| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 384771 | 307 (1.030) | 15 (0.060) | 8/144 | NT | 5.2% | coding (1840/1956 nt) | licR | putative licABCH operon regulator |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 384781 | 274 (1.020) | coding (1830/1956 nt) | licR | putative licABCH operon regulator | |||||
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
TTTAATTTTAAAAATATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGAAATATGTT > USA300TCH1516_ALE/384691‑384871 | tttAATTTTAAAAATATTCCCATCTAAGAAAGCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAAtgt > 1:5722039/1‑91 (MQ=255)cactgaagggattatctttggtagtaaagctaacgatcccgttcaccttgtaattacattagcaacggaccacCCCAATGC‑C‑TTTAAAtgt > 2:2862818‑M1/74‑91 (MQ=255) tAATTTTAAAAATATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTgc > 2:5208671‑M2/1‑89 (MQ=255) tAATTTTAAAAATATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTgc > 1:525425‑M2/1‑89 (MQ=255) ctgaagggattgtctttggtagtaaagctaacgatcccgttcaccttgtaattacattagcaacggaccacCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGc > 2:5846406‑M1/72‑91 (MQ=255) ctgaagggattatctttggtagtaaagctaacgatcccgttcaccttgtaattacattagcaacggaccacCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGc > 2:2612518‑M1/72‑91 (MQ=255) aaTTTTAAAAATATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTgca > 1:5501240‑M2/1‑88 (MQ=255) ttttAAAAATATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTgcatt > 2:3681570‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaaaTATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTgggg > 2:1559163/1‑91 (MQ=255) aaaaaTATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTgggg < 1:4604453/91‑1 (MQ=255) aaaaTATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGggt < 1:4307526/91‑1 (MQ=255) aaaaTATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGggt < 1:5463203/91‑1 (MQ=255) atTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTcc < 2:209777/91‑1 (MQ=255) atTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTcc > 1:5423088/1‑91 (MQ=255) atTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTcc > 1:2317755/1‑91 (MQ=255) cccATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGtt > 1:2947207/1‑91 (MQ=255) cccATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGtt > 2:4946514/1‑91 (MQ=255) ccATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTg < 1:3459140/91‑1 (MQ=255) cATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGc > 1:3598477/1‑91 (MQ=255) aTCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCt < 2:5505397/91‑1 (MQ=255) aTCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCt < 1:199104/91‑1 (MQ=255) cTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTaa < 2:3408425/91‑1 (MQ=255) aaGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATg < 2:2543049/91‑1 (MQ=255) aGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGt < 2:305101/91‑1 (MQ=255) gAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTa < 2:718176/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTaa < 1:827641/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTaa > 1:2036976/1‑91 (MQ=255) tCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTa > 2:3727179/1‑91 (MQ=255) tCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTAGGGTGGTCCGTTGCTAATGt > 2:5436939/1‑86 (MQ=255) cTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTAc > 1:1415277/1‑91 (MQ=255) cTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTAc < 1:5293639/91‑1 (MQ=255) cTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTAc < 1:4055609/91‑1 (MQ=255) cTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTAc < 2:2284929/91‑1 (MQ=255) ttGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACa > 1:4762821/1‑91 (MQ=255) ttGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACa > 1:2553280/1‑91 (MQ=255) ttGTCGATATAAGGCGTTGCTTAAGCATTCGCGTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTGATGTAATTACa < 2:1972982/91‑1 (MQ=255) tGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACaa > 2:3532561/1‑91 (MQ=255) gTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAg > 1:3648225/1‑91 (MQ=255) gTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAg < 1:1755492/91‑1 (MQ=255) gTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAg < 1:1913354/91‑1 (MQ=255) gTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAg > 1:2224727/1‑91 (MQ=255) tCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAgg < 1:2097018/91‑1 (MQ=255) cGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGt > 1:5614000/1‑91 (MQ=255) cGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGt > 2:4136734/1‑91 (MQ=255) gATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTg < 2:5716904/91‑1 (MQ=255) tataAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGaa < 2:1709050/91‑1 (MQ=255) ataAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAAc < 1:919162/91‑1 (MQ=255) aaGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACgg < 2:1378414/91‑1 (MQ=255) aaGTCATTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACgg < 2:2446464/91‑1 (MQ=255) cGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATc > 1:1498865/1‑91 (MQ=255) gTTGCTTCAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGGGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCg < 2:4539281/91‑1 (MQ=255) ttGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGt < 1:3188643/91‑1 (MQ=255) ttGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGt < 1:5001053/91‑1 (MQ=255) tGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGtt > 1:5314073/1‑91 (MQ=255) gCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTa > 1:4211763/1‑91 (MQ=255) cTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAg < 1:279803/91‑1 (MQ=255) cTTAAGCATTCGCGTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAg < 2:2829306/91‑1 (MQ=255) tAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCt > 2:5339018/1‑91 (MQ=255) aaGCATTGGCTTAACTCTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCtt < 2:5586855/91‑1 (MQ=255) aaGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCtt > 2:308242/1‑91 (MQ=255) aGCATTCGCTTAGCTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCttt < 2:3786467/91‑1 (MQ=255) aGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCttt < 1:4402765/91‑1 (MQ=255) gCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTta > 1:3048608/1‑91 (MQ=255) cATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTtac < 1:39768/91‑1 (MQ=255) cATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTtac < 2:1030889/91‑1 (MQ=255) cGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTAcc > 1:1268412/1‑91 (MQ=255) gCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCa > 2:4314639/1‑91 (MQ=255) gCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCa < 1:1697017/91‑1 (MQ=255) cTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCaa < 2:3246034/91‑1 (MQ=255) cTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTCTACTACCaa < 1:4941313/91‑1 (MQ=255) ttAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCaaa > 2:4793748/1‑91 (MQ=255) cggaccacCCCAATGCACATTTAAA‑G‑GCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCaaa < 1:3291927‑M1/83‑1 (MQ=255) aaCTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGa < 2:878391/91‑1 (MQ=255) aaCTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGa < 2:297695/91‑1 (MQ=255) aaCTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGa < 1:1947209/91‑1 (MQ=255) aaCTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGa < 1:4463701/91‑1 (MQ=255) aCTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGAt > 1:1614241/1‑91 (MQ=255) cTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATa < 2:1928174/91‑1 (MQ=255) cTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATa < 2:4111130/91‑1 (MQ=255) tGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATaa < 1:1016915/91‑1 (MQ=255) CCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATcc > 1:5764024‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATcc > 2:1116727‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATcc < 1:2682975‑M1/91‑1 (MQ=255) CCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATccc < 1:509715‑M1/91‑1 (MQ=255) CCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATccc < 1:4154563‑M1/91‑1 (MQ=255) CAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCt > 1:1554925‑M1/1‑91 (MQ=255) CAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCt > 1:3710333‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTc > 1:389889‑M1/1‑91 (MQ=255) c‑TTTAAATGTgcattgggacagttaagcgaatgcttaagcaacgacttatatcgacaagatttcttagatgggaatatttttaaaattaaa < 1:1156264‑M2/91‑82 (MQ=255) c‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTg > 1:4687108/1‑91 (MQ=255) tttAAATGTgcattgggacagttaagcgaatgcttaagcaacgacttatatcgacaagatttcttagatgggaatatttttaaaattaaac < 2:2802441‑M2/91‑83 (MQ=255) tttAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGa > 1:2834843/1‑91 (MQ=255) ttAAATGTgcattgggacagttaagcgaatgcttaagcaacgacttatatcgacaagatttcttagatgggaatatttttaaaattaaaca < 2:2198956‑M2/91‑84 (MQ=255) ttAAATGTgcattgggacagttaagcgaatgcttaagcaacgacttatatcgacaagatttcttagatgggaatatttttaaaattaaaca < 2:680243‑M2/91‑84 (MQ=255) ttAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGaa > 2:3903107/1‑91 (MQ=255) tAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGaaa > 1:2433794/1‑91 (MQ=255) tAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGaaa < 2:1259997/91‑1 (MQ=255) tAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAAGCCCTTCAGTGaaa > 2:5257389/1‑91 (MQ=255) aaTGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGAAata < 2:3213594/91‑1 (MQ=255) tgCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATACCTTCAGTGAAATATGtt < 1:660861/91‑1 (MQ=255) | TTTAATTTTAAAAATATTCCCATCTAAGAAATCTTGTCGATATAAGTCGTTGCTTAAGCATTCGCTTAACTGTCCCAATGC‑C‑TTTAAATGTGCATTGGGGTGGTCCGTTGCTAATGTAATTACAAGGTGAACGGGATCGTTAGCTTTACTACCAAAGATAATCCCTTCAGTGAAATATGTT > USA300TCH1516_ALE/384691‑384871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |