New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 42564 = | 359 (1.200) | 17 (0.080) +TACATTATAAAATACATATC |
10/120 | NT | 6.8% | coding (1402/1524 nt) | USA300TCH1516_00035 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2479065 | 269 (0.900) | intergenic (+21/+119) | USA300HOU_RS12765/hrtA_2 | hypothetical protein/Putative hemin import ATP‑binding protein HrtA |
Only 100 of 407 total aligned reads displayed.
GGGACATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCGGACAGACA > USA300TCH1516_ALE/42474‑42653 | gggACATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTc < 2:163751/91‑1 (MQ=255) ggACATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCa > 1:140148/1‑91 (MQ=255) gACATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAg < 2:2114473/91‑1 (MQ=255) aCATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGc < 2:2242916/91‑1 (MQ=255) aCATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGc > 1:1953748/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTCTTGGATGAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTATTATAAATTTTTTGATTATATTCAGCTCg < 1:5382397/91‑1 (MQ=255) tAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCg < 1:862702/91‑1 (MQ=255) aaGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGtt < 2:384482/91‑1 (MQ=255) aGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTg < 2:1720256/91‑1 (MQ=255) aGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTg > 1:1705027/1‑91 (MQ=255) gTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGa > 2:2615036/1‑91 (MQ=255) gTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGa > 1:4688885/1‑91 (MQ=255) cTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGct < 2:3533460/91‑1 (MQ=255) cTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGct < 2:3723719/91‑1 (MQ=255) tGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGctac < 1:954073/91‑1 (MQ=255) ggATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGctact < 2:1282739/91‑1 (MQ=255) ggATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGctact > 1:5862337/1‑91 (MQ=255) ggATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGctact > 2:3230923/1‑91 (MQ=255) gATAAGAGAAAAAAGACAAGTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGctacta < 1:1895953/91‑1 (MQ=255) aTAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCtactac < 2:4528896/91‑1 (MQ=255) tAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAAATGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTAAGCTCGTTGACCTactact > 2:5698452/1‑91 (MQ=255) atcaaaaaagctgatttctatcaaataattaatagaaatcagcttttttgatatgtattttataatgtaCAGCTCGTtgagctgctatttt < 2:3663933‑M1/22‑5 (MQ=255) aGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACttt < 1:705634/91‑1 (MQ=255) aGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACttt < 1:224201/91‑1 (MQ=255) aGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACttt < 1:375654/91‑1 (MQ=255) gTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACtttt > 2:284160/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTc > 1:4632853/1‑91 (MQ=255) gAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCt < 2:5811841/91‑1 (MQ=255) gAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCt < 2:5386069/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCtt > 2:3967976/1‑91 (MQ=255) aaaaaGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAACTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTta < 1:5792136/91‑1 (MQ=255) aaaaGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTtat < 1:1334781/91‑1 (MQ=255) aaaaGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTtat < 2:5059839/91‑1 (MQ=255) aaaaGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTtat > 2:2903021/1‑91 (MQ=255) aaaaGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTtat > 1:2798159/1‑91 (MQ=255) agctgatttctatcaaataattaatagaaatcagcttttttgatatgtattttataatgtaCAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTatat < 1:1560494‑M1/30‑1 (MQ=255) gACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTTTTTCTTTTCATCTCGTTGATCTACTACTTTTCTTTTAttt > 2:2521130/1‑90 (MQ=255) gACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTa > 1:2985749/1‑91 (MQ=255) gACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTa > 2:3397700/1‑91 (MQ=255) ctgatttctatcaaataattaatagaaatcagctattttgatatgtattttataatgtaCAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTa < 2:3486064‑M1/32‑1 (MQ=255) aCAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTaa > 1:4559981/1‑91 (MQ=255) cAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTaat > 1:5347552/1‑90 (MQ=255) cAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTCAg > 1:2923988/1‑91 (MQ=255) cAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAg < 2:1331423/91‑1 (MQ=255) aaTTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGt < 1:2132372/91‑1 (MQ=255) ttCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGcc < 2:1562572/91‑1 (MQ=255) tCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCa < 2:1162222/91‑1 (MQ=255) tatcaaataattaatagaaatcagctttttttttttttattttataatgtaCAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCAt < 2:4957136‑M1/40‑1 (MQ=255) catcaaataattaatagaaatcagcttttttgatatgtattttataatgtaCAGCCCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCAt < 1:1119726‑M1/40‑1 (MQ=255) cTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCAt < 1:4037813/91‑1 (MQ=255) atATTGAGATAATATAAAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCAt < 2:5592562/90‑1 (MQ=255) tATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCAtt < 1:5480143/91‑1 (MQ=255) tATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCAtt < 2:1138219/91‑1 (MQ=255) tATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCAtt < 2:3630160/91‑1 (MQ=255) aTTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTa > 1:502807/1‑91 (MQ=255) aTTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTa < 2:1489554/91‑1 (MQ=255) aTTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTa < 2:4783895/91‑1 (MQ=255) ttGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTaa < 1:390266/91‑1 (MQ=255) ttGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTaa > 2:1909228/1‑91 (MQ=255) tGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTTTTTATTTTTTTATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAAt > 2:1015454/1‑91 (MQ=37) aaaTAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATAc < 1:4970983/91‑1 (MQ=255) aataTAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACaaaa > 2:1946139/1‑91 (MQ=255) tataGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTTATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAAcc > 2:460977/1‑91 (MQ=255) tataGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAAcc < 1:4760611/91‑1 (MQ=255) tataGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAAcc > 2:304248/1‑91 (MQ=255) ataGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCa > 1:2949048/1‑91 (MQ=255) taGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCaa > 2:434616/1‑91 (MQ=255) aGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAg > 1:5640396/1‑91 (MQ=255) aGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAg > 2:3106407/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGtt < 1:3388550/91‑1 (MQ=255) aaTTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTtc < 2:1468433/91‑1 (MQ=255) ttGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTtctc > 2:4461531/1‑91 (MQ=255) gTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCtt > 1:2718811/1‑91 (MQ=255) gTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCtt > 1:3107191/1‑91 (MQ=255) gTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCtt > 1:351226/1‑91 (MQ=255) gTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCtt > 1:1217496/1‑91 (MQ=255) tCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCttt < 1:5122702/91‑1 (MQ=255) cTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCtttt < 2:2950666/91‑1 (MQ=255) tttttATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGa < 1:1667930/91‑1 (MQ=255) tttttATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGa < 1:3243298/91‑1 (MQ=255) tttttATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGa < 2:4242079/91‑1 (MQ=255) ttttATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGAc < 1:2428056/91‑1 (MQ=255) ttttATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGAc < 1:5220675/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACtt > 2:5633207/1‑91 (MQ=255) taAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTAt > 1:2311645/1‑91 (MQ=255) aaaTTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTAtt < 1:265429/91‑1 (MQ=255) ttttttGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAg < 2:4165896/91‑1 (MQ=255) ttttttGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAg < 1:4223878/91‑1 (MQ=255) tttttGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGt < 1:3583903/91‑1 (MQ=255) ttttGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTc < 1:3263254/91‑1 (MQ=255) ttGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCt < 2:278845/91‑1 (MQ=255) tGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTc > 1:1796086/1‑91 (MQ=255) gATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCg > 2:635337/1‑91 (MQ=255) gATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCg > 2:801652/1‑91 (MQ=255) gATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATAATAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCg > 2:3460460/1‑91 (MQ=255) attattTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCgg > 1:3655793/1‑91 (MQ=255) attattTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCgg < 2:3307151/91‑1 (MQ=255) attTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCGgaca < 1:1034285/91‑1 (MQ=255) ttttCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCGgacag < 1:658455/91‑1 (MQ=255) tCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCGgacagaca < 2:4326058/91‑1 (MQ=255) | GGGACATAAAGTTCTTGGATAAGTGAAAAAAGACAATTTCTATTGAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTACTACTTTTCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCAAGTTCTCTTTTGACTTTATTGAGTCCTCGGACAGACA > USA300TCH1516_ALE/42474‑42653 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |