New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5270051 = | 35 (0.650) | 7 (0.140) | 6/254 | NT | 15.3% | coding (288/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
? | NC_002947 | 5270112 = | 44 (0.850) | coding (227/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
GACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGACCAGGGTGTTCCAGGCCCCGC > NC_002947/5269964‑5270259 | cagcggtcgcgctggctggacagggcagcaggcgcagatcaagaccctggccgaagtcagtgtcgaggaaatcccgcgtttcacgacCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTgg > 7:38483‑M1/88‑149 (MQ=255) cagcggtcgcgctggctggacagggcagcaggcgcagatcaagaccctggccgaagtcagtgtcgaggaaatcccgcgtttcacgacCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTgg > 5:239187‑M1/88‑149 (MQ=255) ggtcgcgctggctggacagggcagcaggcgcagatcaagaccctggccgaagtcagtgtcgaggaaatcccgcgtttcacgacCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGt > 1:315221‑M1/84‑149 (MQ=255) ggCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCgg < 1:14352/149‑1 (MQ=255) ggCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCAAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCgg < 7:213174/149‑1 (MQ=255) cATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCAGATGCCGGGGTCACAGCCAATCAGCACAACCGAGCAATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGa > 2:51954/1‑149 (MQ=255) cACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCt > 6:329296/1‑149 (MQ=255) aCGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCgga > 8:99392/1‑140 (MQ=255) aCGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCgga < 7:99392/141‑2 (MQ=255) cacaAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTc > 2:64694/1‑149 (MQ=255) aaGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGc < 5:329296/149‑1 (MQ=255) tAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGt < 2:49597/147‑1 (MQ=255) gCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGAtt < 4:144936/119‑1 (MQ=255) gCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGAtt > 3:144936/1‑119 (MQ=255) gACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCATGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCct‑g > 6:206089/1‑149 (MQ=255) gACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCct‑g > 7:222410/1‑149 (MQ=255) ccGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGcc < 1:64694/148‑1 (MQ=255) gATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTg > 2:271931/1‑149 (MQ=255) gATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGACCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTg > 6:169095/1‑149 (MQ=255) ggggTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCAATACACCAGGCCGCAAACCAGCACGCGGTACAGTTCTTTGCTTCTGGTAGTGAAACGAGGGATTTGCTCGAAACTGACTTAGGCCAGGGTCTTGATCTGAGCCT‑TC‑TGCCCTTTccag > 5:339066/1‑148 (MQ=255) tCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCcagccagc > 3:74323/1‑149 (MQ=255) cACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAgcg > 2:314536/1‑149 (MQ=255) acgaccagcagcaccgaactggaccgcgtgctgggtggcggcctggtggatggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGAcc > 1:315221‑M2/67‑149 (MQ=255) cAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCGTCGACACTGACTTCGGCCAGGGGCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCg > 5:262407/1‑149 (MQ=255) aaTCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCgc > 1:67115/1‑149 (MQ=255) ccagcagcaccgaactggaccgcgtgctgggtggcggcctggtggatggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCgctg > 7:38483‑M2/63‑149 (MQ=255) ccagcagcaccgaactggaccgcgtgctgggtggcggcctggtggatggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCgctg > 5:239187‑M2/63‑149 (MQ=255) CAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCgctgc > 1:314536‑M1/1‑149 (MQ=255) gcagcaccgaactggaccgcgtgctgggtggcggcctggtggatggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGctgctg > 5:225965‑M2/60‑149 (MQ=255) gcagcaccgaactggaccgcgtgctgggtggcggcctggtggatggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGctgctg < 6:239187‑M2/90‑1 (MQ=255) accGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTgc < 7:48177/149‑1 (MQ=255) cGAGCCAGCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTgcag < 1:58092/149‑1 (MQ=255) aTCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAgcgc > 4:178797/1‑149 (MQ=255) caccaGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCTGTTCTGAGCTGCTGGTCGTGAAACGCGTGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTTATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCTCTGCTGCACCCAGCAgcggtc < 6:262407/148‑4 (MQ=255) accaGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGcgccgcc > 2:79417/1‑149 (MQ=255) accaGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGcgccgcc > 2:247842/1‑149 (MQ=255) ccgccACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTc < 1:247842/149‑1 (MQ=255) ccgccACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTc < 3:178797/149‑1 (MQ=255) gccACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGa < 5:206089/149‑1 (MQ=255) gccACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGa < 7:33999/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCa < 8:98411/149‑1 (MQ=255) gcggcctggtggatggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATg < 8:38483‑M2/120‑1 (MQ=255) ccAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTg > 5:76273/1‑96 (MQ=255) ccAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTg < 6:76273/96‑1 (MQ=255) ccAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATg > 1:213958/1‑149 (MQ=255) ccAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATg > 3:10197/1‑149 (MQ=255) cAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGcc < 5:30780/92‑1 (MQ=255) cAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGcc > 6:30780/1‑92 (MQ=255) aGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGt > 5:106608/1‑149 (MQ=255) aCGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTc > 1:191500/1‑149 (MQ=255) gcgGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGTATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATGTGCGCCTCTCTTGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTc < 1:271931/149‑1 (MQ=255) gcgGTCCAGTGCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGa < 8:222410/149‑1 (MQ=255) atggctcggtggtgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTCCGATCATGGTTTCGACCAgg < 2:315221‑M2/132‑1 (MQ=255) aGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGACCAGGgt < 2:67115/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGACCAGGgtg > 8:279957/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGACCAGGGTGTTCCAGGc < 2:213958/149‑1 (MQ=255) gTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGACCAGGGTGTTCCAGGCCCCGc < 4:74323/148‑1 (MQ=255) | GACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTCGACTTGCCGATGCCGGGGTCACCGCCAATCAGCACCACCGAGCCATCCACCAGGCCGCCACCCAGCACGCGGTCCAGTTCGGTGCTGCTGGTCGTGAAACGCGGGATTTCCTCGACACTGACTTCGGCCAGGGTCTTGATCTGCGCCT‑GC‑TGCCCTGTCCAGCCAGCGCGACCGCTGCTGGGTGCAGCAGCGCCGCCGCTTTCGATCATGGTTTCGACCAGGGTGTTCCAGGCCCCGC > NC_002947/5269964‑5270259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |