New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3547416 = | 47 (0.870) | 4 (0.080) | 3/252 | NT | 8.7% | coding (361/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
? | NC_002947 | 3547489 = | 39 (0.760) | coding (434/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
CGCCAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTC > NC_002947/3547269‑3547559 | ccagcgcccagatcgaatgggtcagcaagcccagcacgagcataaccaccaggcccgccacctgcgaggcaaggtcgaccaataccacgcgcttttgttcgaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaacccagaTg < 2:174621‑M1/2‑1 (MQ=255) cAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTggcc > 3:199056/1‑149 (MQ=255) cAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTggcc > 4:36821/1‑149 (MQ=255) cAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCAGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTggcc > 7:317461/1‑149 (MQ=255) gAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTggccgg > 5:34280/1‑149 (MQ=255) aaCATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTggccggc > 8:272978/1‑149 (MQ=255) aCATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTggccggcc < 1:6671/149‑1 (MQ=255) catcCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTACTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACt > 2:324910/1‑149 (MQ=255) cAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGAc < 3:36821/149‑1 (MQ=255) cgGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCgcgc < 8:317461/149‑1 (MQ=255) tCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGc > 5:111448/1‑149 (MQ=255) tCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGc < 7:122421/149‑1 (MQ=255) cGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGcc < 5:299918/148‑1 (MQ=255) gcatcaccaccaggcccgccacctgcgaggcaaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTggccg < 5:37613‑M1/6‑1 (MQ=255) gcatcaccaccaggcccgccacctgcgaggcaaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTggccg > 6:37613‑M1/109‑114 (MQ=255) caccaccaggcccgccacctgcgaggcaaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTa < 8:68435‑M1/45‑1 (MQ=255) aaCACCGCCTGGACCGTGCAGATCCTCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTCCTGCAGATGGTACTGGc > 3:142452/1‑149 (MQ=255) aaCACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCCCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTCCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGCCCCACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGc > 3:137470/1‑149 (MQ=255) acacCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCg > 1:248517/1‑149 (MQ=255) acacCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCg < 1:272693/149‑1 (MQ=255) cTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCTGTCACCg > 8:152174/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCgg < 1:78328/147‑1 (MQ=255) gACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGc < 4:199056/148‑1 (MQ=255) aCCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCt < 2:179095/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGt > 8:229536/1‑149 (MQ=255) gTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTc > 2:156258/1‑149 (MQ=255) gTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTc > 2:151055/1‑149 (MQ=255) gATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTcggcgg > 1:13286/1‑149 (MQ=255) caaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCggcggc > 7:68435‑M1/79‑149 (MQ=255) atcatcCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGa < 6:30701/118‑1 (MQ=255) atcatcCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCAGCGCCGGTACTGCCGa > 5:30701/1‑118 (MQ=255) agtgcgacaaatagcacgcgcttttgtttcaatgtgcgtaccgacacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGACG‑‑‑‑ACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCGGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 8:265043‑M1/77‑149 (MQ=255) cgcgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCt < 2:13286/148‑1 (MQ=255) cgcgGTTTACTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGAGGCCATCTg > 8:286480/1‑149 (MQ=255) gcgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTgg < 6:111448/149‑1 (MQ=255) gaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 7:218121‑M1/72‑148 (MQ=255) cgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg < 7:229536/149‑1 (MQ=255) cgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg < 2:248517/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatag < 4:31813/148‑1 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 1:151055/149‑1 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 1:156258/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGCCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagata > 1:63791/1‑145 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGCCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagata < 2:63791/145‑1 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTc < 7:196283/128‑1 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTc > 8:196283/1‑128 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGAtgtg > 8:259288/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTAc > 6:285311/1‑149 (MQ=255) ggAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg < 3:21995/109‑1 (MQ=255) ggAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg > 4:21995/1‑109 (MQ=255) cTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaa > 1:174621/1‑149 (MQ=255) gttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACaaa < 7:272978/149‑1 (MQ=255) ttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACaaaa < 7:286480/149‑1 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGt > 8:300937/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGGTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGt < 7:152174/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTg < 1:324910/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAtt > 2:110057/1‑149 (MQ=255) cTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTg > 4:93902/1‑149 (MQ=255) aGCTGTTGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTc < 4:142452/149‑1 (MQ=255) aGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTgg < 6:34280/147‑1 (MQ=255) gCTGTGGCCGGCAGACTCGACGTATGCCGGGCGGGTACTGTGGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCGATCTGGGGTTTCCAGTACACCAAGATAGATGTGGCGGTTCGCACTTTCCAACAATAGCGCGTGGTATTGGTc < 4:137470/148‑1 (MQ=255) | CGCCAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTC > NC_002947/3547269‑3547559 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |