New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1435396 | 272 (0.910) | 14 (0.050) | 9/140 | NT | 5.5% | intergenic (+33/‑110) | dapH/yxeP_3 | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase/putative hydrolase YxeP |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1435406 | 242 (0.930) | intergenic (+43/‑100) | dapH/yxeP_3 | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase/putative hydrolase YxeP |
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
GATACTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAGTAATTTAACACAAAGGA > USA300TCH1516_ALE/1435316‑1435496 | gATACTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATg > 1:2212802/1‑91 (MQ=255) aTACTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGCCGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGCTACGATTATGt < 2:5846587‑M2/91‑2 (MQ=255) aTACTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGt < 2:4017381‑M2/91‑2 (MQ=255) cTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGtctc > 2:4239016‑M2/1‑87 (MQ=255) cTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGtctc < 2:3981487‑M2/91‑5 (MQ=255) cTAAAAAAGAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGtctc > 1:2437738‑M2/1‑87 (MQ=255) 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caTTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGa < 2:249053/91‑1 (MQ=255) caTTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGa < 1:2345828/91‑1 (MQ=255) caTTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGACATAATCGTAtctcaaccttgaaattattatacgt > 2:5500120‑M2/1‑66 (MQ=255) aTTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGaa < 1:1331354/91‑1 (MQ=255) aGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATaaa > 2:1929887/1‑91 (MQ=255) gAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAAc > 1:3471860/1‑91 (MQ=255) aaaaCTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACt > 1:5207666/1‑91 (MQ=255) aaCTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTa > 2:1900807/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |