New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2358022 | 50 (0.930) | 4 (0.080) | 3/254 | NT | 8.2% | coding (289/825 nt) | PP_2072 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 2358062 | 41 (0.790) | coding (249/825 nt) | PP_2072 | AraC family transcriptional regulator |
TGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATCGTGGCGATGCGGGTCGTAGC > NC_002947/2357919‑2358210 | tGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGccggc < 1:179555‑M2/149‑6 (MQ=255) tACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCa > 2:59168/1‑149 (MQ=255) cGAACGCTTCGCTGGTGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATg > 2:146379/1‑149 (MQ=255) gAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGc > 8:8815/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCAt > 1:200842/1‑149 (MQ=255) gTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCg > 8:169197/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTg > 7:79815/1‑147 (MQ=255) gcgGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTgcag > 7:151498/1‑148 (MQ=255) gggTCGCTGGACAGGCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCAc > 1:127343/1‑149 (MQ=255) cTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCgt > 2:119797/1‑149 (MQ=255) gACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGtt < 1:146379/149‑1 (MQ=255) cccGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCg < 8:214904/149‑1 (MQ=255) tGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTgg > 3:249724/1‑149 (MQ=255) gAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGgc > 3:246299/1‑149 (MQ=255) gggCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGgcg > 2:78190/1‑147 (MQ=255) ggCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAg > 2:257008/1‑149 (MQ=255) gCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGc < 2:200842/149‑1 (MQ=255) aaaGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCg > 1:58090/1‑148 (MQ=255) cTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGGGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCt < 7:236393/149‑1 (MQ=255) tGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGAGGCGCAGCGAACCCtt > 1:168778/1‑149 (MQ=255) tGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTACGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCCTGACGCAGCGAACCCtt > 3:126340/1‑149 (MQ=255) accaccCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCtt < 8:79815/147‑1 (MQ=255) accaccCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTg < 2:58090/148‑1 (MQ=255) caccCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTaa < 3:254988/149‑1 (MQ=255) cccAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATg > 3:70911/1‑149 (MQ=255) ccAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATgg < 8:175961/149‑1 (MQ=255) ccAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATg > 4:117996/1‑148 (MQ=255) cAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCa < 6:19149/71‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCa > 5:19149/1‑71 (MQ=255) aGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGaa < 1:78190/149‑1 (MQ=255) cACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGc < 1:59168/149‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTg < 4:246299/149‑1 (MQ=255) cTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGc < 2:179555/148‑1 (MQ=255) gATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCacac > 8:155502/1‑149 (MQ=255) tCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCg > 7:163178/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGccggcactgatccagaacgtgctgggtggtcagcctttgcccttcatcgctggcgggctgtccagcgacccgcgtctgtaccacgccagcgaagcgttcgta < 4:76981‑M2/149‑103 (MQ=255) gTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGccggcactgatccagaacgtgctgggtggtcagcctttgcccttcatcgctggcgggctgtccagcgacccgcgtct > 6:303015‑M2/1‑47 (MQ=255) gTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGccggcactgatccagaacgtgctgggtggtcagcctttgcccttcatcgctggcgggctgtccagcgacccgcgtct < 5:303015‑M2/124‑78 (MQ=255) tGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCa < 1:119797/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGc < 2:299676/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGc < 2:127343/149‑1 (MQ=255) gggTCGACGTAGGTCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGc < 1:35338/100‑1 (MQ=255) gggTCGACGTAGGTCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGc > 2:35338/1‑100 (MQ=255) ggTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTa < 4:249724/149‑1 (MQ=255) gACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGccggcactgatccagaacgtgctgggtggtcagcctttgcccttcatcgctggcgggctgtccagcgacccgcgtctgtaccacgccagcgaagcgttcgtacaggcagtg > 3:76981‑M2/1‑37 (MQ=255) gTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGa < 8:151498/149‑1 (MQ=255) tGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAg < 4:70911/149‑1 (MQ=255) cGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGt < 3:117996/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTa > 2:287664/1‑149 (MQ=255) cGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATCGTGGCGATGCgg < 1:287664/148‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATCGTGGCGATGCgg < 4:204992/148‑1 (MQ=255) tGCCGGTCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATCGTGGCGATGCGGGTCGTAg > 4:329677/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGATATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATCGTGGCGATGCGGGTCGTAGc > 7:104019/1‑149 (MQ=255) | TGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATCGTGGCGATGCGGGTCGTAGC > NC_002947/2357919‑2358210 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |