| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3242761 = | 137 (1.220) | 3 (0.030) | 3/482 | 12.7 | 2.2% | coding (554/1488 nt) | uxaA | altronate hydrolase |
| ? | NC_000913 | 3242787 = | 134 (1.240) | coding (528/1488 nt) | uxaA | altronate hydrolase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CCCCAGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGAT > NC_000913/3242475‑3243058 | ccccAGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTgc < 1:907813/301‑1 (MQ=255)ccccAGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTg > 1:835415/1‑300 (MQ=255) aGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCGGCGCTCGGGTGGGGCACCATGTTTTgcagca > 1:253898/1‑301 (MQ=255) aTCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCTCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATgg < 1:627034/301‑1 (MQ=255) ggTTAGCAGCAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCg > 1:688564/1‑301 (MQ=255) aaTACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATNAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAAtg < 1:1012034/301‑1 (MQ=255) aaTACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAAtg < 1:1040160/301‑1 (MQ=255) aaTACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAAtg < 1:42430/301‑1 (MQ=255) cccGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGccc < 1:398481/300‑1 (MQ=255) tCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAgg < 1:947158/301‑1 (MQ=255) aGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGgtgg > 1:26427/1‑300 (MQ=255) aCCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGgtg < 1:83104/298‑1 (MQ=255) tCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAagag < 1:356088/301‑1 (MQ=255) 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cgTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGt > 2:672301/1‑218 (MQ=255) tATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGACTGCGTTCGGGTTGCGCCCCCTGCTTTGCAGCTTGGCGCgg > 2:129071/1‑218 (MQ=255) cGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTa < 2:363858/218‑1 (MQ=255) 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aCGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGACTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTAcc > 1:956088/1‑275 (MQ=255) cGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCCCCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGAtcg > 2:114767/1‑218 (MQ=255) cGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGGGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGGTGGTGTCTTTTCGaaa > 1:841250/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |