| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1279936 = | 287 (0.960) | 14 (0.070) +TTTGAAAATTATACGCAATATTAAC |
4/110 | NT | 6.8% | intergenic (+29/‑233) | cdsA/USA300HOU_RS06360 | Phosphatidate cytidylyltransferase/Putative zinc metalloprotease |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1279975 = | 275 (0.920) | intergenic (+68/‑194) | cdsA/USA300HOU_RS06360 | Phosphatidate cytidylyltransferase/Putative zinc metalloprotease | |||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
ACCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTT > USA300TCH1516_ALE/1279846‑1280026 | aCCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAaga < 2:59507/91‑1 (MQ=255)aCCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAaga < 2:2461347/91‑1 (MQ=255)aCCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAaga < 1:1987237/91‑1 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag < 2:5852227/91‑1 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag < 1:2705578/91‑1 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag > 2:269938/1‑91 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag < 2:4826303/91‑1 (MQ=255) cGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagg > 1:3923947/1‑91 (MQ=255) cGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagg > 2:3817571/1‑91 (MQ=255) cGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagg < 2:208967/91‑1 (MQ=255) cGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagg > 2:1445162/1‑91 (MQ=255) cGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagg < 1:2394125/91‑1 (MQ=255) gATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATACACGTAAAgagga > 1:854260/1‑91 (MQ=255) gATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagga > 2:4540035/1‑91 (MQ=255) aTTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgaggag < 2:3305309/91‑1 (MQ=255) tttGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGt < 2:417086/91‑1 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcttataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 1:3662732‑M1/86‑91 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 2:3105184‑M1/86‑91 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 2:5560954‑M1/86‑91 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 1:1275378‑M1/86‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGtt < 1:1094697‑M1/7‑1 (MQ=255) gCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTgag < 2:1721523/91‑1 (MQ=255) cTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTgaga < 1:835225/91‑1 (MQ=255) cTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTgaga < 2:2006028/91‑1 (MQ=255) ttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATa < 2:1449097/91‑1 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt > 1:1929461/1‑91 (MQ=255) tGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAtt < 1:2262576/91‑1 (MQ=255) gTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAttt < 1:887390/91‑1 (MQ=255) tttGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTa < 1:5192340/91‑1 (MQ=255) tttGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTa < 2:1112919/91‑1 (MQ=255) tgtgTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAAt > 1:374320/1‑91 (MQ=255) tgtgTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAAt > 1:4234984/1‑91 (MQ=255) tgtgTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAAt > 1:4371240/1‑91 (MQ=255) gtgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATg > 1:3574598/1‑91 (MQ=255) gtgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATg > 1:3156087/1‑91 (MQ=255) tgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGa < 1:185940/91‑1 (MQ=255) tgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGa < 1:1542639/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa < 2:1243045/91‑1 (MQ=255) tattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATGTAATGAATCTCAGaa > 1:3269656/1‑91 (MQ=255) attaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAAc > 1:289077/1‑91 (MQ=255) ttaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACt > 1:539698/1‑91 (MQ=255) ttaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACt > 2:4095049/1‑91 (MQ=255) ttaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACt > 1:3125989/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTcc > 1:4131979/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTcc < 1:4343262/91‑1 (MQ=255) atatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtt > 1:159541/1‑91 (MQ=255) atatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtt > 2:2589315/1‑91 (MQ=255) tatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCttt < 2:2796777/91‑1 (MQ=255) atTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtttt < 1:4981093/91‑1 (MQ=255) atTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtttt > 1:2849234/1‑91 (MQ=255) ttttATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTg < 2:47410/91‑1 (MQ=255) ttattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaa < 2:3939583/91‑1 (MQ=255) tattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaaa > 2:193279/1‑91 (MQ=255) tattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaaa < 1:4825543/91‑1 (MQ=255) ttaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAAt > 1:3451868/1‑91 (MQ=255) ttaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAAt < 2:182940/91‑1 (MQ=255) tACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATtata > 1:1387018/1‑91 (MQ=255) tACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTGTTGAAAATtata > 2:3755045/1‑91 (MQ=255) cAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACg < 2:3646841/91‑1 (MQ=255) cAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACg < 1:4708106/91‑1 (MQ=255) aaTCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGc < 2:2855087/91‑1 (MQ=255) tCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCaa > 2:4140074/1‑91 (MQ=255) tCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCaa > 1:1789639/1‑91 (MQ=255) cTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAat < 2:5114245/91‑1 (MQ=255) cTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAat > 1:659566/1‑91 (MQ=255) cTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAat < 2:2320610/91‑1 (MQ=255) tAATGCTGAGAACAAATGAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAatat > 1:5683872/1‑91 (MQ=255) tAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGGATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAatat < 1:2309975/91‑1 (MQ=255) tAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAatat < 1:4538409/91‑1 (MQ=255) tAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAatat < 2:703286/91‑1 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 2:809739/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 1:254313/1‑91 (MQ=255) aTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 1:772006/1‑91 (MQ=255) aTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTa < 2:1533684/91‑1 (MQ=255) gCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAAc > 2:2523284/1‑91 (MQ=255) gCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAAc > 2:1869420/1‑91 (MQ=255) tGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGGGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt < 1:1774889/91‑1 (MQ=255) tGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 1:3013628/1‑91 (MQ=255) agaACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTg > 2:4956806/1‑91 (MQ=255) agaACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTg < 1:5046305/91‑1 (MQ=255) gaACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGa < 2:3404450/91‑1 (MQ=255) aaCAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGaa < 1:1009480/91‑1 (MQ=255) aTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGTAAATta > 2:5375756/1‑91 (MQ=255) aTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATta > 2:3701923/1‑91 (MQ=255) tCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATtat > 1:559109/1‑91 (MQ=255) aaTAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATAc > 1:948217/1‑91 (MQ=255) aTAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACg > 1:5794811/1‑91 (MQ=255) tAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGc < 2:2300603/91‑1 (MQ=255) aaaaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGc < 2:899107/90‑1 (MQ=255) accGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATACTTTAATGAGTCTCAGAACTCCTTTTGAAACATATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGaaa > 2:4891362/3‑91 (MQ=25) aaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCaa < 2:4240109/91‑1 (MQ=255) cGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAata > 2:1365792/1‑91 (MQ=255) cGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAata > 1:462224/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATAtt < 2:1604758/91‑1 (MQ=255) aaaGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 2:1040075/1‑91 (MQ=255) agagGAGTTGCTGAAATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAAc < 2:581860/91‑1 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 2:3998917/1‑91 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt < 1:3984568/91‑1 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 1:3884814/1‑91 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 1:2430854/1‑91 (MQ=255) | ACCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTT > USA300TCH1516_ALE/1279846‑1280026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |