| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1456995 = | 136 (0.460) | 26 (0.090) +TTAAA |
4/150 | NT | 12.0% | intergenic (‑109/‑135) | USA300HOU_RS07230/USA300HOU_RS07235 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1918582 | 272 (0.910) | intergenic (‑300/+198) | USA300HOU_RS07235/USA300HOU_RS09510 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
TAGAACCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTCAT > USA300TCH1516_ALE/1918492‑1918672 | tAGAACCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctc < 2:1638549/91‑1 (MQ=255) gAACCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctcct < 1:2031672/91‑1 (MQ=255) gAACCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctcct < 1:3546389/91‑1 (MQ=255) aCCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCctct < 1:2025032/91‑1 (MQ=255) ccTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCtt > 1:3041304/1‑91 (MQ=255) ccTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCtt < 1:74563/91‑1 (MQ=255) ccTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCtt < 1:4811526/91‑1 (MQ=255) cTTTTCTGAAGCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTa < 1:5845013/91‑1 (MQ=255) tttCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGATTGGCTCCTCTTAtt > 2:4527340/1‑91 (MQ=255) ccATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGc > 2:3617195/1‑91 (MQ=255) ccATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGc > 2:2360845/1‑91 (MQ=255) ccATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGc < 1:4312356/91‑1 (MQ=255) cATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATTGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCt < 2:2969560/91‑1 (MQ=255) cATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCt < 2:1089381/91‑1 (MQ=255) cATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCt > 1:4957543/1‑91 (MQ=255) aTACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTa < 1:4070730/91‑1 (MQ=255) aTACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTa < 1:1900134/91‑1 (MQ=255) tACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaa > 2:1886371/1‑91 (MQ=255) tACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaa < 2:2263689/91‑1 (MQ=255) tACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaa < 1:348984/91‑1 (MQ=255) cGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaa > 1:2432657/1‑91 (MQ=255) cGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaa < 2:3783444/91‑1 (MQ=255) gCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaaa > 1:4525309/1‑91 (MQ=255) cATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAt > 2:2873774/1‑91 (MQ=255) atgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAttt > 1:3218854/3‑91 (MQ=255) aGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTta < 1:2216066/91‑1 (MQ=255) aGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTta > 1:1758418/1‑91 (MQ=255) aGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTta > 1:1500423/1‑91 (MQ=255) gCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTtat > 1:4056302/1‑91 (MQ=255) cGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTtata < 1:1709527/91‑1 (MQ=255) gTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAg < 1:1111420/91‑1 (MQ=255) tATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAgg < 2:5527732/91‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGc < 1:3677553/91‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGc > 1:1221003/1‑91 (MQ=255) tGGTTTTCTTTTTAGAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGATAAAAAGTTATAGGCa < 1:5379053/91‑1 (MQ=255) tGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCa < 1:1063724/91‑1 (MQ=255) ggTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCaa < 2:690060/91‑1 (MQ=255) ggTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCaa < 2:4846174/91‑1 (MQ=255) gTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAt > 1:3723652/1‑91 (MQ=255) gTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAt > 1:3818702/1‑91 (MQ=255) ttttCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAtt < 2:1722439/91‑1 (MQ=255) ttttCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAtt > 2:1127302/1‑91 (MQ=255) ttttCTTATTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGACTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAtt > 1:5637709/1‑91 (MQ=255) ttCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAtttt < 1:832897/91‑1 (MQ=255) tCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTtta < 2:644330/91‑1 (MQ=255) cTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTttat < 2:1236732/91‑1 (MQ=255) cTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTttat < 1:2264330/91‑1 (MQ=255) ttttACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTttatta > 2:1426122/1‑91 (MQ=255) ttACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTaca < 1:5016624/91‑1 (MQ=255) aCAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTacaac < 2:5340696/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATg > 2:2205594/1‑91 (MQ=255) ttAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATg < 2:4598969/91‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGt < 1:994268/91‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGt > 2:5112617/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGt < 1:1659515/91‑1 (MQ=255) aaaGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTa > 1:4372358/1‑91 (MQ=255) aaGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAACGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTAc < 1:5177184/91‑1 (MQ=255) gagCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACAt > 1:2493152/1‑91 (MQ=255) agCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACAtt > 2:4408762/1‑91 (MQ=255) gCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACAttt > 2:2037852/1‑91 (MQ=255) cAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTaa > 2:3275882/1‑91 (MQ=255) aaCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAg < 2:1567270/91‑1 (MQ=255) aaCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAg > 2:4199901/1‑91 (MQ=255) aaCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAg < 1:2700419/91‑1 (MQ=255) aaCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAg < 2:2421731/91‑1 (MQ=255) aCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAgg > 1:1291894/1‑91 (MQ=255) ccGTTGTTATATTCTAAATTTTGTTTGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGt > 2:2931451/1‑91 (MQ=255) cGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtc < 1:2125212‑M2/91‑63 (MQ=255) cGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTg < 1:5296600/91‑1 (MQ=255) cGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTg < 1:138628/91‑1 (MQ=255) ttgttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcac < 2:406584‑M2/91‑65 (MQ=255) tgttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGAcc < 2:2084000/91‑1 (MQ=255) gttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCt > 2:4240401/1‑91 (MQ=255) ttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCtt > 2:5010390/1‑91 (MQ=255) ataGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATCTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCa > 2:3483244/1‑91 (MQ=255) actCTAACAACGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATg < 2:4646979/89‑1 (MQ=255) gTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGc > 1:28224/1‑91 (MQ=255) gTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGc < 1:2903441/91‑1 (MQ=255) gTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGc < 1:3891282/91‑1 (MQ=255) gTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGc < 2:4759190/91‑1 (MQ=255) gTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGc < 1:927646/91‑1 (MQ=255) tCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGcc > 2:830394/1‑91 (MQ=255) aaCAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCaaa > 1:713202/1‑91 (MQ=255) aCAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCaaaa < 1:5046645/91‑1 (MQ=255) ggTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacg < 1:1503974‑M2/91‑83 (MQ=255) ggTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacg < 1:464452‑M2/91‑83 (MQ=255) ggTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacg > 2:509027‑M2/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCa > 1:4500779/1‑91 (MQ=255) ggTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCa > 1:602230/1‑91 (MQ=255) ttGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATGTTATTACAACAATGTACATTTAACGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATc > 2:5420779/1‑91 (MQ=255) tGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgc < 2:3082245‑M2/91‑86 (MQ=255) ggCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCAc > 1:5458280/1‑91 (MQ=255) ggCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCAc < 1:5574345/91‑1 (MQ=255) ggCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCAc > 2:5794899/1‑91 (MQ=255) ggCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCAc < 1:1436124/91‑1 (MQ=255) gCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgcta < 2:2675344‑M2/91‑88 (MQ=255) ctcctcTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTc > 1:1851736/1‑91 (MQ=255) ctcctcTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTc > 2:366738/1‑91 (MQ=255) ctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctagaa > 1:5746839‑M2/1‑1 (MQ=255) cctcTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTCAt > 2:2997545/1‑91 (MQ=255) | TAGAACCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTCAT > USA300TCH1516_ALE/1918492‑1918672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |