New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4297836 | 50 (0.930) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.7% | coding (218/822 nt) | PP_3768 | shikimate 5‑dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4297923 | 54 (1.090) | coding (131/822 nt) | PP_3768 | shikimate 5‑dehydrogenase |
AAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTG > NC_002947/4297775‑4298066 | aaGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTgc < 2:324393/149‑1 (MQ=255) ccGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg > 2:194955‑M2/1‑138 (MQ=255) cGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg < 4:231254‑M2/148‑12 (MQ=255) cGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgt < 7:104637/149‑1 (MQ=255) gACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg < 6:309378‑M2/147‑12 (MQ=255) gACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgta < 4:143056/149‑1 (MQ=255) gACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgta < 2:268201/149‑1 (MQ=255) aCTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgtag > 4:103502/1‑149 (MQ=255) cTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCCGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgtag > 7:158060/1‑148 (MQ=255) gATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTgtagta < 1:243645/147‑1 (MQ=255) gATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGtagtag < 3:103502/148‑1 (MQ=255) gccgccgccGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTc < 3:231254/149‑1 (MQ=255) cgccgccgAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc > 7:92088‑M2/1‑125 (MQ=255) cgccgccgAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc < 8:92088‑M2/133‑9 (MQ=255) gggATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAAct > 6:97174/1‑149 (MQ=255) ggATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActg > 5:127435/1‑149 (MQ=255) gATCGATTTCGTCAACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActgc < 1:112775/149‑1 (MQ=255) aTCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActgct > 1:145826/1‑149 (MQ=255) tCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAActgctg < 5:309378/149‑1 (MQ=255) gATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTgg > 6:11498/1‑148 (MQ=255) aTTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg > 2:196882‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttg < 1:196882‑M2/120‑12 (MQ=255) cgtcgAGCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGTCACGCCGCAGCCGCGAATAGCCAGTGCGCGGATCCCTGCCTCCTGCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCATCTGCTGGTACAg < 2:27234/148‑1 (MQ=255) gtcgACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc > 4:16198‑M2/1‑104 (MQ=255) gtcgACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggcc < 3:16198‑M2/112‑9 (MQ=255) gACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAggtggt > 4:189224/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccctcgagtcg < 3:218799‑M2/149‑51 (MQ=255) cAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatc > 3:119413‑M2/1‑98 (MQ=255) cAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCgcatggccttggtcgacgaaatcgatccctcggcggcggccatc < 4:119413‑M2/142‑45 (MQ=255) cAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTTGTACAGGTGGTtgt < 3:163104/149‑1 (MQ=255) aaGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTtgtg < 6:127435/149‑1 (MQ=255) gCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGa > 8:79043/1‑147 (MQ=255) ccTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGaa < 1:8707/148‑1 (MQ=255) gttGTACGGCATCGACACACCGGAGCCGCGAATACCGAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCATCTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑g < 8:158060/147‑1 (MQ=255) cTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑g < 5:226907/148‑1 (MQ=255) cTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGCCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑gg > 2:210763/1‑149 (MQ=255) ttGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCAAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGt > 3:299861/1‑149 (MQ=255) tACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGcc > 6:326043/1‑149 (MQ=255) cGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCgg < 8:51730/149‑1 (MQ=255) ggCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCggg < 2:145826/149‑1 (MQ=255) gCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCgggg < 3:189224/149‑1 (MQ=255) aTCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGc > 8:279057/1‑148 (MQ=255) gACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAATGATGCCGGGGCGAc > 1:287493/1‑149 (MQ=255) tcacCCGGAAGCCGCGAATTCCCAGGGCGCGGATCCCTGCCAGCGCCGCAGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCTGGCCTAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCTCGCCGAA‑GGTGCCGGGGGGACCg < 4:299861/148‑1 (MQ=255) acacCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCg > 3:232085/1‑149 (MQ=255) acCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGc < 5:97174/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGc > 4:36716/1‑147 (MQ=255) cccGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCa < 7:79043/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCa < 7:279057/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGAt > 5:80620/1‑149 (MQ=255) tACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCg > 7:304664/1‑131 (MQ=255) tACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCg < 8:304664/131‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCGTGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACg > 1:245696/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCaaa < 6:60037/144‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCaaa > 5:60037/1‑144 (MQ=255) ccAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACg > 5:262400/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGgt > 8:48464/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGgt < 7:236007/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGgt > 7:77298/1‑149 (MQ=255) tCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTg < 3:36716/149‑1 (MQ=255) ccTGCCACCGCCGCCGGCTGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACGGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTgg < 4:74537/148‑1 (MQ=255) cTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTgg > 4:292267/1‑147 (MQ=255) cTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGa < 3:292267/149‑1 (MQ=255) cTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGa < 5:11498/149‑1 (MQ=255) ccACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGATGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGtt > 1:240499/1‑149 (MQ=255) cACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACg > 5:264880/1‑130 (MQ=255) cACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACg < 6:264880/130‑1 (MQ=255) aCCGCCGCCGGCAGGTGATGGGTGCTCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGt < 4:232085/149‑1 (MQ=255) aGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCACGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAgg > 7:183843/1‑149 (MQ=255) tCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTc > 5:79504/1‑149 (MQ=255) aTCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCt > 8:124138/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCtt < 6:262400/149‑1 (MQ=255) cGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTg > 6:342572/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTg < 5:342572/148‑1 (MQ=255) | AAGGGTATTGACCGACTCGATGGCCGCCGCCGAGGGATCGATTTCGTCGACCAAGGCCATGCAGGCTTCCTTGTACGGCATCGACACCCCGCAGCCGCGAATACCCAGGGCGCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAA‑GGTGCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTG > NC_002947/4297775‑4298066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |