| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 62270 = | 311 (1.040) | 22 (0.070) | 9/158 | NT | 6.4% | coding (264/810 nt) | USA300TCH1516_00053 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 68157 | 341 (1.160) | coding (273/852 nt) | USA300TCH1516_00061 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
TAATAAATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATATTGTTTACCA > USA300TCH1516_ALE/62180‑62360 | taataaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCAct < 1:4123919/91‑1 (MQ=255)ggttatcgtaagattacagcattgattaatcaatgttatacatcaccaattaatcataagagagtacagagaatgatgcagaagcatcatt < 1:3399116‑M1/1‑1 (MQ=255) ataaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCActct < 2:5484108/91‑1 (MQ=255) taaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTGTGCATCActctc > 2:3887647/1‑91 (MQ=255) taaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCActctc < 2:4698884/91‑1 (MQ=255) taaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCActctc < 2:2353152/91‑1 (MQ=255) taaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCActctc < 1:1525777/91‑1 (MQ=255) taaATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCActctc < 2:2923043/91‑1 (MQ=255) aaaTTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCActctct > 2:3943507/1‑91 (MQ=255) aaTTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTg > 1:4789288/1‑91 (MQ=255) aaTTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTg < 1:2566988/91‑1 (MQ=255) tttGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGt < 1:20143/90‑1 (MQ=255) gTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTAct < 2:1585660/91‑1 (MQ=40) gTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTAct > 2:3642886/1‑91 (MQ=255) tCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTActc > 1:1027278/1‑91 (MQ=255) tCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTActc < 1:3373885/91‑1 (MQ=255) ccGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTa > 2:3565648/1‑87 (MQ=255) ccGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTa < 1:3565648/87‑1 (MQ=255) ccGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTActct > 2:2696360/1‑91 (MQ=40) cGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTActctc > 1:510171/1‑91 (MQ=255) gTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTActctct < 1:974646/91‑1 (MQ=255) ttttATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCtt < 1:2179919/91‑1 (MQ=255) tataATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATg < 1:1805935/91‑1 (MQ=255) tataATACCGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAAGTCTAAATCGGCAGTTCAAATGAAGGTACTGCATCAATATCTGTACTTTCTTATg < 2:4200216/91‑1 (MQ=11) taataCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGAt > 2:2226136/1‑91 (MQ=255) aataCGGTTTGCCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATTCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGAtt < 1:5837357/91‑1 (MQ=255) aataCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGAtt < 1:3851306/91‑1 (MQ=255) ataCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTa > 1:531290/1‑91 (MQ=255) taCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTaa > 1:4036792/1‑91 (MQ=255) aCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAAt > 2:4371100/1‑91 (MQ=40) aCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAAt > 1:997823/1‑91 (MQ=255) aCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAAt > 1:4953617/1‑91 (MQ=255) aCGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATAACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAAt > 2:5767993/1‑91 (MQ=255) ggTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTg < 1:3412486/91‑1 (MQ=255) tttACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGt < 1:2698963/91‑1 (MQ=255) aCCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGAt > 2:2602929/1‑91 (MQ=255) aCCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGAt > 2:5322352/1‑91 (MQ=255) ccTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATg < 1:5235556/91‑1 (MQ=255) ccTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATg > 2:662688/1‑91 (MQ=255) tCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATaa > 2:4889275/1‑91 (MQ=255) cTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAAc > 2:5207125/1‑91 (MQ=40) cTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAAc < 1:1239522/91‑1 (MQ=40) cTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAAc > 1:5515630/1‑91 (MQ=40) ttGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACa < 2:3683419/91‑1 (MQ=39) ttGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACa < 1:2656999/91‑1 (MQ=39) cgtcTTTTTAGGGCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGa < 2:3749841/91‑1 (MQ=37) gtcTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACa > 2:1206544/1‑86 (MQ=37) gtcTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGAt < 1:4568630/91‑1 (MQ=34) tcTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGAtt > 1:4234278/1‑91 (MQ=34) tcTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGAtt < 1:1941846/91‑1 (MQ=34) cTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTa < 2:5146964/91‑1 (MQ=34) cTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTa < 1:2282802/91‑1 (MQ=34) tttAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATc > 1:3940563/1‑91 (MQ=33) tAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCaa < 1:815413/91‑1 (MQ=34) tAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCaa < 1:2327031/91‑1 (MQ=34) aGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAAt < 1:694156/91‑1 (MQ=34) ggTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGAt > 1:3776035/1‑82 (MQ=35) gTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTACTTGGTGATGTCTAACATTGATTAATCAATGc > 2:4027889/1‑91 (MQ=16) gTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATgt < 2:2528101/91‑2 (MQ=18) gTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGc > 1:4253268/1‑91 (MQ=34) tCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCt < 1:168370/91‑1 (MQ=34) tCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCt < 1:5578745/91‑1 (MQ=34) tAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGCATAACATTGATTAATCAATGCTGt > 2:2593565/1‑91 (MQ=18) aaCTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTa > 1:651330/1‑91 (MQ=34) aaCTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTa < 2:449459/91‑1 (MQ=34) aCTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTaa > 1:5396140/1‑91 (MQ=33) aCTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTaa > 2:1104692/1‑91 (MQ=33) tCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATc > 2:2781791/1‑91 (MQ=34) ggCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCtt > 2:3305241/1‑91 (MQ=34) gCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTa > 1:5695445/1‑91 (MQ=34) gCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGAATAATTGGTGATGTATAACATTGTTTAATCAATGCTGTAATCttt > 2:4817389/1‑90 (MQ=255) cAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCCTATGATTACTTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTAAc > 2:4666095/1‑91 (MQ=255) aGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACg > 2:1479119/1‑91 (MQ=34) aGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACg > 2:527776/1‑91 (MQ=33) aGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACg > 1:4470298/1‑91 (MQ=34) aGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGAACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTGTAACACTGATTAAGCAGTGCTGTAATCTTGCg > 1:4899242/1‑91 (MQ=11) gTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGa < 2:3058780/91‑1 (MQ=33) gTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGa < 1:3214567/91‑1 (MQ=34) gTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGa < 2:4168136/91‑1 (MQ=34) ttCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGAt > 2:1366674/1‑91 (MQ=34) tCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATa < 2:2728031/91‑1 (MQ=34) aaaTGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAAc > 2:1532104/1‑91 (MQ=34) atgcagaagcatcacTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGACGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAg < 2:5653683‑M1/76‑1 (MQ=255) atgCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAg > 1:1201292/1‑91 (MQ=34) tgcagaagcatcatTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAgg < 1:1417441‑M1/77‑1 (MQ=255) tgcagaagcatcatTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAgg < 2:5066136‑M1/77‑1 (MQ=255) tgCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAgg < 2:1752748/91‑1 (MQ=33) tgCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAgg < 1:2830134/91‑1 (MQ=34) cTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGta < 1:5209786/91‑1 (MQ=33) cTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGta < 2:4577690/91‑1 (MQ=34) ttCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGtat < 2:4952567/91‑1 (MQ=34) ttCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGtat < 1:2502337/91‑1 (MQ=34) tCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGtata > 1:1127115/1‑91 (MQ=34) gaagCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGtata > 1:3109489/4‑91 (MQ=21) cTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTatat > 1:5154607/1‑91 (MQ=35) tGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATAtt < 1:2089294/91‑1 (MQ=37) gCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATATTg < 1:3612882/91‑1 (MQ=38) cATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATATTGt > 2:1934016/1‑91 (MQ=39) aCTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATATTGTTTAc > 2:4081602/1‑91 (MQ=255) aCTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATATTGTTTAc > 1:4922433/1‑91 (MQ=255) | TAATAAATTGTCCGTTTTATAATACGGTTTACCTATTCTTGTCGTCTTTTTAGGTCTAACTCGGCAGTTCAAATGATGCTTCTGCATCACTCTCTGTACTCTCTTATGATTAATTGGTGATGTATAACATTGATTAATCAATGCTGTAATCTTACGATAACCGTAGGTATATTGTTTACCA > USA300TCH1516_ALE/62180‑62360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |