| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1960840 = | 279 (0.930) | 12 (0.050) | 13/126 | NT | 5.6% | intergenic (+860/+529) | USA300TCH1516_01817/USA300TCH1516_01818 | hypothetical protein/tRNA‑Ser |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1960879 = | 187 (0.800) | intergenic (+899/+490) | USA300TCH1516_01817/USA300TCH1516_01818 | hypothetical protein/tRNA‑Ser | |||||
Only 100 of 396 total aligned reads displayed.
GAAATGGTCTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGC > USA300TCH1516_ALE/1960750‑1960930 | taatcaatcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattaa > 1:51952‑M1/90‑91 (MQ=255) aaaTGGTCTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCaa < 1:5166175/91‑1 (MQ=255) atcaatcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattaata > 2:4578697‑M1/88‑91 (MQ=255) atcaatcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattaata > 2:2199333‑M1/88‑91 (MQ=255) tcaatcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaacaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattaataa > 2:5681796‑M1/87‑91 (MQ=255) caatcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATaaa < 2:767376‑M1/6‑1 (MQ=255) caatcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATaaa > 1:565784‑M1/86‑91 (MQ=255) atcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAgg < 2:2824960‑M1/8‑1 (MQ=255) atcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAgg > 2:58683‑M1/84‑91 (MQ=255) tcggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGc < 1:3122435‑M1/9‑1 (MQ=255) cTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGc > 2:4748907/1‑91 (MQ=255) cTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGc < 2:5347802/91‑1 (MQ=255) cTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGc < 1:3370945/91‑1 (MQ=255) cTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGc > 2:1476046/1‑91 (MQ=255) cTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACACTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATGAAGGc < 2:5739784/91‑1 (MQ=255) taataaATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCt > 2:699002/1‑91 (MQ=255) taataaATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCt < 1:3900358/91‑1 (MQ=255) cggcatctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCt > 1:2881925‑M1/82‑91 (MQ=255) aataaATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTa < 2:1578820/91‑1 (MQ=255) taaATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTaaa < 1:3494483/91‑1 (MQ=255) catctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTaaa < 2:3811154‑M1/13‑1 (MQ=255) atctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAg > 1:2616444‑M1/78‑91 (MQ=255) aaTCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGt < 1:2040748/91‑1 (MQ=255) aaTCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAAGTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATACAGGCTAAAGt > 1:5829195/1‑91 (MQ=255) ctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTa > 1:3053167‑M1/76‑91 (MQ=255) ctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTa < 2:1306912‑M1/16‑1 (MQ=255) ctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTa > 1:1872004‑M1/76‑91 (MQ=255) ctacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTa > 1:2755949‑M1/76‑91 (MQ=255) aTCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTa > 1:3191703/1‑91 (MQ=255) tacgtgcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTaa > 1:59855‑M1/75‑91 (MQ=255) tCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTaa > 1:1917042/1‑91 (MQ=255) aaaTATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAAc < 2:1423927/91‑1 (MQ=255) aaaTATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAAc < 2:3322998/91‑1 (MQ=255) aaaTATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAAc > 2:2588256/1‑91 (MQ=255) aaaTATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAAc > 2:3111508/1‑91 (MQ=255) aaTATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACt > 2:295882/1‑91 (MQ=255) aaTATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACt > 1:3392157/1‑91 (MQ=255) atatCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAGGGCTAAAGTAAACTa < 1:690186/91‑1 (MQ=255) atatCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTa < 1:1774205/91‑1 (MQ=255) atatCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTa > 1:5052393/1‑91 (MQ=255) atatCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGAAATAAAGGCTAAAGTAAACTa < 2:4129961/91‑1 (MQ=255) tatCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTa‑a > 1:3703610/1‑91 (MQ=255) gcggattataaagtaaagcgtagcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTAAACTa‑a > 2:463792‑M1/70‑91 (MQ=255) atCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑At < 1:282553/91‑1 (MQ=255) atCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑At < 2:5555772/91‑1 (MQ=255) cATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑a > 2:1158135/1‑91 (MQ=255) cATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑a > 2:103439/1‑91 (MQ=255) tGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACtt < 2:5130867/91‑1 (MQ=255) tGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACtt > 2:5012926/1‑91 (MQ=255) gAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACttt < 2:441829/91‑1 (MQ=255) aaCTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAg > 1:1308080/1‑91 (MQ=255) cTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATGAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGcc < 2:5650922/91‑1 (MQ=255) ttAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCtt > 1:2658832/1‑91 (MQ=255) tAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCttt < 2:3637720/91‑1 (MQ=255) aaTCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTtta > 2:2090104/1‑91 (MQ=255) aTCACATAAATT‑ACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTttatt < 1:1423621/91‑1 (MQ=255) acaTAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATtaa < 1:4362645/91‑1 (MQ=255) agcataaccaggagttagtcgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAg > 1:5618604‑M1/49‑62 (MQ=255) tAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATtaataa < 2:2762439/91‑1 (MQ=255) aaaTTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTaataat < 1:2967674/91‑1 (MQ=255) aaaTTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTaataat < 2:5477997/91‑1 (MQ=255) aaTTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAAtt < 2:4057505/91‑1 (MQ=255) aTTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAAttt < 2:1266100/91‑1 (MQ=255) tAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAg < 1:3268051/91‑1 (MQ=255) aaCAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGt > 1:2572381/1‑91 (MQ=255) aaCAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGt > 1:4215223/1‑91 (MQ=255) aCAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTc > 1:4493447/1‑91 (MQ=255) gtagtCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGaa > 2:3742233/1‑91 (MQ=255) gtCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAAttt < 2:1919388/91‑1 (MQ=255) gtCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAAttt > 2:289605/1‑91 (MQ=255) tCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATtta < 1:1158135/91‑1 (MQ=255) cACCTATTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATttat < 2:4270271/91‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATttatta < 1:836139/91‑1 (MQ=255) cgatttttaataaattcgactaaattattAATAAAGGCTAAAGTAAT‑TA‑GTTTACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTaa < 1:4131713‑M1/62‑1 (MQ=255) ttCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTaaaaa > 2:2653910/1‑91 (MQ=255) ttCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTaaaaa > 1:4026745/1‑91 (MQ=255) cAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGa > 1:1001359/1‑91 (MQ=255) cAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGa > 1:1703596/1‑91 (MQ=255) cAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGa > 1:5004845/1‑91 (MQ=255) cAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGa > 2:176858/1‑91 (MQ=255) gTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACt < 1:5560500/91‑1 (MQ=255) ttCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTa < 2:4847330/91‑1 (MQ=255) tCTATACATTACAATTGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCGTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTaa < 1:4870510/91‑1 (MQ=255) tCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAACTCGAcaca > 2:5168378/1‑88 (MQ=255) tCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTaa < 1:2337065/91‑1 (MQ=255) tCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTaa < 1:2382528/91‑1 (MQ=255) cTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAAc > 2:4705082/1‑91 (MQ=255) tataAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACt < 2:3014442/91‑1 (MQ=255) ataAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTCTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTc < 1:5701789/91‑1 (MQ=255) taAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTcc > 1:3616571/1‑91 (MQ=255) aaaTTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCt < 1:2102229/91‑1 (MQ=255) aaTTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTg < 1:4748907/91‑1 (MQ=255) aaTGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGc < 2:4948033/91‑1 (MQ=255) aaTGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGc < 1:867940/91‑1 (MQ=255) tattAATAAAGGCTAAAGTAAT‑TAGTTT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCt < 1:756150‑M1/87‑1 (MQ=255) aTGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTACTAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTCAATCCTCGTTATGcc > 2:577312/1‑90 (MQ=255) aTGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCt < 2:1696486/91‑1 (MQ=255) tGCAATAAATGCTAAATTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAACTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTa > 1:5370142/1‑91 (MQ=255) gCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTAc > 1:1496541/1‑91 (MQ=255) cAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACg < 2:2409565/91‑1 (MQ=255) | GAAATGGTCTAATAAATCAAATATCATTGAAACTTTAATCACATAAATTAACAGTAGTCACCTGTTCGCAGTTCTATAAATTACAAATGCAATAAAGGCTAAAGTAAACTA‑ATT‑ACTTTAGCCTTTATTAATAATTTAGTCGAATTTATTAAAAATCGACTAACTCCTGGTTATGCTACGC > USA300TCH1516_ALE/1960750‑1960930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |