New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1775743 | 33 (0.610) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 8.7% | coding (923/1077 nt) | PP_1582 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1775769 | 32 (0.630) | coding (949/1077 nt) | PP_1582 | hypothetical protein |
CGAAATGCCGCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGCCAGACCTACCCA > NC_002947/1775625‑1775915 | cGAAATGCCGCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGATGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGcc < 4:223077‑M2/147‑3 (MQ=255) ccGCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGgccgc < 4:108022/148‑1 (MQ=255) gCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCaa < 1:248394/149‑1 (MQ=255) gCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCaa < 8:202742/149‑1 (MQ=255) gCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCaa > 6:128465/1‑149 (MQ=255) aCTTGTCCCGTATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATg < 5:4263/149‑1 (MQ=255) cTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATgg < 5:294611/149‑1 (MQ=255) tCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGaa < 1:96191/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCg > 1:166642/1‑149 (MQ=255) cttcGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATg > 1:137120/1‑149 (MQ=255) gTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAAt < 1:199153/149‑1 (MQ=255) tACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTgg > 5:35409/1‑149 (MQ=255) cGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGGCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGc < 8:78697/148‑1 (MQ=255) ggTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAgg < 4:296177/148‑1 (MQ=255) gTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCt > 7:309014/1‑149 (MQ=255) ttGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTg < 2:166642/149‑1 (MQ=255) tACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTc < 3:223077/149‑1 (MQ=255) tACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTc < 1:186714/149‑1 (MQ=255) tACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTc < 5:128465/149‑1 (MQ=255) ggCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTg > 8:214229/1‑149 (MQ=255) cgacTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGTGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTAc > 4:307945/1‑149 (MQ=255) gacTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTAc > 4:271206/1‑148 (MQ=255) tctTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACctgc > 1:171590/1‑149 (MQ=255) gggCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGa > 3:133566/1‑149 (MQ=255) ggCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGAc > 4:121840/1‑149 (MQ=255) ctctTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATc < 4:82920/149‑1 (MQ=255) tctTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGcccaggccaagaggatcgccctcttcataagagtcggtcgccgggttgtaccaacctaggcggtcgtaggttgaaggaccgaagaacacccgcccatccgggacaagtgcg < 1:151889‑M2/149‑112 (MQ=255) tctTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATc > 7:26845/1‑148 (MQ=255) ttGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGcccaggccaagaggatcgccctcttcataagagtcggtcgccgggttgtaccaacctaggcggtcgtaggttgaaggaccgaagaacacccgcccatccgggacaagtgcgg < 3:116122‑M2/148‑113 (MQ=255) ttGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAg > 4:238346/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGt < 7:214229/148‑1 (MQ=255) gCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGcccaggccaagaggatcgccctcttcataagagtcggtcgccgggttgtaccaacctaggcggtcgtaggttgaaggaccgaagaacacccgcccatccgggacaagtgcggcatt < 4:237429‑M2/149‑117 (MQ=255) gTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATc > 2:34875/1‑149 (MQ=255) tCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATc > 1:184204/1‑148 (MQ=255) tCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCg > 3:180275/1‑149 (MQ=255) aGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGc < 8:26845/149‑1 (MQ=255) gTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGcc > 5:23164/1‑149 (MQ=255) gTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGc > 3:179463/1‑148 (MQ=255) tttGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGc > 7:173933/1‑147 (MQ=255) ccGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGCCAGAc < 4:180275/148‑1 (MQ=255) tATTGcccaggccaagaggatcgccctcttcataagagtcggtcgccgggttgtaccaacctaggcggtcgtaggttgaaggaccgaagaacacccgcccatccgggacaagtgcggcatttcggaacttggcgccgccggcaggcgct > 3:237429‑M2/1‑5 (MQ=255) ttGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGCCAGACCTAcc > 4:112732/1‑147 (MQ=255) ttGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGCCAGACCTACCCa < 3:271206/149‑1 (MQ=255) | CGAAATGCCGCACTTGTCCCGGATGGGCGGGTGTTCTTCGGTCCTTCAACCTACGACCGCCTAGGTTGGTACAACCCGGCGACCGACTCTTATGAAGAGGGCGATCCTCTTGGCCTGGGAAGCGTGGTCAAGTTTGCCGGTATTGCCCAGGCCGCCAATGGAGAACTGATCCTCGCCCCCCATGTAAATGAGGCGGTTGGCCGCATCAAGGCTGTTTCCGCTGGTGCGCTACCTGCTGCAGCGATGACCAGTATCCAGTGGAACAAGAACTGATCGAGCCAGACCTACCCA > NC_002947/1775625‑1775915 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |