New junction evidence | |||||||||||
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? | USA300TCH1516_ALE | = 1955663 | 201 (0.780) | intergenic (‑717/+405) | gdmA/lukDv_2 | Lantibiotic gallidermin/Leucotoxin LukDv |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
GAAGGCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTATCCTTAACAACAGAAGCTGTTAAAACTACCCGTCTTTTCACAACCAAAGCTACAAAAAAGATGGCTAGTTATTC > USA300TCH1516_ALE/1955573‑1955753 | aaGGCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAg > 2:5727892‑M2/1‑90 (MQ=255) aaGGCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAg < 2:4131710‑M2/91‑2 (MQ=255) aGGCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAgg > 2:4500388‑M2/1‑89 (MQ=255) aGGCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAgg > 1:471296‑M2/1‑89 (MQ=255) aGGCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAgg > 1:394950‑M2/1‑89 (MQ=255) gCTAATTATAAAAATACCTGGCGATTAATAAACTGTTTCCGTTTTTTAGCACTTAATATATTTAAAAAGACAAATAGAGCCCTTTCAggct > 1:1652892‑M2/1‑87 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |