New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2686506 | 54 (1.000) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 6.6% | coding (1216/2388 nt) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 2686544 | 60 (1.150) | coding (1178/2388 nt) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
AGGTTATTGAAGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGC > NC_002947/2686397‑2686689 | aGGTTATTGAAGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTc > 8:177829‑M2/1‑148 (MQ=255) gTTATTGAAGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgc < 2:96959‑M2/149‑4 (MQ=255) aTTGAAGTCCTGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCgcgc < 7:146121/148‑1 (MQ=255) tGAAGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGcgctcg > 7:125260/1‑149 (MQ=255) gAAGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGcgctcg < 1:96959/148‑1 (MQ=255) aaGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGcgctcgct > 1:58489/1‑149 (MQ=255) aGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGTGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTg < 4:240832/149‑1 (MQ=255) tGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGAt > 2:278119/1‑149 (MQ=255) gcgcCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTAGATGAGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCACGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATg > 7:49464/1‑149 (MQ=255) cgccacgccaGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGt < 2:173925/149‑1 (MQ=255) gccacgccaGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgc > 1:303267‑M2/1‑130 (MQ=255) gccacgccaGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgc < 2:303267‑M2/133‑4 (MQ=255) cacgccaGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTcgc > 8:142407/1‑149 (MQ=255) acgccaGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTcgcg > 5:304650/1‑149 (MQ=255) gccaGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTg < 4:208055/149‑1 (MQ=255) cGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGccacca > 5:19652/1‑149 (MQ=255) gTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTa < 1:278119/148‑1 (MQ=255) gTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTAc < 2:58489/149‑1 (MQ=255) ttGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACa < 7:142407/149‑1 (MQ=255) cccAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGc > 1:72108/1‑148 (MQ=255) ccAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTT‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGc > 7:237005/1‑147 (MQ=255) ccAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCCCCACGTACAGc > 8:304265/1‑147 (MQ=255) ccAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGc > 7:72476/1‑147 (MQ=255) aaCCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAgg < 8:123117/149‑1 (MQ=255) aCCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGACTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGTTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGgt < 8:49464/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGgtg > 5:295024/1‑149 (MQ=255) cGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTcgc > 2:144685/1‑125 (MQ=255) cGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGgtgt < 8:125260/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGtcc < 7:1509/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGtcctc > 6:124354/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGtcctc < 8:72476/148‑1 (MQ=255) aGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCCCCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCgg > 5:252877/1‑149 (MQ=255) gCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGcac > 4:328077/1‑148 (MQ=255) tgctgcAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCAccaccca > 4:295000/1‑149 (MQ=255) tgctgcAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCAccaccca > 4:165598/1‑149 (MQ=255) gagCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGAcagc < 6:252877/149‑1 (MQ=255) gCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGAcagcca < 6:304650/149‑1 (MQ=255) cTCGATGCGCTCGCGCTCGATGATCTCTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCATGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACCTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAgcgc > 1:84699/1‑149 (MQ=255) tCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTg > 7:88753/1‑149 (MQ=255) gATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGtt < 8:88753/149‑1 (MQ=255) gATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGtt > 3:299428/1‑149 (MQ=255) aTGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTg < 6:295024/149‑1 (MQ=255) tcgcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGt < 8:204402/141‑1 (MQ=255) tcgcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGt > 7:204402/1‑141 (MQ=255) gctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCa > 5:131708/1‑149 (MQ=255) gTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATg < 6:19652/147‑1 (MQ=255) gTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATg > 8:205716/1‑147 (MQ=255) gTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCa < 3:165598/149‑1 (MQ=255) gccaacgcgcgGCTGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGtt > 8:185741/6‑128 (MQ=255) gccaacgcgcgGCTGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGtt < 7:185741/123‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgcgaacagatcaacgagcgcgagcgcatcgaggccgctctgcagcagatgcagcggctggaagcggttgggcaactaacggctggcgtggcgcatgacttcaa < 2:335460‑M2/149‑105 (MQ=255) ttCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgcgaacagatcaacgagcgcgagcgcatcgaggccgctctgcagcagatgcagcggctggaagcggttgggcaactaacggctggcgtggcgcatgacttcaa < 4:30620‑M2/148‑105 (MQ=255) ttCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGgcc < 4:314072/129‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGc < 5:124354/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGc > 5:319008/1‑146 (MQ=255) gcgcAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGc < 6:319008/146‑1 (MQ=255) cgcAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGa > 6:193961/1‑148 (MQ=255) aGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgcgaacagatcaacgagcgcgagcgcatcgaggccgctctgcagcagatgcagcggctggaagcggttgggcaactaacggctggcgtggcgcatgacttcaataacctgc > 3:30620‑M2/1‑37 (MQ=255) gcgcgTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAgcgc > 5:244377/1‑149 (MQ=255) gcgTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTcgcgaacagatcaacgagcgcgagcgcatcgaggccgctctgcagcagatgcagcggctggaagcggttgggcaactaacggctggcgtggcgcatgacttcaataacctgctgacgg > 1:335460‑M2/1‑31 (MQ=255) gTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAgcgcgcgc > 8:70587/1‑149 (MQ=255) gTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCTTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGc < 2:72108/149‑1 (MQ=255) tC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGa > 5:159420/1‑130 (MQ=255) tC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGa < 6:159420/130‑1 (MQ=255) tC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCg < 6:244377/149‑1 (MQ=255) tC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCg < 3:295000/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGcc > 6:166932/1‑148 (MQ=255) ccAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGcc < 2:84699/148‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCa > 8:1435/1‑149 (MQ=255) ggCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCCTgg > 7:33270/1‑149 (MQ=255) aGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGAGCTGGTGCGGCCATGGGCGAg > 2:200079/1‑149 (MQ=255) gcTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGggcggc < 5:193961/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGggcggc > 7:65108/1‑147 (MQ=255) ttCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGggcggc > 4:225224/1‑147 (MQ=255) | AGGTTATTGAAGTCATGCGCCACGCCAGCCGTTAGTTGCCCAACCGCTTCCAGCCGCTGCATCTGCTGCAGAGCGGCCTCGATGCGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTC‑TGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGC > NC_002947/2686397‑2686689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |