ccGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCa > 3:288294/1‑148 (MQ=255) gcCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccgggcgctacctgcg > 5:29351‑M2/1‑55 (MQ=255) gcCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACtt > 5:346661/1‑149 (MQ=255) cGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGTACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCg < 3:2260/149‑1 (MQ=255) cGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCg < 1:158644/149‑1 (MQ=255) cGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCg < 1:163684/149‑1 (MQ=255) cGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCg < 3:51089/149‑1 (MQ=255) atatTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTa < 4:288294/149‑1 (MQ=255) atTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTAc > 4:209257/1‑148 (MQ=255) gCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTgggtgctggcgctgctgggcgattcagtgaccaccgaccacatttcccccgccggcaacatcaagaccgacagcccggccgggcgctacctgcgggaacaaggtgt > 7:299250‑M2/1‑42 (MQ=255) gCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCtt > 3:3903/1‑149 (MQ=255) gCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCtt < 2:266362/149‑1 (MQ=255) aaTTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGTGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTtgt < 1:295790/149‑1 (MQ=255) aaTTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTtgt > 1:16520/1‑149 (MQ=255) aaTTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTtgt < 7:34663/149‑1 (MQ=255) aTTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTtgtg < 2:16520/149‑1 (MQ=255) tttGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTtgtg > 5:158984/1‑148 (MQ=255) ggcggcCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGc > 2:113785/1‑149 (MQ=255) cccGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTAt < 7:123705/149‑1 (MQ=255) cccGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGCGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTAt > 8:117885/1‑149 (MQ=255) ccgccgATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATc > 4:231140/1‑149 (MQ=255) ccgccgATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATc > 5:158796/1‑149 (MQ=255) cgATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGAcc < 3:231140/149‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCtt < 5:260856/149‑1 (MQ=255) aagaaCGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg > 3:49616/1‑72 (MQ=255) aagaaCGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg < 4:49616/72‑1 (MQ=255) gaaCGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCt < 6:158796/149‑1 (MQ=255) aCGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCg < 4:3903/149‑1 (MQ=255) cGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCgg > 3:6211/1‑149 (MQ=255) | GGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCGG > NC_002947/2409314‑2409607 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |