| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4925636 = | 54 (1.000) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 6.9% | coding (390/858 nt) | PP_4335 | flagellar motor protein |
| ? | NC_002947 | 4925682 = | 55 (1.050) | coding (344/858 nt) | PP_4335 | flagellar motor protein | |||||
GCTTGAGGATGCTGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGGCTGCTCATCGCCAATCG > NC_002947/4925536‑4925826 | gCTTGAGGATGCTGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAgg > 8:98535/1‑149 (MQ=255) ttGAGGATGCTGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTc > 5:24776/1‑149 (MQ=255) gtcaaagacagcgagcagaccgaagcgggcctggcggcgaccaatgtcgacccgttgaaaaccatcagcgatgacgtgcgcgatgccttcggcgacctGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAgg > 1:240062‑M1/99‑147 (MQ=255) aGGATGCTGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGc < 8:245901/148‑1 (MQ=255) gATGCTGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCg > 8:185225/1‑148 (MQ=255) tGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCa > 4:30154/1‑149 (MQ=255) ggCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCAt > 2:238966/1‑149 (MQ=255) cACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATcgc > 4:164820/1‑149 (MQ=255) cACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATcgc > 3:44505/1‑149 (MQ=255) ccTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCgcgc < 7:39354/149‑1 (MQ=255) gaccgaagcgggcctggcggcgaccaatgtcgacccgttgaaaaccatcagcgatgacgtgcgcgatgccttcggcgacctGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTc < 5:80817‑M1/51‑1 (MQ=255) gaccgaagcgggcctggcggcgaccaatgtcgacccgttgaaaaccatcagcgatgacgtgcgcgatgccttcggcgacctGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTc > 6:80817‑M1/82‑132 (MQ=255) ttCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGGATCGCGC‑Ac > 4:28039/1‑149 (MQ=255) ttCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑Ac > 2:14728/1‑149 (MQ=255) tcGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGt > 2:54857/1‑148 (MQ=255) tcGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCCAAGAGTTGAGCTAGCTCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCGGGTCGCTGTTGATCAGGTCGACGAAGGCATACCGC‑ACGt > 6:66747/1‑148 (MQ=255) cGCAACCGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATcgc > 5:85309/1‑134 (MQ=255) cGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATcgc < 6:85309/134‑1 (MQ=255) ctaaCGCCTTGGCAGTGGGCATCGGGGCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCGACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCTTCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATg < 5:66747/147‑1 (MQ=255) aaaCGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATgg > 7:267795/1‑149 (MQ=255) aCGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGtt < 3:164820/149‑1 (MQ=255) cTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑Ac > 7:301697/1‑129 (MQ=255) cTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑Ac < 8:301697/129‑1 (MQ=255) gTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAAc < 1:234210/148‑1 (MQ=255) gggCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGa > 5:35970/1‑149 (MQ=255) ggCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGa > 8:13014/1‑148 (MQ=255) gCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACa > 5:16466/1‑149 (MQ=255) cATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACAt > 3:160525/1‑149 (MQ=255) aTCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACAtt < 1:238966/149‑1 (MQ=255) aTCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACAtt < 6:24776/149‑1 (MQ=255) tCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTg < 1:197627/149‑1 (MQ=255) gcgTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTgg < 7:98535/148‑1 (MQ=255) accacTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTcgcc < 3:30154/148‑1 (MQ=255) cacTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTcgccgc > 6:54685/1‑148 (MQ=255) gcagcGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCg < 4:44505/149‑1 (MQ=255) gcagcGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCg < 6:35970/149‑1 (MQ=255) cagcGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCgg > 8:60570/1‑149 (MQ=255) gcGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTc > 8:65096/1‑149 (MQ=255) cGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATcgc > 4:73387/1‑86 (MQ=255) cGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATcgc < 3:73387/86‑1 (MQ=255) gTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGc < 7:60570/149‑1 (MQ=255) tGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTg > 4:16253/1‑149 (MQ=255) gatctcgatcCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCttt < 1:96845/147‑1 (MQ=255) gatctcgatcCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTg < 7:13014/148‑1 (MQ=255) gacctgatcaacagcgaccagatgaccgtgcgcggcaacgagctgtggatcAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTc < 5:80817‑M2/81‑1 (MQ=255) gacctgatcaacagcgaccagatgaccgtgcgcggcaacgagctgtggatcAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTc > 6:80817‑M2/52‑132 (MQ=255) tctcgatcCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCAGTTGATCAGGTCGCCCAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGAc > 2:158070/1‑148 (MQ=255) cctgatcaacagcgaccagatgaccgtgcgcggcaacgagctgtggatcAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGAc > 1:240062‑M2/50‑147 (MQ=255) ATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCgg < 8:165732‑M1/149‑1 (MQ=255) acaGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCg > 3:248091/1‑149 (MQ=255) aGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGc > 4:275967/1‑149 (MQ=255) gCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGcc > 2:150814/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGGTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGGTGATGGGTTTCAAGGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCGCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGgc < 8:189510/149‑1 (MQ=255) ccagatgaccgtgcgcggcaacgagctgtggatcAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGGTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGgc < 2:240062‑M2/115‑1 (MQ=255) ccGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑CGGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATGGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGGTCGCTGGCTTTGACCGGCGGGTCGGCCGGGCGCAc > 8:228055/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCAc > 2:175060/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCAc < 3:16253/149‑1 (MQ=255) gcgcACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGCGACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACg > 1:250772/1‑149 (MQ=255) gcACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCt > 4:272465/1‑148 (MQ=255) aCGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAg > 6:332778/1‑149 (MQ=255) tCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGgc > 2:132088/1‑149 (MQ=255) cATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCggg > 7:110950/1‑133 (MQ=255) cATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCggg < 8:110950/133‑1 (MQ=255) aTCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGgctg < 7:26205/149‑1 (MQ=255) tCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGGCTGCTCATc < 1:54857/149‑1 (MQ=255) gatcAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGGCTGCTCATCGCCAATc < 8:267795‑M2/144‑1 (MQ=255) atcAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGGCTGCTCATCGCCAATCg < 1:14728‑M2/145‑1 (MQ=255) | GCTTGAGGATGCTGGCCACCTTCTCGATGATCGCAAACGCCTTGTCACTGGGCATCGCGTCACCACTGCCAAACAGCAGCGAAGAGTTGAGCTCGATCTCGATCCACAGCTCGTTGCCGCGCACGGTCATCTGGTCGCTGTTGATCAGGTCGCCGAAGGCATCGCGC‑ACGTCATCGCTGATGGTTTTCAACGGGTCGACATTGGTCGCCGCCAGGCCCGCTTCGGTCTGCTCGCTGTCTTTGACCAGCGGTTCGGCCGGGCGCACGCTGAGCGGCTGCTCATCGCCAATCG > NC_002947/4925536‑4925826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |