New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 810109 | 224 (0.750) | 11 (0.040) | 9/134 | NT | 5.0% | intergenic (+40/‑78) | nrdE1/nrdF | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha 1/Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
? | USA300TCH1516_ALE | = 810116 | 228 (0.910) | intergenic (+47/‑71) | nrdE1/nrdF | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha 1/Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
ATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAA > USA300TCH1516_ALE/810026‑810206 | ataaatTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAAtt < 1:2334924/91‑1 (MQ=255) tAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTa < 2:1689947‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTag < 1:2257733‑M2/91‑3 (MQ=255) aaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagc < 1:4763395‑M2/91‑4 (MQ=255) aaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagc < 1:2677338‑M2/91‑4 (MQ=255) aaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTCGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagc < 1:4848870‑M2/91‑4 (MQ=255) attattAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagca < 2:2523328‑M2/91‑5 (MQ=255) attattAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagca < 1:855007‑M2/91‑5 (MQ=255) tattaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcaga > 2:72068‑M2/1‑85 (MQ=255) attaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagat < 1:1679479‑M2/91‑8 (MQ=255) attaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagat > 1:5561456‑M2/1‑84 (MQ=255) aaGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgat < 1:4002589‑M2/91‑11 (MQ=255) aGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgatt < 2:4832196‑M2/91‑12 (MQ=255) aGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgatt < 1:4463404‑M2/91‑12 (MQ=255) gtgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgatta < 2:2845089‑M2/91‑13 (MQ=255) tgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgattag < 1:3845819‑M2/91‑14 (MQ=255) tgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgattag > 2:1172235‑M2/1‑78 (MQ=255) gtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGa < 1:3106383/91‑1 (MQ=255) tAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGAc < 2:305509/91‑1 (MQ=255) agaagaATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACt < 2:3619884/91‑1 (MQ=255) agaagaATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACt > 2:5487049/1‑91 (MQ=255) aagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGc < 2:848139/91‑1 (MQ=255) aagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGc < 2:3008856/91‑1 (MQ=255) agaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCt > 2:2085832/1‑91 (MQ=255) agaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCt > 1:1430273/1‑91 (MQ=255) aTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATg > 2:228922/1‑91 (MQ=255) tGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGt > 1:3199196/1‑91 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTc < 1:562380/91‑1 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTc < 1:1840795/91‑1 (MQ=255) aCAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTg < 2:5252647/91‑1 (MQ=255) cAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGt < 1:3395177/91‑1 (MQ=255) aGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAt > 1:3046378/1‑91 (MQ=255) tgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg < 2:1461574/91‑1 (MQ=255) tgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg < 2:1101403/91‑1 (MQ=255) tgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg < 2:5424917/91‑1 (MQ=255) tgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg < 1:1143434/91‑1 (MQ=255) gttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:4938207/1‑91 (MQ=255) gttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:294468/1‑91 (MQ=255) ttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTc > 1:348295/1‑91 (MQ=255) ttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTc < 1:3436502/91‑1 (MQ=255) ttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTc < 1:4167201/91‑1 (MQ=255) tctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCa > 2:2446688/1‑91 (MQ=255) tctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCa > 1:5189833/1‑91 (MQ=255) ctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCaa > 2:3292043/1‑91 (MQ=255) tctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAatta > 1:39784/1‑91 (MQ=255) cAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAg < 2:3439694/91‑1 (MQ=255) aaTTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGt < 1:2821984/91‑1 (MQ=255) ttAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa < 1:4107370/91‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 2:4101553/1‑91 (MQ=255) gTTGAAAATGACGAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTAc < 2:3890740/91‑1 (MQ=255) gTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTAc < 2:1308258/91‑1 (MQ=255) ttGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAGCATTACa > 1:4638231/1‑91 (MQ=255) ttGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACa > 1:2396429/1‑91 (MQ=255) tGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACag < 1:1068014/91‑1 (MQ=255) tGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACag > 1:3609502/1‑91 (MQ=255) gAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACagg < 2:4577118/91‑1 (MQ=255) gAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCACTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACagg > 2:4202643/1‑91 (MQ=255) tGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaa < 1:1285935/91‑1 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa < 2:122598/91‑1 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa < 1:975804/91‑1 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa < 1:5345620/91‑1 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTTTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt < 2:2967264/91‑1 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 2:4343887/1‑91 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 1:4300591/1‑91 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt < 2:1283806/91‑1 (MQ=255) aaaCAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATta > 2:3510615/1‑91 (MQ=255) aCAGCTACTCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGGAACATTACAGGAGGAAATtata < 2:5182166/91‑1 (MQ=255) cAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTatat < 1:2136722/91‑1 (MQ=255) gCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTc < 1:1783568/91‑1 (MQ=255) gCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTc < 1:5850336/91‑1 (MQ=255) tAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCAt < 1:3271574/91‑1 (MQ=255) tAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCAt < 1:5231903/91‑1 (MQ=255) tAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCAt < 1:3710332/91‑1 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa > 2:1409225/1‑91 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa < 1:571927/91‑1 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa > 2:1966030/1‑91 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa > 2:1903474/1‑91 (MQ=255) atcatcTGCTCAGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAACTTATATTCCTGa > 2:4477558/1‑91 (MQ=255) tcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGAt < 1:2531525/91‑1 (MQ=255) catcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATa < 2:2336583/91‑1 (MQ=255) catcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATa > 2:1609866/1‑91 (MQ=255) atcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAg < 2:4002589/91‑1 (MQ=255) atcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAg < 2:4938207/91‑1 (MQ=255) cTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTGTAATCATGATAGCt < 2:3684410/91‑1 (MQ=255) cTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCt < 2:575942/91‑1 (MQ=255) tGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTg < 1:79782/91‑1 (MQ=255) tGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTg < 2:1730304/91‑1 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:3210797/91‑1 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 1:1491181/91‑1 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:4687465/91‑1 (MQ=255) ctctGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGCGGAAATTATATTCATGATAGCTGtt > 2:5006164/1‑91 (MQ=255) tGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAAt < 2:2610487/91‑1 (MQ=255) tGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAAt < 2:3114724/91‑1 (MQ=255) gAATTagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataatttattt < 1:636333‑M2/91‑87 (MQ=255) gAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAAtt < 1:1377916/91‑1 (MQ=255) aaTTagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataatttatttc < 2:5828954‑M2/91‑88 (MQ=255) aaTTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTg > 2:5370802/1‑91 (MQ=255) aTTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTgg < 1:1990983/91‑1 (MQ=255) aTTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTgg < 1:67007/91‑1 (MQ=255) ttAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTGAATTATTGAATAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGa > 2:5656382/1‑91 (MQ=255) | ATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAA > USA300TCH1516_ALE/810026‑810206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |