New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3547416 = | 47 (0.870) | 4 (0.080) | 3/252 | NT | 8.7% | coding (361/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
? | NC_002947 | 3547489 = | 39 (0.760) | coding (434/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
CATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGG > NC_002947/3547340‑3547635 | agtgcgacaaatagcacgcgcttttgtttcaatgtgcgtaccgacacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGACG‑‑‑‑ACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCGGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 8:265043‑M1/77‑149 (MQ=255) cgcgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCt < 2:13286/148‑1 (MQ=255) cgcgGTTTACTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGAGGCCATCTg > 8:286480/1‑149 (MQ=255) gcgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTgg < 6:111448/149‑1 (MQ=255) gaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 7:218121‑M1/72‑148 (MQ=255) cgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg < 7:229536/149‑1 (MQ=255) cgGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg < 2:248517/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatag < 4:31813/148‑1 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 1:151055/149‑1 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 1:156258/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGCCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagata > 1:63791/1‑145 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGCCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagata < 2:63791/145‑1 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTc > 8:196283/1‑128 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTc < 7:196283/128‑1 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGAtgtg > 8:259288/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTAc > 6:285311/1‑149 (MQ=255) ggAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg < 3:21995/109‑1 (MQ=255) ggAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg > 4:21995/1‑109 (MQ=255) cTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaa > 1:174621/1‑149 (MQ=255) gttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑aaa < 7:272978/149‑1 (MQ=255) ttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑aaaa < 7:286480/149‑1 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGt > 8:300937/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGGTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGt < 7:152174/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTg < 1:324910/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTAtt > 2:110057/1‑149 (MQ=255) cTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTg > 4:93902/1‑149 (MQ=255) aGCTGTTGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTc < 4:142452/149‑1 (MQ=255) aGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTgg < 6:34280/147‑1 (MQ=255) gCTGTGGCCGGCAGACTCGACGTATGCCGGGCGGGTACTGTGGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCGATCTGGGGTTTCCAGTACACCAAGATAGATGTGGCGGTTCGCACTTTCCAAC‑‑AATAGCGCGTGGTATTGGTc < 4:137470/148‑1 (MQ=255) cagatggccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTc > 7:218121‑M2/78‑148 (MQ=255) cagatggccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatccgcagtaccggcgcggcataggtcgagtcgtccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGTCGGTACGCACATTGAAAC‑‑AAAAGCGCGTGCTATTtgtcgcact > 8:265043‑M2/74‑145 (MQ=255) gccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTg > 7:68435‑M2/72‑149 (MQ=255) GCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCg < 4:115131‑M1/106‑1 (MQ=255) GCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCg > 3:115131‑M1/1‑106 (MQ=255) CGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGcc > 3:93902‑M1/1‑149 (MQ=255) gACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGt < 3:245332/147‑1 (MQ=255) ccTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCg < 7:259288/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtg > 1:11887/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtg > 4:292535/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtg < 3:292535/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtg < 2:11887/149‑1 (MQ=255) taccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGgtggtg < 8:68435‑M2/104‑1 (MQ=255) tGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGAc < 2:193913/113‑1 (MQ=255) tGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTCTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGAc > 1:193913/1‑113 (MQ=255) tACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGc < 5:104142/149‑1 (MQ=255) ggTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTg < 7:144554/139‑1 (MQ=255) ggTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTg > 8:144554/1‑139 (MQ=255) ggTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGGGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGGGGTGATGCTCGGGCTGGGCTGGCTGa > 6:315097/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATCCACGTGCTGGGCTTGATGACCCa > 7:97315/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACTGATAAGCGGGTGGTATTGGACCCCATTGCCTCGAAGGGGGGGGGCGTGGGGGTGATGGTGGTGATGGGGTTGGTGcccct > 1:275613/1‑148 (MQ=255) ccTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGa > 1:105139/1‑149 (MQ=255) cggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGc > 6:37613‑M2/7‑114 (MQ=255) cggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGc < 5:37613‑M2/108‑1 (MQ=255) caTCTGGGTTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCGAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTTATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTgg < 2:174621‑M2/147‑1 (MQ=255) tCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGc < 4:92005/123‑1 (MQ=255) | CATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTACTGCCGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAAC‑‑AAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGG > NC_002947/3547340‑3547635 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |