| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 810109 | 224 (0.750) | 11 (0.040) | 9/134 | NT | 5.0% | intergenic (+40/‑78) | nrdE1/nrdF | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha 1/Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 810116 | 228 (0.910) | intergenic (+47/‑71) | nrdE1/nrdF | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha 1/Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta | |||||
Only 100 of 413 total aligned reads displayed.
ACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTA > USA300TCH1516_ALE/810019‑810199 | actaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCT < 1:4236617‑M1/91‑1 (MQ=255) aGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTg < 1:1789087/91‑1 (MQ=255) aGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTg > 1:4577118/1‑91 (MQ=255) gAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTaatt < 2:5828954‑M1/91‑5 (MQ=255) gAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGa < 2:1284983/91‑1 (MQ=255) aaataaacTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGaa < 1:4666708/91‑1 (MQ=255) aataaatTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTaattca < 1:1968268‑M1/91‑7 (MQ=255) aaaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTag > 2:4463119‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTag < 1:3894497‑M2/91‑3 (MQ=255) aatTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTaattcagagc < 2:2443167‑M1/91‑11 (MQ=255) aaTTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagc > 2:405259‑M2/1‑88 (MQ=255) attattAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagca < 1:799058‑M2/91‑5 (MQ=255) attattAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagca < 1:664191‑M2/91‑5 (MQ=255) attattAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagca < 2:1990983‑M2/91‑5 (MQ=255) tattaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcaga > 2:72068‑M2/1‑85 (MQ=255) attaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACATACAGCTAATCATCTGCTATGTATTagtagaa < 2:1514972‑M2/91‑8 (MQ=255) ttaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatg < 2:171145‑M2/91‑9 (MQ=255) ttaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatg > 2:2856286‑M2/1‑83 (MQ=255) aaGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTaattcagagcagatgat < 2:3537319‑M1/91‑18 (MQ=255) aaGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgat < 2:2487744‑M2/91‑11 (MQ=255) aGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgatt < 2:4832196‑M2/91‑12 (MQ=255) tgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTaattcagagcagatgattag < 1:1428332‑M1/91‑21 (MQ=255) tgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgattag > 2:1172235‑M2/1‑78 (MQ=255) tgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgattag < 1:3845819‑M2/91‑14 (MQ=255) gtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGa < 2:3641958/91‑1 (MQ=255) tAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGAc < 2:305509/91‑1 (MQ=255) tAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGAc < 2:849202/91‑1 (MQ=255) gaagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTg > 1:3210797/1‑91 (MQ=255) gaagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTg > 2:3911925/1‑91 (MQ=255) aagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGc < 2:3008856/91‑1 (MQ=255) agaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCt < 2:4133915/91‑1 (MQ=255) gaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTa < 2:3728078/91‑1 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgat > 1:526550‑M2/1‑67 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTagcagatgat < 2:526550‑M2/77‑11 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTc < 1:651858/91‑1 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTc < 1:1689947/91‑1 (MQ=255) cAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGt < 1:3395177/91‑1 (MQ=255) cAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGt < 1:5398181/91‑1 (MQ=255) gttgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAtt < 1:400136/91‑1 (MQ=255) gttgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAtt > 2:2790356/1‑91 (MQ=255) tgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg < 2:1461574/91‑1 (MQ=255) tgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg < 2:1101403/91‑1 (MQ=255) gttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:4938207/1‑91 (MQ=255) tctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCa > 1:3012914/1‑91 (MQ=255) tctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCa > 1:5189833/1‑91 (MQ=255) ctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCaa > 1:1250007/1‑91 (MQ=255) ctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCaa < 1:1650675/91‑1 (MQ=255) tctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCGGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAatta > 1:3336900/1‑91 (MQ=255) tctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAatta > 1:1352382/1‑91 (MQ=255) ctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAattat < 1:3132747/91‑1 (MQ=255) aCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGa > 2:5464674/1‑91 (MQ=255) aaTTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGt < 1:2821984/91‑1 (MQ=255) aaTTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGt < 2:2274049/91‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCACTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 2:2332974/1‑91 (MQ=255) tGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTa > 2:5040468/1‑91 (MQ=255) ttGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACa > 1:2396429/1‑91 (MQ=255) tGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACag < 1:1068014/91‑1 (MQ=255) gAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACagg < 2:4577118/91‑1 (MQ=255) gAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCACTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACagg > 2:4202643/1‑91 (MQ=255) aTGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAggagga < 1:5590239/91‑1 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa < 2:122598/91‑1 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa < 1:975804/91‑1 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa < 1:910196/91‑1 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 1:4300591/1‑91 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 2:5424507/1‑91 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt < 2:5703273/91‑1 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 2:3488391/1‑91 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 2:4343887/1‑91 (MQ=255) aCAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 1:3535121/1‑91 (MQ=255) aaCAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATtat > 1:4065039/1‑91 (MQ=255) cAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTatat < 1:2136722/91‑1 (MQ=255) gCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTc < 1:1475547/91‑1 (MQ=255) gCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTc < 1:5850336/91‑1 (MQ=255) tAATCATCTGCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacac > 2:3319304‑M1/1‑12 (MQ=255) aaTCATCTGCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacact < 1:4463404‑M1/91‑81 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa > 2:5213122/1‑91 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa > 2:1903474/1‑91 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa > 2:1409225/1‑91 (MQ=255) tcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGAt < 1:2531525/91‑1 (MQ=255) catcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATa > 1:2298222/1‑91 (MQ=255) atcTGCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaat > 1:5784723‑M1/1‑7 (MQ=255) atcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAg < 2:4938207/91‑1 (MQ=255) tcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGc < 2:1369969/91‑1 (MQ=255) tcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGc < 1:3467670/91‑1 (MQ=255) cTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCt < 2:1670452/91‑1 (MQ=255) cTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCt < 1:3051022/91‑1 (MQ=255) cTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCt > 2:2547188/1‑91 (MQ=255) tGCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataat < 1:5647463‑M1/91‑88 (MQ=255) tGCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataat < 1:4131733‑M1/91‑88 (MQ=255) tGCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataat < 2:3132747‑M1/91‑88 (MQ=255) tGCTCTGAATTagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataat < 2:1823414‑M2/91‑81 (MQ=255) tGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTg < 1:3677028/91‑1 (MQ=255) gCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcgacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataatt < 1:4848870‑M1/91‑89 (MQ=255) gCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataatt < 1:4763395‑M1/91‑89 (MQ=255) gCTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataatt < 1:2677338‑M1/91‑89 (MQ=255) gCTaattcagagcagatgattagctgtgtatcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataatt < 2:4789002‑M1/91‑89 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:4687465/91‑1 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:3210797/91‑1 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:662950/91‑1 (MQ=255) cTaattcagagcagatgattagctgtttgtcattttcaacatttaattgttagatagaacaacttgtacattcttctacacttaataattt < 1:2257733‑M1/91‑90 (MQ=255) | ACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTA > USA300TCH1516_ALE/810019‑810199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |