| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 903240 = | 278 (0.930) | 15 (0.060) | 9/140 | NT | 6.2% | coding (1888/2373 nt) | USA300HOU_RS04470 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 903267 = | 211 (0.810) | coding (1915/2373 nt) | USA300HOU_RS04470 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
TTTAAGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATA > USA300TCH1516_ALE/903150‑903330 | tttAAGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGt > 1:4002705/1‑91 (MQ=255) ttAAGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGtt < 1:5625604/91‑1 (MQ=255) tAAGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGttt > 2:3633815/1‑91 (MQ=255) aaGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTa > 2:624502/1‑91 (MQ=255) aaGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTa < 2:289967/91‑1 (MQ=255) tcaaaatctaaattaattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTaa > 1:2279551‑M1/87‑91 (MQ=255) tcaaaatctaaattaattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTaa < 1:5348011‑M1/5‑1 (MQ=255) aGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTaa > 1:135421/1‑91 (MQ=255) aGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTaa > 1:3807940/1‑91 (MQ=255) tgtACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATg < 1:1527510/91‑1 (MQ=255) aaaatctaaattaattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATg > 1:5250583‑M1/85‑91 (MQ=255) aaatctaaattaattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGc < 2:5711763‑M1/8‑1 (MQ=255) tACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGcc < 2:3712637/91‑1 (MQ=255) aatctaaattaattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGcc > 2:2509344‑M1/83‑91 (MQ=255) aatctaaattaattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGcc < 1:656180‑M1/9‑1 (MQ=255) aCAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCa > 1:4342869/1‑91 (MQ=255) cAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCaa > 1:2426483/1‑91 (MQ=255) aGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAAt < 1:5015421/91‑1 (MQ=255) ttATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAAttt > 1:4430282/1‑91 (MQ=255) ttATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAAttt > 2:1000439/1‑91 (MQ=255) ttCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTGAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTaa > 2:2843711/1‑91 (MQ=255) tcaatcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAATACAGAACAGGCGGGACATTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAt > 1:5710275/1‑91 (MQ=255) tcaatcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAt > 1:2561230/1‑91 (MQ=255) tcaatcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAt > 1:4739267/1‑91 (MQ=255) tcaatcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAt < 1:1490571/91‑1 (MQ=255) tcaatcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAt > 2:2232258/1‑91 (MQ=255) taattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGCCAATTTTAAt > 1:4976008‑M1/74‑91 (MQ=255) aattgctttataaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGCCAATTTTAAT‑g > 2:1409487‑M1/73‑91 (MQ=255) atcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGc > 1:2503125/1‑91 (MQ=255) tcaaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCa > 2:3540422/1‑91 (MQ=255) caaCGAATGGGAGGACTAAATGTAAAGACAAAACAGGCGGGACTGTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCAt < 2:4386402/91‑1 (MQ=255) caaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCAt < 1:5680569/91‑1 (MQ=255) aaCGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCAtt > 2:772418/1‑91 (MQ=255) taaagcacatactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAaga > 2:4160671‑M1/63‑91 (MQ=255) atggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAaga > 2:2335909/1‑91 (MQ=255) atggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAaga > 2:5038617/1‑91 (MQ=255) tggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAagag < 2:4093568/91‑1 (MQ=255) tggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAagag > 1:3478965/1‑91 (MQ=255) tggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAagag > 2:2732507/1‑91 (MQ=255) ggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAgaga > 2:3742745/1‑91 (MQ=255) ggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAgaga > 2:3933153/1‑91 (MQ=255) atgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtt < 1:5499527/91‑1 (MQ=255) atgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtt > 1:729662/1‑91 (MQ=255) atgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtt > 2:4571746/1‑91 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt > 1:2634164/1‑91 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt < 2:519067/91‑1 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt > 1:4255084/1‑91 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt < 1:1787863/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAAt > 1:5843336/1‑91 (MQ=255) aTTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATc > 1:2523766/1‑91 (MQ=255) tttAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCa < 1:3445469/91‑1 (MQ=255) tAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCaaa < 2:1504085/91‑1 (MQ=255) aaaGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAaag < 1:1059696/91‑1 (MQ=255) aaGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACAGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAaaga > 2:1088309/1‑91 (MQ=255) aaGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTAATAGTACCGTTCAATGCCAATATTAAT‑GGCATTAAGGAGAATTTTAAAATCaacga > 2:4905913/1‑88 (MQ=255) cAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGAc > 1:5578611/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACt > 2:4581791/1‑91 (MQ=255) aCAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtata < 1:1170042/91‑1 (MQ=255) aCAGGCGAGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtata < 2:3809591/91‑1 (MQ=255) cAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtatat < 1:3277148/91‑1 (MQ=255) cAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtatat > 2:1948626/1‑91 (MQ=255) aGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtatata > 2:4954506/1‑91 (MQ=255) aGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtatata < 1:1216922/91‑1 (MQ=255) cGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATaaaa > 1:289870/1‑91 (MQ=255) gggACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATaaaaa > 2:5618792/1‑91 (MQ=255) ggACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATaaaaaa > 1:3719565/1‑91 (MQ=255) gACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAAt < 2:4592623/91‑1 (MQ=255) tttAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAg < 2:1140507/91‑1 (MQ=255) tAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCa < 2:4856675/91‑1 (MQ=255) gaagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGt > 2:2091554/1‑91 (MQ=255) gaagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGt > 2:3184549/1‑91 (MQ=255) aagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTg < 2:1213004/91‑1 (MQ=255) aagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTg < 2:133734/91‑1 (MQ=255) aagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCACCAAGTg > 2:5362231/1‑91 (MQ=255) agGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGc > 2:2035838/1‑91 (MQ=255) agGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGc < 2:4429579/91‑1 (MQ=255) gTTATTGATAGTGCCGTTTAAAGCCAAATTTAAA‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCACGTGCTa < 2:3871739/91‑1 (MQ=255) gTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTa > 2:587438/1‑91 (MQ=255) tATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTaga < 2:3100378/91‑1 (MQ=255) tATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTaga > 2:5525555/1‑91 (MQ=255) aTTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTagag > 1:404867/1‑91 (MQ=255) aTTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTagag < 2:2771770/91‑1 (MQ=255) ttGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGt < 1:4153740/91‑1 (MQ=255) ttGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGt < 1:3633815/91‑1 (MQ=255) ggtAGTTCCGTTTAATGCTAATTTTACT‑GGCACTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACGATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAt < 1:4903837/89‑1 (MQ=255) gATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAGAATCAGCAAGTGCTAGAGTAt > 1:3026664/1‑91 (MQ=255) gATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAt < 2:2426130/91‑1 (MQ=255) aTAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAtg < 1:4601054/91‑1 (MQ=255) aTAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAtg < 2:3463360/91‑1 (MQ=255) aGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAtgtg > 1:51566/1‑91 (MQ=255) aGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAtgtg > 1:1010655/1‑91 (MQ=255) gTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGc < 1:203212/91‑1 (MQ=255) gTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGc < 2:4342869/91‑1 (MQ=255) ttctcTTTAATGCCA‑TTAAAATTGGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCt < 1:3238427‑M1/86‑1 (MQ=255) aCCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCtt > 1:4819044/1‑91 (MQ=255) aCCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCtt > 1:92016/1‑91 (MQ=255) cGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTta > 1:351575/1‑91 (MQ=255) cGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTta < 2:3331666/91‑1 (MQ=255) gTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTtat > 2:1789796/1‑91 (MQ=255) TTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTtata < 2:5510336‑M1/91‑1 (MQ=255) | TTTAAGTGTACAGTTATTCAATCAACGAATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATA > USA300TCH1516_ALE/903150‑903330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |