New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4297836 | 50 (0.930) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.7% | coding (218/822 nt) | PP_3768 | shikimate 5‑dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4297923 | 54 (1.090) | coding (131/822 nt) | PP_3768 | shikimate 5‑dehydrogenase |
CCCGGATCGACCTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGA > NC_002947/4297689‑4297976 | cccGGATCGACCTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGC < 5:133889‑M1/148‑1 (MQ=255) ccGGATCGACCTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAg > 7:260002/1‑149 (MQ=255) cGGATCTACCTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACCCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAgg < 1:79611/149‑1 (MQ=255) tCGACCTGAAGCTGAGCCAGCAATTCGCGCNCGGCCAGCAAATCGGTGTTGTACGCCTAGAGGTGGCCATTGCAATTCA‑CAAGGGTATAGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGCGATAGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTc > 1:27234/1‑149 (MQ=255) aCCTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCTATGCAGGCTTCCtt > 6:51500/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTg > 5:170101/1‑149 (MQ=255) cTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTg > 2:8707/1‑148 (MQ=255) tGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAACCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCAt > 3:6910/1‑149 (MQ=255) gAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATc > 1:324393/1‑149 (MQ=255) gCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGa < 8:256229/149‑1 (MQ=255) ccAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGa > 4:163104/1‑148 (MQ=255) ccAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGa > 3:143056/1‑148 (MQ=255) ccAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTAAGCAAGGGTATTCACCGACTCGATGGCCGCCGCGGCGGAAGCGATTTCTTCGACCAAGGCAATGCAGGATTCGTTGAACGGCAGCgc > 1:268201/1‑148 (MQ=255) cAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAg > 6:311414/1‑127 (MQ=255) gcACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCcg > 2:243645/1‑149 (MQ=255) cACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCcgc < 6:170101/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGaa < 6:41515/149‑1 (MQ=255) aGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATAcc > 4:160807/1‑149 (MQ=255) tgttgtACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCgg < 3:160807/149‑1 (MQ=255) gtACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCa > 2:155794/1‑137 (MQ=255) gtACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCa < 1:155794/137‑1 (MQ=255) tACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATcc < 8:260002/148‑1 (MQ=255) gTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCt > 1:190/1‑139 (MQ=255) gTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCt < 2:190/139‑1 (MQ=255) ccATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCAACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCgg > 2:112775/1‑149 (MQ=255) cATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGc < 4:6910/149‑1 (MQ=255) ttGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCTATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAg < 5:51500/149‑1 (MQ=255) ttGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAg < 6:23561/149‑1 (MQ=255) cAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGt > 7:51730/1‑148 (MQ=255) aaTTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCa > 1:194955/1‑149 (MQ=255) gA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCg < 2:157829/148‑1 (MQ=255) a‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCAACGGt > 3:74537/1‑149 (MQ=255) aaGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTgc < 2:324393/149‑1 (MQ=255) ccGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg > 2:194955‑M2/1‑138 (MQ=255) cGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg < 4:231254‑M2/148‑12 (MQ=255) cGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgt < 7:104637/149‑1 (MQ=255) cGACTCGAGGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttgg < 3:218799‑M1/149‑100 (MQ=255) gACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg < 6:309378‑M2/147‑12 (MQ=255) gACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgta < 2:268201/149‑1 (MQ=255) gACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgta < 4:143056/149‑1 (MQ=255) aCTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgtag > 4:103502/1‑149 (MQ=255) cTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCCGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgtag > 7:158060/1‑148 (MQ=255) gATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttg < 4:119413‑M1/142‑99 (MQ=255) gATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttg > 3:119413‑M1/1‑44 (MQ=255) gATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgtagta < 1:243645/147‑1 (MQ=255) gATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGtagtag < 3:103502/148‑1 (MQ=255) aTGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTc > 7:44072/1‑122 (MQ=255) aTGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTc < 8:44072/122‑1 (MQ=255) gccgccgccGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTc < 3:231254/149‑1 (MQ=255) cgccgccgAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc < 8:92088‑M2/133‑9 (MQ=255) cgccgccgAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc > 7:92088‑M2/1‑125 (MQ=255) gggATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAAct > 6:97174/1‑149 (MQ=255) ggATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActg > 5:127435/1‑149 (MQ=255) gATCGATTTCGTCAACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActgc < 1:112775/149‑1 (MQ=255) aTCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActgct > 1:145826/1‑149 (MQ=255) tCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActgctg < 5:309378/149‑1 (MQ=255) gATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTgg > 6:11498/1‑148 (MQ=255) aTTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg < 1:196882‑M2/120‑12 (MQ=255) aTTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg > 2:196882‑M2/1‑109 (MQ=255) cgtcgAGCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGTCACGCCGCAGCCGCGAATAGCCAGTGCGCGGATCCCTGCCTCCTGCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCATCTGCTGGTACAg < 2:27234/148‑1 (MQ=255) gtcgACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc > 4:16198‑M2/1‑104 (MQ=255) gtcgACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc < 3:16198‑M2/112‑9 (MQ=255) gACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAggtggt > 4:189224/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccctcgagtcg < 3:218799‑M2/149‑51 (MQ=255) cAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatcgagtcgg > 2:194955‑M1/1‑11 (MQ=255) cAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatcgagtcg < 4:231254‑M1/148‑138 (MQ=255) cAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatcgagtc < 6:309378‑M1/147‑137 (MQ=255) cAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaat > 2:196882‑M1/1‑11 (MQ=255) cAAGGCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaat < 1:196882‑M1/120‑110 (MQ=255) cAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatc > 3:119413‑M2/1‑98 (MQ=255) cAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatc < 4:119413‑M2/142‑45 (MQ=255) cAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTTGTACAGGTGGTtgt < 3:163104/149‑1 (MQ=255) aaGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTtgtg < 6:127435/149‑1 (MQ=255) ggCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcg > 7:92088‑M1/1‑8 (MQ=255) ggCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcg < 8:92088‑M1/133‑126 (MQ=255) ggCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgac < 3:16198‑M1/112‑105 (MQ=255) ggCCATGCgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgggtattcgcggctgcggggtgtcgatgccgtacaaggaagcctgcatggccttggtcgac > 4:16198‑M1/1‑8 (MQ=255) gCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGa > 8:79043/1‑147 (MQ=255) | CCCGGATCGACCTGATGCTGAGCCAGCAATTGGCGCACGGCCAGGTAATCGGTGTTGTACGCCTTGAGGTGGCCATTGCAATTGA‑CAAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGA > NC_002947/4297689‑4297976 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |