| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 680757 | 59 (1.100) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 6.5% | coding (277/780 nt) | PP_0583 | AraC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 680812 | 59 (1.140) | coding (332/780 nt) | PP_0583 | AraC family transcriptional regulator | |||||
CCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGTTGCCCCGCCAC > NC_002947/680666‑680957 | cccACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTgg < 8:173670‑M2/149‑3 (MQ=255) aGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAg < 5:187903/149‑1 (MQ=255) gTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGc < 4:252403/149‑1 (MQ=255) gggTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATc < 8:253722/149‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATc > 1:5837/1‑148 (MQ=255) ggTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATc < 2:5837/148‑1 (MQ=255) tgtgGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAg < 6:112715/149‑1 (MQ=255) tgtgGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAg < 7:105814/149‑1 (MQ=255) tgGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAg > 1:205903/1‑147 (MQ=255) ccccGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCt > 6:173534/1‑149 (MQ=255) ccgccgATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGc < 4:237555/149‑1 (MQ=255) gccgATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCt < 7:173670/149‑1 (MQ=255) gAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCcggc > 3:97625/1‑149 (MQ=255) aTGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGAt < 4:97625/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTa > 5:24299/1‑149 (MQ=255) tGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTAcc > 5:133536/1‑147 (MQ=255) tGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCa < 3:91262/149‑1 (MQ=255) gTCACCTCGATGCAAGCCTAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGACGCGATGCCTGCACATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCAGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCaga < 4:318835/149‑1 (MQ=255) gTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCa < 5:150958/119‑1 (MQ=255) gTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCa > 6:150958/1‑119 (MQ=255) gTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCa > 2:43910/1‑147 (MQ=255) cACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCagag > 6:97776/1‑148 (MQ=255) aCCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGga > 5:15258/1‑149 (MQ=255) cTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGACTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCAATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGAAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCagagtcc > 7:211472/1‑145 (MQ=255) tCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGgacga > 3:295017/1‑149 (MQ=255) gATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGgacgac < 3:319054/148‑1 (MQ=255) gATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGgacga > 8:77441/1‑147 (MQ=255) aTGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCagag > 7:215743/1‑141 (MQ=255) aTGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCagag < 8:215743/141‑1 (MQ=255) cAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAgcgc < 7:77441/149‑1 (MQ=255) gCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGcc > 3:169707/1‑147 (MQ=255) ccGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAg < 6:15258/149‑1 (MQ=255) cGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAgg < 1:43910/149‑1 (MQ=255) gagaTGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGgc < 2:30151/149‑1 (MQ=255) agaTGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGgcg < 5:97776/149‑1 (MQ=255) cgcAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGAc < 2:42212/148‑1 (MQ=255) cgcAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGAc < 4:295017/148‑1 (MQ=255) aGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTggcgcacgtacaggctgcgcatctcggcttgcatcgaggtgaccacttcatgctcggcatcggcggggatccacaccc < 5:272481‑M2/149‑79 (MQ=255) ccTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGATAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAg > 8:227949/1‑149 (MQ=255) gTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCgg > 6:130131/1‑149 (MQ=255) tACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGt < 5:173534/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTggcgcacgtacaggctgcgcatctcggcttgcatcgaggtgaccacttcatgctcggcatcggcggggatccacaccccccactgcg < 4:92492‑M2/149‑88 (MQ=255) gccgcGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTggcgcacgtacaggctgcgcatctcggcttgcatcgaggtgaccacttcatgctcggcatcggcggggatccacaccccccactgcggtgg > 6:272481‑M2/1‑58 (MQ=255) gcgATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGAt > 7:39037/1‑149 (MQ=255) cccATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTgcgc < 2:337584/148‑1 (MQ=255) gggCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTg > 6:155971/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTg < 2:205903/148‑1 (MQ=255) ggCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGc > 6:64128/1‑149 (MQ=255) cGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCgg > 3:63877/1‑147 (MQ=255) cAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCgg < 3:2569/149‑1 (MQ=255) aaTGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGt > 2:183334/1‑149 (MQ=255) ccGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGATAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGtttt < 7:227949/148‑1 (MQ=255) ccGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGgc > 3:231890/1‑93 (MQ=255) ccGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGgc < 4:231890/93‑1 (MQ=255) cGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTc > 6:19556/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTc > 4:245209/1‑149 (MQ=255) gggTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGtt < 6:213925/121‑1 (MQ=255) gggTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCg < 8:39037/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGc < 3:245209/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGc < 6:133536/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGt > 3:82186/1‑149 (MQ=255) aGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGTTGc < 6:24299/149‑1 (MQ=255) gTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGCCAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCTGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGTTGcc > 3:220108/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCTggcgcacgtacaggctgcgcatctcggcttgcatcgaggtgaccacttcatgctcggcatcggcggggatccacaccccccactgcggtggggcaaagtaactgccgtcgcgtgtgtacacgccgagtacgccgctgatgg > 3:92492‑M2/1‑8 (MQ=255) cgccgcTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGTTGCCCCGc < 5:155971/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGTTGCCCCGCCAc > 5:81043/1‑149 (MQ=255) | CCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCGAGCTGATCAAGCAGTTCTGCCTGTTCCCGGCGGATTACCCAGAGGACGACAGCGCCGAGGCGCGACTGGTAGCGGTGCTGCTCGATCAGTTGCGCAGCTTGCCGGAAGTCGGTTTTTCGCTGCCGTTGCCCCGCCAC > NC_002947/680666‑680957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |