New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1095604 = | 58 (1.080) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 6.7% | coding (457/1494 nt) | rpoN | RNA polymerase sigma‑54 factor |
? | NC_002947 | 1095665 = | 56 (1.100) | coding (396/1494 nt) | rpoN | RNA polymerase sigma‑54 factor |
GCAGATTTCTTCGAGTGTGTCTTCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCGGCGCTGACG > NC_002947/1095518‑1095812 | tcgataccgcttgggaagacatctaccagaccagcgccagcagcctgccgagcaacgatgacgacgaatgggacttcaccacgcgcACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTgc > 5:295119‑M1/87‑149 (MQ=255) gataccgcttgggaagacatctaccagaccagcgccagcagcctgccgagcaacgatgacgacgaatgggacttcaccacgcgcACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTgcgc > 5:345124‑M1/85‑149 (MQ=255) ttcGAGTGTGTCTTCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCCGACATCGGTGCAAGGT‑TCAAATGCCACAGCAGGTGGGTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATTTCCGCgtggtg > 8:54583/1‑148 (MQ=255) cGAGTGTGTCTTCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGaa < 4:215890/148‑1 (MQ=255) gAGTGTGTCTTCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGt > 4:277938/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAg < 1:204888/139‑1 (MQ=255) ttCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAg > 2:204888/1‑139 (MQ=255) ttCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATtcgt > 5:49951/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGTAGCCCT‑GCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATtcgtc > 4:152013/1‑149 (MQ=255) ccAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATtcgtcg > 1:326049/1‑149 (MQ=255) cAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTgc > 6:204166/1‑125 (MQ=255) cAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTgc < 5:204166/125‑1 (MQ=255) ggTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCa < 5:311472/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATtcgt > 6:54989/1‑140 (MQ=255) gCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATtcgt < 5:54989/140‑1 (MQ=255) tGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTg > 5:148849/1‑147 (MQ=255) tGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTg < 6:148849/147‑1 (MQ=255) gCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTc < 4:296060/148‑1 (MQ=255) gTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCgg > 7:188645/1‑147 (MQ=255) gTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCa < 6:49951/149‑1 (MQ=255) gTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCa < 7:54583/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGgct > 7:182475/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGTGTCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGctgctg > 1:259338/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTgg > 7:206382/1‑149 (MQ=255) gATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTc > 4:281078/1‑133 (MQ=255) gATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGgcg < 2:32311/148‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGct > 5:319295/1‑149 (MQ=255) gggTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtc > 6:94142/1‑149 (MQ=255) ggTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGgcgc > 4:130682/1‑143 (MQ=255) ggTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGgcgc < 3:130682/143‑1 (MQ=255) ggTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtct < 4:12718/149‑1 (MQ=255) ggTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtct > 7:66899/1‑149 (MQ=255) gTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtctg > 1:200442/1‑149 (MQ=255) tCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtctgg < 3:277938/149‑1 (MQ=255) tCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtctgg < 8:206382/149‑1 (MQ=255) ggCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGctggtctgg > 3:92452/1‑145 (MQ=255) aaTCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGt < 5:94142/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTc < 2:200442/149‑1 (MQ=255) aGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTcc > 2:310550/1‑149 (MQ=255) ggtcggtGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGTTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCaa < 8:182475/149‑1 (MQ=255) gtcggtGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTa > 7:233034/1‑135 (MQ=255) gtcggtGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTa < 8:233034/135‑1 (MQ=255) gcgcacatcggccggcgaaagcctgcaaagccacctgctgtggcagttgaacctggcaccgatgtGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATc > 5:345124‑M2/66‑149 (MQ=255) ggACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGa > 7:67572/1‑149 (MQ=255) gcacatcggccggcgaaagcctgcaaagccacctgctgtggcagttgaacctggcaccgatgtGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGa > 5:295119‑M2/64‑149 (MQ=255) catcggccggcgaaagcctgcaaagccacctgctgtggcagttgaacctggcaccgatgtGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCg < 6:345124‑M2/89‑1 (MQ=255) ATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCgg > 2:259338‑M1/1‑149 (MQ=255) ATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCgg < 4:327201‑M1/149‑1 (MQ=255) TCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCggg > 1:310550‑M1/1‑149 (MQ=255) GGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGa > 8:188645‑M1/1‑148 (MQ=255) ccAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCg > 3:277739/1‑149 (MQ=255) ggT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTg < 2:326049/149‑1 (MQ=255) gT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTgg < 4:92452/149‑1 (MQ=255) t‑tCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTAt > 2:117607/1‑130 (MQ=255) cAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTgggg < 3:152013/148‑1 (MQ=255) cAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGa > 8:54602/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGAt < 6:319295/149‑1 (MQ=255) aCTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGAc < 7:209740/130‑1 (MQ=255) aCTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGAc > 8:209740/1‑130 (MQ=255) cTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATgc > 3:261582/1‑149 (MQ=255) ccACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGcgct > 1:115178/1‑149 (MQ=255) cctgctgtggcagttgaacctggcaccgatgtGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCa < 6:295119‑M2/117‑1 (MQ=255) cTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCAcc < 4:261582/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGt > 5:69492/1‑149 (MQ=255) gCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTc < 8:66899/148‑1 (MQ=255) gCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCt > 1:41049/1‑149 (MQ=255) ggCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTcc < 6:69492/149‑1 (MQ=255) tttCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAgg > 2:295397/1‑149 (MQ=255) gccggccgATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGt > 6:262251/1‑149 (MQ=255) cggccgATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGTTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCg > 5:23217/1‑149 (MQ=255) cgatgtGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCGgcgc > 5:66883‑M2/7‑149 (MQ=255) tgtGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCGGCGCTGa < 3:327201‑M2/146‑1 (MQ=255) tGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCGGCGCTGACg < 3:321550‑M2/148‑1 (MQ=255) tGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCGGCGCTGACg < 8:67572‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCAGATTTCTTCGAGTGTGTCTTCCAGGTAGCCCTGGCCGTTGATGCTGTCGATCAGGGTCACGGCAATCAAGCGGTCGGTGTCGGACATCGGTGCCAGGT‑TCAACTGCCACAGCAGGTGGCTTTGCAGGCTTTCGCCGGCCGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCCATTCGTCGTCATCGTTGCTCGGCAGGCTGCTGGCGCTGGTCTGGTAGATGTCTTCCCAAGCGGTATCGACCGGGAGCTCGTTGGGGATGCGCTCGCTCCACTCACCGTCTTCCAGGTTGTCGGCGCTGACG > NC_002947/1095518‑1095812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |