New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 903240 = | 278 (0.930) | 15 (0.060) | 9/140 | NT | 6.2% | coding (1888/2373 nt) | USA300HOU_RS04470 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 903267 = | 211 (0.810) | coding (1915/2373 nt) | USA300HOU_RS04470 | hypothetical protein |
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
AATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGAAACCT > USA300TCH1516_ALE/903177‑903357 | atggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAaga > 2:2335909/1‑91 (MQ=255) atggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAaga < 1:2901732/91‑1 (MQ=255) atggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAaga > 1:2568570/1‑91 (MQ=255) tggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAagag > 1:3478965/1‑91 (MQ=255) tggaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAagag > 2:2732507/1‑91 (MQ=255) gaatgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGaa > 2:4125777/1‑91 (MQ=255) atgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtt > 1:105710/1‑91 (MQ=255) atgCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtt > 1:729662/1‑91 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt > 1:4254177/1‑91 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt > 2:1118855/1‑91 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGAATTAAAGAGAAtttt < 1:5173943/91‑1 (MQ=255) gCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGAGGGACATTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAtttt > 2:3320930/1‑91 (MQ=255) catactctagcacttgctgattttttatatagtcttctttgattttaaaattctctttaatgccaattttaatggcattaaaGAGAAtttt < 2:3340783‑M2/9‑1 (MQ=255) cTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTaa > 2:381535/1‑91 (MQ=255) tAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTaaa > 2:5089775/1‑91 (MQ=255) tAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTaaa < 1:3408090/91‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTaaaa > 2:3577746/1‑91 (MQ=255) aaTTTATGGACAAAACAGTCGGGACTTTAAGATGGTTATTGGTAGTACCGTTTAATGCGAATTGTATT‑GGCATTAAAGAGTATTTTAatat < 2:2860178/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAAt > 1:5843336/1‑91 (MQ=255) tttAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCa < 2:4585876/91‑1 (MQ=255) tAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCaaa < 1:2426950/91‑1 (MQ=255) tAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCaaa < 2:1504085/91‑1 (MQ=255) tAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAAGTTTAAAATCaaa > 2:3874592/1‑91 (MQ=255) aaGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAaaga > 1:1513796/1‑91 (MQ=255) aGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAaagaa > 1:3704313/1‑91 (MQ=255) aGACAAAACAGGCGGGACTTCAAGAAGGCTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATATTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAaagca > 2:3068308/1‑89 (MQ=255) aCAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAagaaga < 2:448742/91‑1 (MQ=255) cAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGAc > 1:5578611/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACt < 2:4869014/91‑1 (MQ=255) aaaaCAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACt > 2:4581791/1‑91 (MQ=255) aaaCAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACta > 1:1273646/1‑91 (MQ=255) aCAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtata > 1:5761248/1‑91 (MQ=255) cAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtatat > 2:1948626/1‑91 (MQ=255) cAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACtatat < 2:441223/91‑1 (MQ=255) ggCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATaa < 2:5694687/91‑1 (MQ=255) gggACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATaaaaa > 2:2560460/1‑91 (MQ=255) gggACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATaaaaa > 1:2521825/1‑91 (MQ=255) tagtcttctttgattttaaaattctcTTTAATGCCA‑TTAAAATTGGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCa < 1:197156‑M1/65‑1 (MQ=255) ttAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGc < 1:4093368/91‑1 (MQ=255) gaagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGt > 2:2091554/1‑91 (MQ=255) aagGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCACCAAGTg > 2:5362231/1‑91 (MQ=255) agGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGc > 1:427021/1‑91 (MQ=255) ggtATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAAAAAAAAAAAAAAATCAGCAAGTGCTa < 2:4191203/89‑1 (MQ=255) tATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTaga > 2:5525400/1‑91 (MQ=255) aTTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTagag < 2:2771770/91‑1 (MQ=255) aTTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTagag > 1:4041879/1‑91 (MQ=255) ttGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGt < 1:3633815/91‑1 (MQ=255) gATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAt > 2:1176436/1‑91 (MQ=255) gATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAt < 2:4930363/91‑1 (MQ=255) aTAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAtg < 2:3463360/91‑1 (MQ=255) aGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTAtgtg > 1:1010655/1‑91 (MQ=255) gTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGc < 2:4342869/91‑1 (MQ=255) ttctcTTTAATGCCA‑TTAAAATTGGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCt < 1:3238427‑M1/86‑1 (MQ=255) tACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCt > 2:3779457/1‑91 (MQ=255) aCCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCtt > 1:4819044/1‑91 (MQ=255) aCCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCtt > 1:5021774/1‑91 (MQ=255) cGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTta < 2:3704210/91‑1 (MQ=255) gTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTtat > 1:876778/1‑91 (MQ=255) TTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTtata < 2:5599299‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTtata < 2:5510336‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATaaa > 1:1214317‑M1/1‑91 (MQ=255) TAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATaaa < 1:2863108‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATaaa < 2:5808051‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATaaa < 1:353061‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATaaa < 1:3799290‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATaaa < 1:5157886‑M1/91‑1 (MQ=255) AATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAg > 2:4755601‑M1/1‑91 (MQ=255) AATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAg < 2:5016367‑M1/91‑1 (MQ=255) TGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCa > 1:1088309‑M1/1‑91 (MQ=255) CCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAAt < 2:2033422‑M1/91‑1 (MQ=255) CAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAAtt > 2:1052295‑M1/1‑91 (MQ=255) CAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAAtt < 1:1702572‑M1/91‑1 (MQ=255) cattaaaattggcattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaatt > 2:1408874‑M2/20‑91 (MQ=255) AATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAGGACTATATAAAGAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTa > 1:4880736‑M1/1‑91 (MQ=255) AATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTa < 1:2751279‑M1/91‑1 (MQ=255) AATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTa < 1:5648407‑M1/91‑1 (MQ=255) attaaaattggcattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaatta > 1:4976008‑M2/19‑91 (MQ=255) attaaaattggcattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaatta > 2:3170456‑M2/19‑91 (MQ=255) attaaaattggcattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaatta > 1:3292433‑M2/19‑91 (MQ=255) aTTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaattaa < 1:2678854/91‑1 (MQ=255) ttttAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaattaat > 1:394359/1‑91 (MQ=255) ttttAAT‑AGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaattaat < 2:5578592/91‑1 (MQ=255) tttAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaattaatt < 2:802099/91‑1 (MQ=255) tttAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCaattaatt < 1:5494429/91‑1 (MQ=255) tAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTa < 2:1299636/91‑1 (MQ=255) aaT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAg > 1:5534849/1‑91 (MQ=255) aT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGa > 2:4090266/1‑91 (MQ=255) aT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGa > 2:242784/1‑91 (MQ=255) ggcattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGAtt < 1:656180‑M2/82‑1 (MQ=255) gcattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGAttt > 2:1648868‑M2/9‑91 (MQ=255) cattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGAtttt < 1:930559‑M2/84‑1 (MQ=255) cattaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGAtttt < 1:5273708‑M2/84‑1 (MQ=255) attaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTg < 2:634198‑M2/85‑1 (MQ=255) ttaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGa < 1:1648868‑M2/86‑1 (MQ=255) ttaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGa > 1:2279551‑M2/6‑91 (MQ=255) ttaaaGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGa < 1:5348011‑M2/86‑1 (MQ=255) aGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGAAAcc > 1:4694119‑M2/2‑91 (MQ=255) gagaATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGAAACCt < 1:4535517/91‑1 (MQ=255) gagaATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGAAACCt < 1:3118496/91‑1 (MQ=255) gagaATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGAAACCt < 2:3967193/91‑1 (MQ=255) | AATGGAATGCCTAAATTTAAAGACAAAACAGGCGGGACTTTAAGAAGGTTATTGATAGTACCGTTTAATGCCAATTTTAAT‑GGCATTAAAGAGAATTTTAAAATCAAAGAAGACTATATAAAAAATCAGCAAGTGCTAGAGTATGTGCTTTATAAAGCAATTAATTTAGATTTTGAAACCT > USA300TCH1516_ALE/903177‑903357 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |