New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3625930 = | 39 (0.720) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 7.3% | coding (573/939 nt) | PP_3196 | nodulation protein d1 |
? | NC_002947 | 3625996 = | 39 (0.750) | coding (507/939 nt) | PP_3196 | nodulation protein d1 |
GTACGGTGCCCACCAACAACTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGATCATCATGTCGACCTCGCCGCGC > NC_002947/3625782‑3626077 | gTACGGTGCCCACCAACAACTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGc < 5:291364/149‑1 (MQ=255) tACGGTGCCCACCAACAACTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCa < 7:68392/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCCACCAACAACTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCAt < 8:46477/148‑1 (MQ=255) gaggcgccgcagattaccttcgagatgatcggcccaggcgacagtagcgacgaattgctgatgcgcggcgaggtcgacatgatgatcgtgcccgagcgctatctcatcgagggccatccggcgcagctgctgttcgaggaagatCATg < 7:193377‑M1/4‑1 (MQ=255) caccaACAACTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCGATCTGCATGTACTGCt > 6:303007/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCa < 3:210116/149‑1 (MQ=255) cTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCa < 4:203244/149‑1 (MQ=255) cTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGATGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAgt < 4:297286/145‑1 (MQ=255) cTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGATGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAgt > 3:297286/1‑145 (MQ=255) tgggCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGa < 3:111775/148‑1 (MQ=255) ggTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTa < 1:105415/126‑1 (MQ=255) ggTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCAGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCTGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTa > 2:105415/1‑126 (MQ=255) gtgtTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGcc > 4:304681/1‑149 (MQ=255) tGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCTCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCAc < 8:183973/148‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGCTTGCGGCCAAAGCCTACCAAGATGTGGACCATCTGCATGTACAGCTCAACAGTCAGATGCTCGCACACCTCgg > 2:299246/1‑149 (MQ=255) ttGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGtt < 5:303007/149‑1 (MQ=255) tgaCTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCgcgc < 1:218384/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCAcacca > 8:58496/1‑149 (MQ=255) ttgctgatgcgcggcgaggtcgacatgatgatcgtgcccgagcgctatctcatcgagggccatccggcgcagctgctgttcgaggaagatCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACg < 6:86162‑M1/58‑1 (MQ=255) gccgATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACg > 7:15905/1‑146 (MQ=255) gATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACa < 3:311935/149‑1 (MQ=255) aaGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCca > 4:130005/1‑131 (MQ=255) aaGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCca < 3:130005/131‑1 (MQ=255) aaGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATc < 7:58496/149‑1 (MQ=255) aaGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATc > 8:280316/1‑149 (MQ=255) aGCCGTACTTGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTTTCAGATTCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCt < 1:299246/149‑1 (MQ=255) aGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCt > 1:24768/1‑149 (MQ=255) ccGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTc < 1:165024/149‑1 (MQ=255) cgaggtcgacatgatgatcgtgcccgagcgctatctcatcgagggccatccggcgcagctgctgttcgaggaagatCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTcc > 5:86162‑M1/77‑149 (MQ=255) cGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTcc > 2:36266/1‑149 (MQ=255) cGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTcc < 1:36266/149‑1 (MQ=255) gTACTGGTTCATGAACCAGTCGTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCGATCTGCATGTACTGCTc < 7:316897/87‑1 (MQ=255) gTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAAca < 7:280316/149‑1 (MQ=255) aCCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTgc < 7:200695/149‑1 (MQ=255) cTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGAt > 1:132447/1‑149 (MQ=255) ccgagcgctatctcatcgagggccatccggcgcagctgctgttcgaggaagatCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCtt < 6:307614‑M1/71‑1 (MQ=255) tCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTc > 1:262039/1‑148 (MQ=255) gTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATga < 2:24768/149‑1 (MQ=255) tGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGAt > 3:282068/1‑146 (MQ=255) tGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATgag < 3:304681/149‑1 (MQ=255) gTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAgc < 2:262039/149‑1 (MQ=255) ttGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAgcg > 8:59989/1‑149 (MQ=255) gCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGCACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCTCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCgg < 7:163854/149‑1 (MQ=255) aCCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGatcat > 2:76673/1‑149 (MQ=255) ccATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGATCATCATGTCGACCTcg > 1:192615/1‑149 (MQ=255) cATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGATCATCATGTCGACCTcgc > 4:16587/1‑149 (MQ=255) gCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGATCATCATGTCGACCTCGCcgcg > 7:29334/1‑148 (MQ=255) CATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGATCATCATGTCGACCTCGCCgcgc > 8:15905‑M1/1‑148 (MQ=255) | GTACGGTGCCCACCAACAACTGGGGCAGGGTGTTGAAGTCGTTGGTGATGACTTCCAGCCGCCGATTGAAGCCGTACTGGTTCATGAACCAGTCCTCGATGCTCAAGTGACGGTTGCGGCCAAAGCCTACCGAGATGTGGCCCATCTGCATGTACTGCTCAAGTGTCAGATGCTCGCCCACCTCGGGGTTGTCGCGCCACACCACGCAGACATGATCTTCCTCGAACAGCAGCTGCGCCGGATGGCCCTCGATGAGATAGCGCTCGGGCACGATCATCATGTCGACCTCGCCGCGC > NC_002947/3625782‑3626077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |