| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 810109 | 224 (0.750) | 11 (0.040) | 9/134 | NT | 5.0% | intergenic (+40/‑78) | nrdE1/nrdF | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha 1/Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 810116 | 228 (0.910) | intergenic (+47/‑71) | nrdE1/nrdF | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha 1/Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/810007‑810109‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaatcatctgctAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTA < USA300TCH1516_ALE/810116‑810027 TCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGC > 2:1783568/1‑91TCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGC < 2:4416583/91‑1TCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGC < 1:4451944/91‑1TCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGC > 1:5086619/1‑91 CACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCT > 2:1428332/1‑91 CACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCT > 2:4341551/1‑91 CACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCT > 1:2157933/1‑91 CACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCT > 2:4177001/1‑91 ACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTA > 1:1687300/1‑91 ACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTA > 2:423059/1‑91 CTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAA < 1:4812626/91‑1 CTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAA > 1:4389500/1‑91 TTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAAT < 1:205249/91‑1 TTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACATACAGCTAATC < 2:4870465/91‑1 TTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATC < 2:3125700/91‑1 TTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATC < 1:4177554/91‑1 TTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATC < 1:96796/91‑1 TACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCA > 1:1147823/1‑91 TACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCA < 1:1002715/91‑1 TACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCA > 1:729794/1‑91 ACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCAT < 1:1727162/91‑1 ACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCAT < 2:1193225/91‑1 ACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATATAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCAT > 1:4855029/1‑91 CTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATC < 1:1858007/91‑1 CTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATC < 2:2521803/91‑1 CTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATC > 2:4391522/1‑91 CTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTAGAAAATGACAAACAGCTAATCATC < 1:107665/91‑1 TATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCT < 2:1038170/91‑1 ATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTG > 2:2110525/1‑91 ATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTG > 2:3059931/1‑91 ATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTG < 2:4100526/91‑1 ATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTG < 2:1103765/91‑1 TACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGC < 2:3788432/91‑1 TACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGC < 2:2057610/91‑1 ACTAGAAATAAGTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT < 2:5853501/91‑1 ACTAGAAATAAATTGTTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGCTGAAAATGACAATCAGCTAATCATCTGCT < 1:5388376/91‑1 ACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT > 2:3083167/1‑91 ACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT < 2:1878802/91‑1 ACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT < 1:4236617/91‑1 GAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATT < 2:5828954/91‑1 ATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTGAATGTGGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAG < 1:5795164/91‑1 ATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAG < 1:30813/91‑1 AAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAGAG < 2:4546310/91‑1 AATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAGAGC < 2:2443167/91‑1 AATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAGAGC < 2:4728694/91‑1 ATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAGAGCA < 2:1823414/91‑1 AAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGAT < 2:3537319/91‑1 TGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAG < 1:1428332/91‑1 TAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGT > 1:4242600/1‑91 TGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACA > 2:3040353/1‑91 CTAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACA > 2:1172235/1‑91 CTAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACA < 1:3845819/91‑1 TAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACAC < 1:2073371/91‑1 TAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACAC > 2:3319304/1‑91 TAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACAC > 2:3588936/1‑91 TAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACAC < 1:45746/91‑1 TAATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACAC > 2:1382554/1‑91 AATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACT > 2:4183589/1‑91 AATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACT < 2:4832196/91‑1 AATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACT < 1:4463404/91‑1 ATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTT > 1:1821316/1‑91 ATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTT > 1:3374838/1‑91 ATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTT < 2:2487744/91‑1 ATCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTAC > 1:526550/1‑77 TCATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTA > 1:1557129/1‑91 CATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAA > 2:4832365/1‑91 CATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAA > 1:662885/1‑91 CATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAA > 2:2856286/1‑91 tTCTACTAATACATAGCAGATGATTAGCTGTATGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAAT < 2:1514972/90‑1 ATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTTGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAAT < 2:5440359/91‑1 ATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAAT > 1:5561456/1‑91 ATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAAT > 1:5784723/1‑91 ATCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAAT < 1:1679479/91‑1 TCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATA > 2:72068/1‑91 TCTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATA < 2:1475547/91‑1 CTGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAA < 1:4622433/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 2:3499494/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:5647463/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:664191/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:799058/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:855007/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:4131733/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:4082563/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 2:1990983/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 1:3538/91‑1 TGCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAAT < 2:2523328/91‑1 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCGACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT < 1:4848870/91‑1 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT < 1:4763395/91‑1 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT < 1:2677338/91‑1 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT > 1:1389550/1‑91 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT > 2:405300/1‑91 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT > 2:405259/1‑91 GCTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTGTATCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATT < 2:4789002/91‑1 CTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTT > 2:4463119/1‑91 CTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTT < 1:2257733/91‑1 CTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTT < 1:3894497/91‑1 CTAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTT > 1:2599835/1‑91 TAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTA > 2:2581332/1‑91 TAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTA < 2:686844/91‑1 TAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTA < 2:1689947/91‑1 TCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/810007‑810109‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaatcatctgctAATTCAGAGCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTA < USA300TCH1516_ALE/810116‑810027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |