New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4694701 = | 34 (0.630) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 11.8% | coding (2576/2931 nt) | PP_4154 | class 3 aminotransferase |
? | NC_002947 | 4694725 = | 27 (0.520) | coding (2600/2931 nt) | PP_4154 | class 3 aminotransferase |
CCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTG > NC_002947/4694556‑4694849 | gtgcggtcgcgcaccagttccagacccaggtagaagcccgagccatgtgccgcgccggccagcgggtgcttgtcgaccagcgcctgcaggcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGCAt > 8:277851‑M1/146‑149 (MQ=255) ccGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCAt < 4:259429/149‑1 (MQ=255) ggACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATgg > 6:41540/1‑149 (MQ=255) gACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATgg > 7:247561/1‑148 (MQ=255) atTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGc < 5:81045/148‑1 (MQ=255) ttACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTg > 3:265418/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTGTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCTTGGCAGTGCTGGa < 8:84468/148‑1 (MQ=255) ccATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGAt > 5:339534/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGAt > 3:172178/1‑149 (MQ=255) cATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATg > 3:9548/1‑149 (MQ=255) gCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCAt < 4:265418/149‑1 (MQ=255) ggCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCagga < 4:172178/149‑1 (MQ=255) gggTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAg > 4:156759/1‑149 (MQ=255) ggTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAg < 3:299637/148‑1 (MQ=255) gTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGc > 8:150888/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCTCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACaa < 5:330133/149‑1 (MQ=255) gTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGacac > 2:169484/1‑149 (MQ=255) gTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGacac > 8:7018/1‑149 (MQ=255) tcaCCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCggg < 7:150888/149‑1 (MQ=255) aCCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGgcg > 5:42790/1‑149 (MQ=255) gTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTAc < 2:285154/149‑1 (MQ=255) gcttgtcgaccagcgcctgcaggcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCagga > 7:131928‑M1/79‑106 (MQ=255) gcttgtcgaccagcgcctgcaggcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCagga < 8:131928‑M1/28‑1 (MQ=255) gAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCaa < 2:147752/149‑1 (MQ=255) gAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCaa < 3:156759/149‑1 (MQ=255) aaaTCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAg < 4:9548/149‑1 (MQ=255) aaaTCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAg < 8:247561/149‑1 (MQ=255) ccagcgcctgcaggcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCaggagg < 3:217727‑M1/30‑1 (MQ=255) ccagcgcctgcaggcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCaggagg > 4:217727‑M1/70‑99 (MQ=255) tGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTCCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGgcg > 4:114592/1‑149 (MQ=255) gcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGc < 8:64909‑M1/2‑1 (MQ=255) gcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctGc > 7:64909‑M1/57‑58 (MQ=255) ccGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTc < 5:41540/149‑1 (MQ=255) ccGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTc < 6:339534/149‑1 (MQ=255) ggCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACaa < 1:169484/149‑1 (MQ=255) tcttctCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCCAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGCCAAGCACCCg > 4:214655/1‑149 (MQ=255) tcttctCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCg > 6:168366/1‑149 (MQ=255) tcctcGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGc > 3:110960/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACAt < 5:168366/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCgg > 2:123200/1‑131 (MQ=255) ttGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTc > 4:317520/1‑148 (MQ=255) gCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTg > 4:100949/1‑149 (MQ=255) cATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGTCACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTgg > 4:288989/1‑149 (MQ=255) cATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTgg > 3:270234/1‑149 (MQ=255) GCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTg < 2:59142‑M1/149‑1 (MQ=255) GCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCAGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTg < 5:270183‑M1/149‑1 (MQ=255) | CCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTG > NC_002947/4694556‑4694849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |